| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 413,088:1 | +G | 5.9% | coding (2666/3147 nt) | sbcC ← | exonuclease, dsDNA, ATP‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 413,086 | 1 | . | G | 5.9% | 279.1 / 11.5 | 68 | coding (2668/3147 nt) | sbcC | exonuclease, dsDNA, ATP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (32/32); new base G (2/2); total (34/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.33e-01 | |||||||||||
CTTCATCAAGGAACAGCGAGTCAATACGTGTTTTATGGCTGACCAGATCCGAAAGCGCCAGCGCCAGCGCCAGACTAACGAGGAAACTTTCGCCGCCGGAAAGGGTACGGGTATCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTCCACCGTCACAGTGAGAGCCAACCCGTCGTCAGGTCGGTGTTGTTGATGCTGTGCCAGCGTTTCTGCTGTCTGAGTGACCAGAGTTTGCGCCTGACG > NC_000913/412801‑413374 | cTTCATCAAGGAACAGCGAGTCAATACGTGTTTTATGGCTGACCAGATCCGAAAGCGCCAGCGCCAGCGCCAGACTAACGAGGAAACTTTCGCCGCCGGAAAGGGTACGGGTATCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGa < 1:107275/289‑1 (MQ=255) gAACAGCGAGTCAATACGTGTTTTATGGCTGACCAGATCCGAAAGCGCCAGCGCCAGCGCCAGACTAACGAGGAAACTTTCGCCGCCGGAAAGGGTACGGGTATCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGCAcgctggata > 2:31161/1‑281 (MQ=255) gAGTCAATACGTGTTTTATGGCTGACCAGATCCGAAAGCGCCAGCGCCAGCGCCAGACTAACGAGGAAACTTTCGCCGCCGGAAAGGGTACGGGTATCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGCAcgctggatagcg < 1:31161/285‑12 (MQ=255) aCGTGTTTTATGGCTGACCAGATCCGAAAGCGCCAGCGCCAGCGCCAGACTAACGAGGAAACTTTCGCCGCCGGAAAGGGTACGGGTATCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATccc < 1:114243/289‑1 (MQ=255) aCGTGTTTTAAGGCTGACCAGAGCCGAAAGCGCCAGCGCCAGGGCCAGACTCACGAGGAAACTTTCGCCGCCGGAAAGGGTACGGGTATCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATccc < 1:470786/289‑1 (MQ=255) gACCAGATCCGAAAGCGCCAGCGCCAGCGCCAGACTAACGAGGAAACTTTCGCCGCCGGAAAGGGTACGGGTATCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATccc < 2:85827/274‑1 (MQ=255) gACCAGATCCGAAAGCGCCAGCGCCAGCGCCAGACTAACGAGGAAACTTTCGCCGCCGGAAAGGGTACGGGTATCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATccc > 1:85827/1‑274 (MQ=255) aCCAGATCCGAAAGCGCCAGCGCCAGCGCCAGACTAACGAGGAAACTTTCGCCGCCGGAAAGGGTACGGGTATCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACct > 2:202139/1‑286 (MQ=255) aagcagcagcagcagcggcagATGAACAAGGAGACCTGCGACGGCGGTAAGGGTACGGTTATCGCGAACCCAATCTGCCTGCAAAGTATCAACAACCTCTGCTTCCACCGCCTCGCTGTCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTGGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTGGCGGAATGTATCGCCCTCGTT‑GGGACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCACAACCTGCTGCGTCATTTGa < 1:150018/277‑1 (MQ=255) aaGAGCCAGGGCCAGCGCCAGACCAAAGAGGAAACTTTCGCCGCCGGAAAGGGTACGGGTATCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGa < 1:355221/289‑1 (MQ=255) ggTATCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCa > 2:135720/1‑287 (MQ=255) tCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATccc > 1:481277/1‑201 (MQ=255) tCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATccc < 2:481277/201‑1 (MQ=255) tCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCATCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAgct > 2:187845/1‑286 (MQ=255) cgTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGc < 2:198590/289‑1 (MQ=255) tACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGa > 2:410854/1‑289 (MQ=255) cGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCAGCCTTCTTCAGCCTCTGTCGaa > 1:198590/1‑287 (MQ=255) tCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACg < 2:391716/251‑1 (MQ=255) tCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACg > 1:391716/1‑251 (MQ=255) cctgccAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCtt > 1:98326/1‑288 (MQ=255) ccAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTc > 2:203526/1‑289 (MQ=255) ccTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTttg < 2:211302/217‑1 (MQ=255) ccTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTttg > 1:211302/1‑217 (MQ=255) ccTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCAc > 1:85396/1‑288 (MQ=255) cTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTTGGGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCAc > 2:245889/1‑288 (MQ=255) cTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTTGGGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCAc > 2:36123/1‑288 (MQ=255) cTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACg > 1:423955/1‑288 (MQ=255) tCGGCTTCGAGCGCCTCGCTTGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTTGGGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGc < 1:245889/289‑1 (MQ=255) tCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTTGGGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGc < 1:36123/289‑1 (MQ=255) cGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCaa < 1:410854/289‑1 (MQ=255) gcgcCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTg > 2:459664/1‑289 (MQ=255) gcCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGt < 2:85396/286‑1 (MQ=255) cttggCTGGCTTTGCGCTGTAGC‑GAAAGGGGCCGGGCCGGCGGGTAAGTTGCTGGATAGCCAGAAGGACCAAAGTAACCAGCGTCCGCCCCTGGGCAAACTTGCCGAAATTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGtt < 1:22078/285‑1 (MQ=255) ccTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGt < 1:459664/289‑1 (MQ=255) tAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGa > 2:279173/1‑289 (MQ=255) aGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCt > 2:175027/1‑288 (MQ=255) aGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCt > 2:231833/1‑288 (MQ=255) 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(MQ=255) cgcCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTtg > 2:465852/1‑158 (MQ=255) cgcCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTtg < 1:465852/158‑1 (MQ=255) cgcCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTTTTTTCACGCCACTTTTGGTTAGTTTGGCCTAACTCTTGCTGAATTCGCTcc > 1:270372/1‑288 (MQ=255) cgcCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTcc > 2:88112/1‑288 (MQ=255) gcCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTCCa < 2:98326/288‑1 (MQ=255) gcCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTCCa < 2:146419/288‑1 (MQ=255) cccGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTCCAcc > 2:446144/1‑289 (MQ=255) cGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTCCACCGt < 1:135720/289‑1 (MQ=255) tGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTCCACCGTc > 1:494317/1‑288 (MQ=255) gCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTCCACCGTca < 1:202139/288‑1 (MQ=255) agaTGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTCCACCGTCACAGTGAGAGCCAACCCGTCGTCAGGt < 1:203526/288‑1 (MQ=255) aaaTTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTCCACCGTCACAGTGAGAGCCAACCCGTCGTCAGGTCGGTgttgtt < 2:423955/289‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTCCACCGTCACAGTGAGAGCCAACCCGTCGTCAGGTCGGTGTTGTTGAt > 2:283759/1‑286 (MQ=255) cGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCt > 1:79057/1‑214 (MQ=255) cGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCt < 2:79057/214‑1 (MQ=255) cGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTCCACCGTCACAGTGAGAGCCAACCCGTCGTCAGGTCGgt > 2:324678/1‑272 (MQ=255) 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CTTCATCAAGGAACAGCGAGTCAATACGTGTTTTATGGCTGACCAGATCCGAAAGCGCCAGCGCCAGCGCCAGACTAACGAGGAAACTTTCGCCGCCGGAAAGGGTACGGGTATCGCGTACCGCATCTGCCTGCCAGGTATCAACAACCTCGACTTCCAGCGCCTCGCTGGCTTTGCGCTGTAACAGATAGCGCCCGTGCAGCCGGGTAAGTTGCTGATTAGCGAGATGGACTAAATTATCCAGCGTCAGCCCCTGGGCAAACTTGCGGAATTTATCGCCCTCTTT‑GGAACCTATTAGCGAATTCAGATATCCCCAGTCCTCAACCTGCTGCGTCATTTGAGCAATTTGCTGCATTAAGGTTTGTTGTTGCTGACGGTTATCTGCATCCTGCTTCAGCTGCTGGCGAATCTCGCCTTGACTCGTGGTGTTTTCACGCAACTTTTGGTGAGTTTGCGCTAACTCTTGCTGAATCTGCTCCACCGTCACAGTGAGAGCCAACCCGTCGTCAGGTCGGTGTTGTTGATGCTGTGCCAGCGTTTCTGCTGTCTGAGTGACCAGAGTTTGCGCCTGACG > NC_000913/412801‑413374 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |