New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2828439 | 52 (1.030) | 3 (0.060) | 3/474 | NT | 6.4% | coding (705/780 nt) | srlD | sorbitol‑6‑phosphate dehydrogenase |
? | NC_000913 | = 2828801 | 37 (0.760) | coding (183/360 nt) | srlM | sorbitol=responsive srl operon transcriptional activator |
CAGCGGAGATCCATTAAGGATCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGAAACGTGGATAATTTCGTTGTGAATGTTACTTGCTTGCGAAGTTATCATTTTGAAACCTAAATCAGGTAATCACG > NC_000913/2828519‑2829041 | cAGCGGAGATCCATTAAGGATCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGCCGCCATCGGGCTGGACGATcagca < 2:253976‑M2/288‑6 (MQ=255) cGGAGATCCATTAAGGATCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTTGAGGCTcagccgccc < 1:59847‑M2/289‑10 (MQ=255) cGGAGATCCATTAAGGATCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCCGCAgcgc > 1:32684/1‑289 (MQ=255) aatgATCTCCGGAGGACTAAAGAATGCCTAATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACAcc < 1:235994/286‑1 (MQ=255) ctcCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGttt > 2:476542/1‑289 (MQ=255) ctcCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGttt > 2:235994/1‑289 (MQ=255) ctcCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGttt > 2:406558/1‑289 (MQ=255) gTGAAACTATGGAATGCCTGATGCGCTACGGTCATCACGCATACAGAACTTCCGCCACGACGTTAAGGAAAAGGTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGa < 1:253976/289‑1 (MQ=255) ggagaCGAAAGAAGCCCTGATGCGCAACGCTCATAAGGCATACAGAACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGGCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGa < 1:155231/287‑1 (MQ=255) taGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGa < 1:476542/289‑1 (MQ=255) taGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGACATCGCGATGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGCCACCTTGTTTCTGCCAGGACTg > 1:293573/1‑288 (MQ=255) gCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAgcgc < 2:355747/252‑1 (MQ=255) gCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAgcgc > 1:355747/1‑252 (MQ=255) gATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCg > 1:173319/1‑288 (MQ=255) gcTACGCTCATCAGGCATACAGTGCGTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGAc < 1:406558/289‑1 (MQ=255) atcaGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGCTCGTGGGCGCCATCCCGCTGGCCGCACAGCACCCCATCGTCGACGCGTGGTTTATTAACGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCTCaaacaa > 1:9493/1‑289 (MQ=255) cAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGACAAGTTGTGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGCCGGCTGGCAAATTTCCCGTTTTCACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCTCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCCTCGACACCTTGTTTATGAACTGACTGACCCTCTTCGCCCGCCCGCCAATCATTCACGCact > 1:111999/1‑287 (MQ=255) aaGGGCTTCCGCCACTACATGAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAAt < 1:331961/288‑1 (MQ=255) catcccGCCAGTCCATGAAGGAAAATTTATGGTATCCGCACTCAGACCCTTAGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTAc < 1:260343/284‑1 (MQ=255) ttCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATcagcagcatattcagcacatcttgataatcgcagccgcgtttgagcggtactttgtcgatgtaatactgctcgacttga < 1:98793‑M2/288‑80 (MQ=255) aaGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCACAAAATTCCCGCAATTACCGTTCTGCATGCGGGTTATTTAcc > 1:126894/1‑288 (MQ=255) aaGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACa < 2:173319/289‑1 (MQ=255) tttGGTATCCGCAGCGATCACCGTGCCCGTTATGGCCTGGTGGGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGcc < 1:198501/286‑1 (MQ=255) tCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCa > 2:218905/1‑187 (MQ=255) tCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCa < 1:218905/187‑1 (MQ=255) tCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGa > 2:347610/1‑289 (MQ=255) tggCCGTAATGGACTGGTGGGCGGAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCATTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGGGGGCGCTTTAACCCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATc < 1:10954/286‑1 (MQ=255) tCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGa < 2:466642/197‑1 (MQ=255) tCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGa > 1:466642/1‑197 (MQ=255) cGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTGCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCa < 2:293573/289‑1 (MQ=255) ccTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGaa < 2:59847/289‑1 (MQ=255) gtgCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGctc < 1:253838/288‑1 (MQ=255) gcgcAACTGGCCTTACGCTGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATcagcagcatattcagcacatcttgataatcgcagccgcgtttgagcggtactttgtcgatgtaatactgctcgacttgatccggtttgatacccagcttggtcgcgtattgtggcaacagtgactggaacatcggcgatttcagcag > 2:283475‑M2/1‑141 (MQ=255) cTTAGGCGGCTGGCAAAGTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACGATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCtt < 2:250467/289‑1 (MQ=255) tttAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGAAACGTGGATAATTTCGt < 2:32684/288‑1 (MQ=255) ttAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATcagcagcatattcagcacatcttgataatcgcagccgcgtttgagcggtactttgtcgatgtaatactgctcgacttgatccggtttgatacccagcttggtcgcgtattgtggcaacagtgactggaacatcggcgatttcagcaggttaccgagcatcagtgaatgcaccgtaatgccgtact > 2:98793‑M2/1‑104 (MQ=255) acTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGGGTTTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGAAACGTGGATAATTTCGTTGTGAATGTTACTTGCTTGCg > 2:460413/1‑289 (MQ=255) 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ttCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGAAACGTGGATAATTTCGTTGTGAATGTTACTTGCTTGCGAAGTTCTCTTTTTGAAACCTAAACCAGGTAATc > 1:86311/1‑289 (MQ=255) cgaccggcaccttAAGCCGCGGGTCGTGGTCGCCATAGCGCTGGACGATCAGCAGCGCAGCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTTACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGAAACGTGGATAATTTCGTTGTGAATGTTACTTGCTTGCGAAGTTATCATTTTGAAACCTAAATCAGGTAATCACg < 1:347610/278‑1 (MQ=255) caggtgccgcCTTAACCCGCGGGTCGTGGTCGCCACCGCGCGGGACGATCAGCGACGCATCGTCCACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGAAACGTGGATAATTTCGTTGTGAATGTTACTTGCTTGCGAAGTTATCATTTTGAAACCTAAATCAGGTAATCACg < 1:460413/282‑1 (MQ=255) cgcTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGAAACGTGGATAATTTCGTTGTGAATGTTAct < 2:443730/238‑1 (MQ=255) cgcTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGAAACGTGGATAATTTCGTTGTGAATGTTAct > 1:443730/1‑238 (MQ=255) gggTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGa < 1:61175/168‑1 (MQ=255) gggTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGa > 2:61175/1‑168 (MQ=255) | CAGCGGAGATCCATTAAGGATCTCCGTGAGACTATAGAATGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCATACAGGACTTCCGCCACTACATTAAGGAAAAGTTATGGTATCCGCACTCATCACCGTCGCCGTTATCGCCTGGTGTGCGCAACTGGCCTTAGGCGGCTGGCAAATTTCTCGTTTTAACCGTGCCTTCGACACACTATGCCAGCAAGGGCGGGTTGGCGTGGGCCGTTCCAGCGGGCGCTTTAAACCGCGGGTCGTGGTCGCCATCGCGCTGGACGATCAGCAGCGCATCGTCGACACCTTGTTTATGAAAGGACTGACCGTCTTCGCCCGACCGCAAAAAATTCCCGCAATTACCGGTATGCATGCGGGTGATTTACAGCCCGATGTGATCTTTCCCCATGATCCACTATCACAGAATGCTCTATCATTGGCGCTTAAACTGAAACGTGGATAATTTCGTTGTGAATGTTACTTGCTTGCGAAGTTATCATTTTGAAACCTAAATCAGGTAATCACG > NC_000913/2828519‑2829041 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |