Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,572,447 | A→T | 2.9% | pseudogene (33/1503 nt) | yjiT → | pseudogene |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,572,447 | 0 | A | T | 2.9% | 501.3 / 2.6 | 139 | pseudogene (33/1503 nt) | yjiT | pseudogene |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (64/70); new base T (2/2); total (66/73) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.40e-01 |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
AATACTTTTTGATTGTTTGAGATTTATTTTCATTTGAAATTATAAAATCAGGTGATAAATGAGTTGTGATTAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTACCGCAGGGATTATGAACGGCAATGCGGATGGACGTGGGACCCTATATATAAAAAAATAGGGATTTCATTCACCG > NC_000913/4572179‑4572718 | aaTACTTTTTGATTGTTTGAGATTTATTTTCATTTGAAATTATAAAATCAGGTGATAAATGAGTTGTGATTAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATCTTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTgg > 1:1169362/1‑281 (MQ=255) tGTTTGAGATTTATTTTCATTTTAAATTATAAAATCAGGTGATAAATGAGTTGTGATTAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTTTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTtgt < 1:709606/282‑1 (MQ=255) ttatttTCATTTGAAATTATAAAATCATGTGATAAATGAGTTGTGATTAATAAATGGTTGCTATCATTTTTATCTAAAATTTATTTATAGTATCGACCTGAAAACATAGTTATTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTAGAGTTTTGTTATTGTATCTTTTATCTCTAAGGGGCTTGATTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGATTCTTaga < 2:1991255/282‑1 (MQ=255) ttatttTCATTTGAAATTATAAAATCAGGTGATAAATGAGTTGTGATTAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTaga < 2:297210/282‑1 (MQ=255) ttGAAATTATAAAATCAGGTGATAAATGAGTTGTGATTAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGAc < 2:928484/282‑1 (MQ=255) aaaTGAGTTGTGATTAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTAt > 1:1725482/1‑282 (MQ=255) gtgATTAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGcc > 2:1236928/1‑262 (MQ=255) aTTAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCa > 2:1247693/1‑282 (MQ=255) ttAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCaa > 2:577594/1‑282 (MQ=255) ggTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTc > 2:1338055/1‑199 (MQ=255) ggTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCa < 2:431475/268‑1 (MQ=255) tATCTAAATTTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCTTGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCAAATTaa > 2:1074031/1‑282 (MQ=255) tATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGGGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTaa < 1:1727566/282‑1 (MQ=255) tATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTaa < 1:1247693/282‑1 (MQ=255) tATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACGATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTaa < 2:1169362/282‑1 (MQ=255) aTCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTc > 2:292184/1‑236 (MQ=255) aTCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTc < 1:292184/236‑1 (MQ=255) aTTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGc > 1:1802638/1‑244 (MQ=255) aTTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGc < 2:1802638/244‑1 (MQ=255) ataGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAatga > 2:1111787/1‑249 (MQ=255) ataGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAatga < 1:1111787/249‑1 (MQ=255) tATCGACCTTAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATAAAATATTATGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTTGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGTGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAAACTTAGAGGGTTGAAACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGt < 2:736082/281‑1 (MQ=255) tCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTAt < 1:1522201/223‑1 (MQ=255) tCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCgg > 1:72710/1‑282 (MQ=255) aCCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTAt < 1:1624255/220‑1 (MQ=255) aCCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTAt > 2:1624255/1‑220 (MQ=255) gAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTg < 2:955840/268‑1 (MQ=255) gAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTg > 1:955840/1‑268 (MQ=255) aaaaaaTAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGCATATACCCAATTAACGTAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATcaa > 1:1343523/1‑281 (MQ=255) aaaaaTAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATcaca < 1:96097/282‑1 (MQ=255) aaaTAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAAt < 1:577594/282‑1 (MQ=255) tAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTa < 2:72710/282‑1 (MQ=255) aGTTGTTGCCGCCTAGGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAATGTTGAGATGTGGTGGGGTTTTGTTTTTGTAGTTTTTATCGCTGAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAATGGTACTTCCTGGCGAAGTAAGTTTGTGAGTCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCTTGCAGTCGGTCAATCACAAt < 1:1565615/278‑1 (MQ=255) tgtttCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGaa < 1:518606/229‑1 (MQ=255) tgttgCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATca < 2:1288415/271‑1 (MQ=255) tgttgCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATca > 1:1288415/1‑271 (MQ=255) tgttgCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTCTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAATTGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGAAAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCTACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACACTcca > 2:1565615/1‑276 (MQ=255) taagggacaggAGGAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAATGGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATTCATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAATAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAatat < 1:785326/271‑1 (MQ=255) gccTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACaa < 1:278694/267‑1 (MQ=255) cTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAatg > 1:1318696/1‑215 (MQ=255) cTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAAATTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTAGCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGTTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAata < 2:469370/272‑1 (MQ=255) aGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGATATGTTGTGGGGTTCTGTTTTTGTATCTTTTATAGCTAAGGAGCTTGCTTTGGGCCAATCAGAATACATTTAATGGGTAAAATGTCCTTCTTGGCTAAGTTACTTTGTGCACCTTAGAGGGTTGATACAACCGGATGCCCGTTCTCTTTATGAATATCATAGAACCAATGATGAATATCCCAAACTAACGCAGATACGCCGTCAAGCAGGTAAATCACAATCTCATAAATATCATAggca > 1:469370/1‑280 (MQ=255) cAATATTCTGATAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTCGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTATGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACACTATAATTTATGTAATAgggctgtctctgat > 2:785326/1‑271 (MQ=255) tCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCCTGCTTTGGGTCACTCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTCCTTCATGGCTAAGTAACATTGTGAACCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGTCCGTCCTCGTTATGAATATCATGCAACCACAGATGAATATACTCAATCTACTCAGCTACTCCGTGCATTCGGTCac > 2:764744/1‑239 (MQ=255) tGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAATTGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGt > 2:1302047/1‑282 (MQ=255) tGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGAc > 2:814197/1‑152 (MQ=255) tGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGAc < 1:814197/152‑1 (MQ=255) tGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGa > 1:72201/1‑159 (MQ=255) tGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTaa > 2:932957/1‑212 (MQ=255) tGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGAAACCAATGATGAATATAACCAATTAAGGCAGCTACACCGTGCAGTCGGTAAATCAAAATCTAATAAATTTAATAGGGACTTTGGTGCCTGGTTTGt > 2:1086007/1‑282 (MQ=255) tGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAACGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTcc < 1:9251/168‑1 (MQ=255) tGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAACGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTcc > 2:9251/1‑168 (MQ=255) gAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGtt < 2:1343523/282‑1 (MQ=255) aaaGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAAc < 1:1311786/187‑1 (MQ=255) aaaGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAAc > 2:1311786/1‑187 (MQ=255) aaaGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCACAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAAATTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCACCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATATAATATATGTACTAGGGACTTTGCTCCCGGTTTTGtt > 2:1369208/1‑281 (MQ=255) aaGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGtt > 1:1049622/1‑280 (MQ=255) ttttCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTa > 1:1866171/1‑241 (MQ=255) tttctttcAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTaa > 1:15313/1‑204 (MQ=255) ttctttcAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTATAAGGAGATTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGACTCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGTAACCAATGATGAATATACCCAATTAAACCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACCTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTg > 2:1522282/1‑282 (MQ=255) tctttcAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTAt < 2:1557253/165‑1 (MQ=255) ctttcAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAATTGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGct < 1:1302047/282‑1 (MQ=255) aaaTTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGGTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAg < 2:1530823/282‑1 (MQ=255) tttttttttgtttgcttgagatgtAAGGAGCTTGCTTTTGGTCAATCAGTATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAGCTTTGTGAGTCTGAGAGGGTTAAGACAACCAGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTGCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATGTATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTATTGCTCTGAGTGGTACCGCAGGGATTATGaa < 1:1074031/259‑1 (MQ=255) tttgtttttgtATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTACCGCAGGAATTATGaa < 2:1049622/282‑1 (MQ=255) ttgtttttgtATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTACCGCAGGGATTATGaa > 2:1983300/1‑281 (MQ=255) tttttgtATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATca < 2:1948514/200‑1 (MQ=255) ttttATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGt < 1:1030357/184‑1 (MQ=255) ttttATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAatatat > 1:1973866/1‑203 (MQ=255) ctctAAGGAGCTTGCTGTGGGTCAATCAGAAAACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTGTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCACTCCTCTTAAGGAATATCAGGCAACCAAAGATGAAtata < 1:888831/146‑1 (MQ=255) ctAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTaa < 2:1434328/153‑1 (MQ=255) ctAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTaa > 1:1434328/1‑153 (MQ=255) tAAGGAGCTTGCTTTGGGACAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATAccc > 2:888831/1‑146 (MQ=255) gAGCTNGCTNTNNGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTGAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTc < 1:1433108/172‑1 (MQ=255) cttgcttTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGt > 1:553170/1‑164 (MQ=255) cttgcttTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGt < 2:553170/164‑1 (MQ=255) cttgcttTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAAt > 2:1433108/1‑172 (MQ=255) cttgcttTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACaa > 1:1946425/1‑177 (MQ=255) cttgcttTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACaa < 2:1946425/177‑1 (MQ=255) cttgcttTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCtttt > 1:930149/1‑221 (MQ=255) cttgcttTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGct < 1:1584916/226‑1 (MQ=255) cttgcttTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGct > 2:1584916/1‑226 (MQ=255) cttgcttTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAACCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCg < 2:507689/158‑1 (MQ=255) aaTCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGCATTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTGGCTCTGGGTgg > 1:1204739/1‑221 (MQ=255) aTCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAAt < 2:1424057/178‑1 (MQ=255) aTCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAAt > 1:1424057/1‑178 (MQ=255) aaTACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATca > 2:179516/1‑155 (MQ=255) tttCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAat < 2:23906/158‑1 (MQ=255) tttCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAat > 1:23906/1‑158 (MQ=255) ttCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATca > 2:189603/1‑148 (MQ=255) ttCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATca < 1:189603/148‑1 (MQ=255) tCATGGGTAAACTGTAATTCCGGGCTAAGTAACGTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTGATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACATTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGGGGTACCGAAGGGATTATGAACGGCAATGCGGATGGACGTGGGACCCTATATAGAAAAAAATAGGGATTTCATTCAc < 1:1369208/281‑1 (MQ=255) aTGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTa > 2:1486127/1‑152 (MQ=255) aTGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTa < 1:1486127/152‑1 (MQ=255) aTGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGct > 2:1624914/1‑197 (MQ=255) aTGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTACCGCAGGGATTATGAACGGCAATGCGGATGGACGTGGGACCCTATATATAAAAAAATAGGGATTTCATTCACCg > 1:454051/1‑281 (MQ=255) cgggTAAAATTGACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATAGTAGTGGGTTGAGCTAACCTGATGGCCGGCCTCTTTATGAATATTAAGCAACCAATGATGAATCTACCAAATTAACGCATCTACTCCTTGCAGTCGGTCAATCACAAGCTAATATTTGTAATATGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCCCTGAGTGGTACCGCATGGATTATGAACGGCAATGCGGATGGACGTg < 1:1523403/241‑1 (MQ=255) gTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGt < 2:1454160/46‑1 (MQ=255) gTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGt > 1:1454160/1‑46 (MQ=255) gTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAGTATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTAGGTCAATCACAATCTAATATATGTCATCGGGACTTTGATGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTATGAGTGGTACCGCATGGATTATGAACGGCAATGCGGATGGACGTggta > 2:1523403/1‑240 (MQ=255) | AATACTTTTTGATTGTTTGAGATTTATTTTCATTTGAAATTATAAAATCAGGTGATAAATGAGTTGTGATTAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTACCGCAGGGATTATGAACGGCAATGCGGATGGACGTGGGACCCTATATATAAAAAAATAGGGATTTCATTCACCG > NC_000913/4572179‑4572718 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |