| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 1889488 = | 52 (1.060) | coding (259/1686 nt) | fadD | acyl‑CoA synthetase (long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase) | |||||
CCTGGAATATCGCGCGGGTTAGTGATAAGCAGGTTCTGCCCACCCAGTTCGATAAACAGCAGGCAGTTAATGGTCAGGGCAAAAATGTGATACAGCGGCAGCGCCGTCACCACCAGCTCTTTGCCCGGATGCAACAGCGGACCATAGGTCGCGTTAACCTGTTCCAGGTTCGCCAGCATATTGCGGTGAGTCAGCATCGCGCCTTTCGCCACACCAGTGGTGCCGCCGGTGTATTGCAGAAAAGCTAAATCTTCCGGCACCAGTTCGGGTTTGACGTACTGCATCCGGTAGCCGTTATGCAGTGCGCTACGAAATGAAATGGCATCTGGCAGATGGTATTTCGGCACCAAACGCTTGATGTATTTAACAACGAAATTGACTACCGTGCCTTTTGCCGTAGATAGCTGATCGCCCATACGGGTCAGAATTACGTGCTGAACGGCGGTTTTATCAACCACTTTTTCCAGTGTGTGAGCAAAGTTAGACACGATAACAATCGCCGATGCGCCGCTATCGTTAAGCTGATGCTCAAGCTCACGCGG > NC_000913/1888878‑1889419 | ccTGGAATATCGCGCGGGTTAGTGATAAGCAGGTTCTGCCCACCCAGTTCGATAAACAGCAGGCAGTTAATGGTCAGGGCAAAAATGTGATACAGCGGCAGCGCCGTCACCACCAGCTCTTTGCCCGGATGCAACAGCGGACCATAGGTCGCGTTAACCTGTTCCAGGTTCGCCAGCATATTGCGGTGAGTCAGCATCGCGCCTTTCGCCACACCAGTGGTGCCGCCGGTGTATTGCAGAAAAGCTAAATCTTCCGGCACCAGTTCGGGTTTGACGTACTGCATCCGGt < 2:212209/289‑1 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CCTGGAATATCGCGCGGGTTAGTGATAAGCAGGTTCTGCCCACCCAGTTCGATAAACAGCAGGCAGTTAATGGTCAGGGCAAAAATGTGATACAGCGGCAGCGCCGTCACCACCAGCTCTTTGCCCGGATGCAACAGCGGACCATAGGTCGCGTTAACCTGTTCCAGGTTCGCCAGCATATTGCGGTGAGTCAGCATCGCGCCTTTCGCCACACCAGTGGTGCCGCCGGTGTATTGCAGAAAAGCTAAATCTTCCGGCACCAGTTCGGGTTTGACGTACTGCATCCGGTAGCCGTTATGCAGTGCGCTACGAAATGAAATGGCATCTGGCAGATGGTATTTCGGCACCAAACGCTTGATGTATTTAACAACGAAATTGACTACCGTGCCTTTTGCCGTAGATAGCTGATCGCCCATACGGGTCAGAATTACGTGCTGAACGGCGGTTTTATCAACCACTTTTTCCAGTGTGTGAGCAAAGTTAGACACGATAACAATCGCCGATGCGCCGCTATCGTTAAGCTGATGCTCAAGCTCACGCGG > NC_000913/1888878‑1889419 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |