| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2008566 | 62 (1.230) | 4 (0.080) | 4/474 | NT | 6.2% | coding (290/1206 nt) | yedE | UPF0394 family sulphur transport domain‑containing inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 2008914 | 60 (1.220) | coding (638/1206 nt) | yedE | UPF0394 family sulphur transport domain‑containing inner membrane protein | |||||
TGTCATGGCAGCAATTCAAACACGCCTGGTTGATTAAATTCTGGGCCCCCATCCCTGCGGTCATCGCGGCGGGTATTCTCTCTACTTACTATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCTTCCGTATTCCCGTGAAAATGCAG‑AAAGTTTCTGCCGCCTCACCGCTGACGCAAAAACCGGATCAGG > NC_000913/2008278‑2008853 | tgtcatgGCAGCAATTCAAACACGCCTGGTTGATTAAATTCTGGGCCCCCATCCCTGCGGTCATCGCGGCGGGTATTCTCTCTACTTACTATTTTGGCATTACCGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCGGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTCGCCGCAGCGCTGTG > 1:294904‑M1/1‑289 (MQ=255) attggagcaATTCAAACACGCCTGGTTGATTAAATTCTGGGCCCCCATACCTGCGGGCATCGCGGGGGGTATTCTATCCACTTGCTATTTAGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTAACGGGTGACTGTACCCGTTGGGGCGGCGAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGGCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGAGCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGcc < 1:43899/284‑1 (MQ=255) agcaATTCAAACACGCCTGGTTGATTAAATTCTGGGCCCCCATCCCTGCGGTCATCGCGGCGGGTATTCTCTCTACTTACTATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCcaaca < 1:58721/288‑1 (MQ=255) agATTAAATTGTGTGAGCCCATCCCTGCGGTCATGGCCGCGGGTATTCTCTCTACTGACTATTTTGGAATTACTGGACCCTTTTGGGCTGTGACGGCTGATTTTAACCGTTGGGGCAGCCAGCTCCTGCAACTGGTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAGAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTACCCCGCATCGACGGGATGATGTTCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGGGGGCCAACAATGTCAAGCTGCGAATGCcgcg < 1:62940/288‑1 (MQ=255) accccATCCCTGCGGGCATCGCGGCGGGTATTCGCTCTGCGTACTAGTTTGGCAGTACTGGGACCTTTTGGGCGGTCACGGTTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTGCTGAAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCCGCTGGAAGGATCGCCACTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTGGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCa < 1:173697/287‑1 (MQ=255) cTGCGGTCATCGCGGCGGGTATTCTCTCTACTTACTATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCCTCGACGGGATGATTATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCCGCGATGGTGGCCAACTATGTCACACTGCGAACGCCGCGCCGCCGTATCCGCATTATGCCgg > 1:321592/1‑288 (MQ=255) ggTCATCGCGGCGGGTATTCTCTCTACTTACTATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAACATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGAAGCGCTGGGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCTGTATCCGCATTATGCATGCcagc > 1:170146/1‑287 (MQ=255) 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cATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGTTTTACCCTGCTGCCCATCTTCCGTATTcc > 2:189520/1‑288 (MQ=255) cATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTAGCGCGCGCTTGACCCTGCTGCCCATCTTCTGTATTcc > 2:217517/1‑288 (MQ=255) aCGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTAACGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCt > 2:27654/1‑207 (MQ=255) aCGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTAACGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCt < 1:27654/207‑1 (MQ=255) cGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCTTCCGTATTCCCGTGaa < 2:393339/288‑1 (MQ=255) cGGGATGAGGTTCCTCGGTTTGTGTGGCGGTGGCTCGTCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAAGGGCAAACTGCGATTGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGTCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCTTCCGTATTCCCGTGaa < 1:55118/288‑1 (MQ=255) gatgatCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCTTCCGTATTCCCGTGAAAATGCAg < 2:287855/289‑1 (MQ=255) gTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGGGGCGGTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCCTGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCCGGCGCTTTACCTCGTTGTCCATCTTCCGTATTCACGTGCAAACGCAG‑acactctatg > 1:150434/1‑279 (MQ=255) tATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTTCTGCCCATCTTCCGTATTCCCGTGAAAATGCAGTAAGGTTTCtc > 1:312713/1‑287 (MQ=255) tATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCACGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCTTCCGTATTCCCGTGAAAATGCAG‑AAAGTTTCTgc > 2:381834/1‑288 (MQ=255) tGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCtt > 1:79553/1‑253 (MQ=255) tGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCtt < 2:79553/253‑1 (MQ=255) tttGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCTTCCGTATTCCCGTGAAAATGCAG‑AAAGTTTCTgccgcc > 2:462701/1‑288 (MQ=255) ctgctTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGgcgc < 2:324079/219‑1 (MQ=255) ctgctTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGgcgc > 1:324079/1‑219 (MQ=255) ctgctTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCTTCCGTATTCCCGTGAAAATGCAG‑AAAGTTTCTGCCGCCTCACCGCt < 1:392582/288‑1 (MQ=255) ctgcgTTCCCGCAGCTCTGTCGGCCAACCATCGCAAACTGCGAATGCCGCGCGGCCGTATGCGAATGATGCAGGGCATCATTGGCGGCATGTTCGCCGGTTTTTGAGCGCTTCTGGCATTGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTACTCCTCAATTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCTTCCGTATTCCCGTGAAAATGCAG‑AAAGTTTCTGCCGCCTCACCGCt < 1:252762/288‑1 (MQ=255) gcgcTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCTTCCGTATTCCCGTGAAAATGCAG‑AAAGTTTCTGCCGCCTCCCCGCTGACGCAAAAACCgg > 1:348587/1‑289 (MQ=255) gtgagcagcgcccagcccagcatgccgaaaaagaccagcatcccgagacgaaaacgacgccgcgcctgatccggtttttgcgtcagcggtgaggcggcagaaactttctgcattttcacgggaatacggaagatgggcagcagggtaaagcgcgcgccaaaccatgaaccaatggcagtggcgatggcaaagaaccaggcatgcagcgagaactgaggaataccggtaaagaacgccgccaggttacagcccattgccagacgcgcgccaaaaccggcgataatgccg > 2:170146‑M1/1‑3 (MQ=255) tgagcagcgcccagcccagcatgccgaaaaagaccagcatcccgagacgaaaacgacgccgcgcctgatccggtttttgcgtcagcggtgaggcggcagaaactttctgcattttcacgggaatacggaagatgggcagcagggtaaagcgcgcgccaaaccatgaaccaatggcagtggcgatggcaaagaaccaggcatgcagcgagaactgaggaataccggtaaagaacgccgccaggttacagcccattgccagacgcgcgccaaaaccggcgataatgccgc < 2:335989‑M1/288‑287 (MQ=255) gggCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCTTCCGTATTCCCGTGAAAATGCAG‑AAAGTTTCTGCCGCCTCACCGCTGACGCAAAAACCGGATCAgg < 2:313468/288‑1 (MQ=255) | TGTCATGGCAGCAATTCAAACACGCCTGGTTGATTAAATTCTGGGCCCCCATCCCTGCGGTCATCGCGGCGGGTATTCTCTCTACTTACTATTTTGGCATTACTGGCACCTTTTGGGCTGTCACGGGTGAATTTACCCGTTGGGGCGGCCAGCTCCTGCAACTGTTCGGCGTCCATGCTGAAGAGTGGGGTTACTTTAAAATTATCCATCTGGAAGGATCGCCATTAACCCGCATCGACGGGATGATGATCCTCGGTATGTTTGGCGGCTGCTTTGCCGCAGCGCTGTGGGCCAACAATGTCAAACTGCGAATGCCGCGCAGCCGTATCCGCATTATGCAGGCCATCATTGGCGGCATTATCGCCGGTTTTGGCGCGCGTCTGGCAATGGGCTGTAACCTGGCGGCGTTCTTTACCGGTATTCCTCAGTTCTCGCTGCATGCCTGGTTCTTTGCCATCGCCACTGCCATTGGTTCATGGTTTGGCGCGCGCTTTACCCTGCTGCCCATCTTCCGTATTCCCGTGAAAATGCAG‑AAAGTTTCTGCCGCCTCACCGCTGACGCAAAAACCGGATCAGG > NC_000913/2008278‑2008853 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |