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tAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCCTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCCGCCGGAGTGAACTCTACGGCTTGAAGCACCTTCGGGCCCCCGTGCTTGTGAacttcccttccgtgttcccttttt > 1:324273/1‑269 (MQ=255) aaGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTGAAGTACTTCCGGGCCACCGTGCTTGTGAAATTCAATTCGTGTTGCCATGTGtc < 2:173029/288‑1 (MQ=255) | GCCACGCGCCCGCTTTTAGCGCGCTCTGCGCTTTTTGCGCGGTTCCTACGGTGCCGATAAGTTTCGCGCCCAGGGCTTTTGCCCACTGGCAGGCAATTAAGCCAACGCCGCCAGCCGCTGCGTGGAACAGGAACTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTGAAGTACTTCCGGGCCACCGTGCTTGTGAAATTCAATTCGTGTTGCCATGTGTC > NC_000913/4263669‑4264235 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |