New junction evidence | |||||||||||
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GTTCGACACCCAACTGATGCTGTTTGCCAAGCGGTTAAGTACGCTCGATCTCAACGAAATCAACGCGGCGGATCGCATGGCACAGACGCCAAATAGATTAAAACACGGTCATGTTGATGACGATGCGCTGACCTTTGCCATCTTTACCCACGACGGCAGAATGGTCCTTAATGATGGCGATAACGGAGAAGATATTCCCTATAGCTATCAACGGGAAGGTTTTGCTGACGGGCAACTGGTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATCATCATGATGGTACTACTGGGTCGTGAACT‑CGCGCCGCTGAACAAACTGGCGCTGGCACTACGTATGCGTGACCCTGACTCGGAAAAACCACTAAACGCGACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAA > NC_000913/3170610‑3171151 | gTTCGACACCCAACTGATGCTGTTTGCCAAGCGGTTAAGTACGCTCGATCTCAACGAAATCAACGCGGCGGATCGCATGGCACAGACGCCAAATAGATTAAAACACGGTCATGTTGATGACGATGCGATGACCTTTGCCCTCTTTACCCACGACGGCCGGATGGTCCTTAATGATGGCGATAACGGAGAAGATATTCCCTATAGCCATCAACGGGAAGGTTTTGCGGACGGGCAACTGGTCGGTGAGGACGATCCTTGGGGTTTTGTCTGGTTGACCTCGCCTgatgtc < 1:265213‑M2/289‑7 (MQ=255) 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(MQ=255) tCAACGGGAAGGTTTTGCTGACGGGCAACTGGTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATCATCATGATGGTACTACTGGGTCGTGAACT‑CGCGCCGCTGAACAAACTGGCGCTGGCACTACGTATGCGTGACCCTGACTCGGAAAAACCACTaaa > 2:64578/1‑288 (MQ=255) tCAACGGGAAGGTTTTGCTGACGGGCAACTGGTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATCATCATGATGGTACTACTGGGTCGTGAACT‑CGCGCCGCTGAACAAACTGGCGCTGGCACTACGTATGCGTGACCCTGACTCGGAAAAACCACTAAAc > 1:14307/1‑289 (MQ=255) cGGGAAGGTTTTGCTGACGGGCAACTGGTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATCATCATGATGGTACTACTGGGTCGTGAACT‑CGCGCCGCTGAACAAACTGGCGCTGGCACTACGTATGCGTGACCCTGACTCGGAAAAACCACTAAACGCGa < 2:460086/289‑1 (MQ=255) 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gggCAACTGGTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGc > 1:52399/1‑81 (MQ=255) gggCAACTGGTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGc < 2:52399/81‑1 (MQ=255) gggCAACTGGTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATcatcat > 1:96776/1‑176 (MQ=255) gggCAACTGGTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATcatcat < 2:96776/176‑1 (MQ=255) gCAACTGGTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATCATCATGATGGTACTACTGGGTCGTGAACT‑CGCGCCGCTGAACAAACTGGCGCTGGCACTACGTATGCGTGACCCTGACTCGGAAAAACCACTAAACGCGACTGGCGTACCCAGCGAAGt < 2:387604/288‑1 (MQ=255) gTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATCATCATGATGGTACTACTGGGTCGTGAACT‑CGCGCCGCTGAACAAACTGGCGCTGGCACTACGTATGCGTGACCCTGACTCGGAAAAACCACTAAACGCGACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCa < 2:359916/288‑1 (MQ=255) tCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATCATCATGATGGTACTACTGGGTCGTGAACT‑CGCGCCGCTGAACAAACTGGCCCTGGCACTACGTATGCGTTACCCTGACTCGGAAAAACCACTAAACGCGACTGGCATACCCAGTCAAGTGCGGca > 1:359916/1‑285 (MQ=255) cGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATCATCATGATGGTACTACTGGGTCGTGAACT‑CGCGCCGCTGAACAAACTGGCGCTGGCACTACGTATGCGTGACCCTGACTCGGAAAAACCACTAAACGCGACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTc < 1:64578/288‑1 (MQ=255) ccTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATCATCATGATGGTACTACTGGGTCGTGAACT‑CGCGCCGCTGAACAAACTGGCGCTGGCACTACGTATGCGTGACCCTGACTCGGAAAAACCACTAAACGCCACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACGGGTTGAGGTGCTaa > 1:413077/1‑289 (MQ=255) | GTTCGACACCCAACTGATGCTGTTTGCCAAGCGGTTAAGTACGCTCGATCTCAACGAAATCAACGCGGCGGATCGCATGGCACAGACGCCAAATAGATTAAAACACGGTCATGTTGATGACGATGCGCTGACCTTTGCCATCTTTACCCACGACGGCAGAATGGTCCTTAATGATGGCGATAACGGAGAAGATATTCCCTATAGCTATCAACGGGAAGGTTTTGCTGACGGGCAACTGGTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATCATCATGATGGTACTACTGGGTCGTGAACT‑CGCGCCGCTGAACAAACTGGCGCTGGCACTACGTATGCGTGACCCTGACTCGGAAAAACCACTAAACGCGACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAA > NC_000913/3170610‑3171151 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |