| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 3,676,833 | Δ3 bp | intergenic (‑26/+155) | dctA ← / ← yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3676832 | 4 (0.030) | 112 (0.950) | 78/292 | 0.5 | 97.0% | intergenic (‑25/+158) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| ? | CP009273 | 3676836 = | 3 (0.030) | intergenic (‑29/+154) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GCCGTCGCCAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTT > CP009273/3676688‑3676982 | gaagccgtcgccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagt > 2:130027‑M2/149‑149 (MQ=255)gaagccgtcgccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaagaccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagt > 2:325682‑M2/149‑149 (MQ=255) ccgtcgccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTa > 2:905181‑M2/145‑149 (MQ=255) ccgtcgccaagcggtttcatttgatcgcatatttaaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTa > 2:1094420‑M2/145‑149 (MQ=255) gtcgccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAg > 2:1727993‑M2/143‑149 (MQ=255) gtcgccaagcggtttcatttgctcgcctatgtcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAg < 2:31326‑M2/7‑1 (MQ=255) tcgccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAgg < 2:1474800‑M2/8‑1 (MQ=255) gccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTa > 1:771361‑M2/140‑144 (MQ=255) ccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTa > 2:1149336‑M2/139‑149 (MQ=255) gcggtttcatttgctcgcctatttccggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATggg < 2:97054‑M2/15‑1 (MQ=255) gcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATggg < 2:733414‑M2/15‑1 (MQ=255) tttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggcgcatctacaagactagcgctgtcagaacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaacaccacagTTGTAGGGTTATGGGGTAc > 2:963048‑M2/131‑149 (MQ=255) tttcatttgcgcgcccatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagagtttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTAc < 2:1412578‑M2/19‑1 (MQ=255) ttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaattgctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgccctttagtaaaaccacagTTGTAAAGGTATGGGGTAcc > 2:167354‑M2/130‑149 (MQ=255) ctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCt < 2:1566644‑M2/28‑1 (MQ=255) ctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctagcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggtcttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGc < 1:994070‑M2/23‑1 (MQ=255) tcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCg < 1:851534‑M2/24‑1 (MQ=255) tcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCg > 1:5411‑M2/121‑144 (MQ=255) tcgcctatttcaggatagaaatggccaagcagaataccaatggctatcgctgtgaggacctcaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGCGTACCTGCGGCCtt > 2:1212615‑M2/121‑149 (MQ=255) ctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCt < 1:709090‑M2/28‑1 (MQ=255) tttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTaa > 1:1054622‑M2/114‑144 (MQ=255) ttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAac < 2:328733‑M2/37‑1 (MQ=255) tcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggcgtactttattaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAaca < 2:389692‑M2/38‑1 (MQ=255) tacgcatagaaatggtcaaggagaataccaacggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaatgcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTaaaa < 1:152025‑M2/33‑1 (MQ=255) ataggaatggccaaggagaataccaatgggtatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGTGTACCTGCGGCCTTAAAATAaca < 1:915705‑M2/38‑1 (MQ=255) aaaTGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGGTTTCAGAGGGTGTCCTTTAGTAAA‑‑CTC‑CTTAAAGTAACTGAATGGGGTACGTGCTGCCTCAAAATAACACCCAGacaa > 2:944860/1‑149 (MQ=255) agaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGac < 2:1973985‑M2/45‑1 (MQ=255) aaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcagagggtgtcctttagtaaaaccacagTGGTAAGGTGATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCa < 1:1739550‑M2/42‑1 (MQ=255) atggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGacaaca < 2:1857383‑M2/49‑1 (MQ=255) atggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGa < 1:1049786‑M2/44‑1 (MQ=255) ggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGaca < 1:665099‑M2/46‑1 (MQ=255) ccaaggagcataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcatttacaacaaggacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATcac > 2:1444467‑M2/97‑149 (MQ=255) ccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAaacaac > 1:719848‑M2/97‑144 (MQ=255) cagggggaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGacaaca < 1:818279‑M2/49‑1 (MQ=255) caaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGacaaca > 1:1390532‑M2/96‑144 (MQ=255) caaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATcaca > 2:1396949‑M2/96‑149 (MQ=255) gagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggtactcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGaaa > 2:172124‑M2/92‑149 (MQ=255) accaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttacacagagaagttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTAcc > 2:1368413‑M2/86‑149 (MQ=255) caatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTg < 2:1626682‑M2/66‑1 (MQ=255) caatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTGGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTCAAATAACACCCAGacaacatcacaagaattt > 1:41163‑M2/84‑137 (MQ=255) caatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagagtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCATACAGCATCAcagaaaaaa > 1:61464‑M2/84‑141 (MQ=255) ggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATc > 2:693493‑M2/80‑149 (MQ=255) gctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGCAATGTACCTAGATCa > 2:1764932‑M2/79‑149 (MQ=255) taacgcagccaagacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaagttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGCGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAAGTACCGGGa < 1:1784732‑M2/68‑1 (MQ=255) atcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGAt < 1:1677127‑M2/69‑1 (MQ=255) tcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATc < 1:393689‑M2/70‑1 (MQ=255) cgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAAtt < 2:1696843‑M2/76‑1 (MQ=255) tgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGaa < 2:1041044‑M2/79‑1 (MQ=255) gtcaggacctgaaagttaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGaaa < 2:935016‑M2/80‑1 (MQ=255) gtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacacagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTTCCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGaaa < 2:1332771‑M2/80‑1 (MQ=255) tcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTTAAATAACACCCAGACAACAGCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAAc > 2:1787010‑M2/69‑149 (MQ=255) tcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAAtt > 1:1498899‑M2/69‑144 (MQ=255) tcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAAc > 2:1786906‑M2/69‑149 (MQ=255) tcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAAc > 2:1107714‑M2/69‑149 (MQ=255) aggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATAACAGAAAGGTACCTGGATCATAATTGAAACaa > 2:408746‑M2/67‑149 (MQ=255) gacctgaaagtaaaggcttttaaacagggaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGAGGCCTTAAAATAACTCCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGaaa < 1:305353‑M2/80‑1 (MQ=255) acctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACaaaaa < 2:6324‑M2/86‑1 (MQ=255) tgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGt > 2:1707317‑M2/61‑149 (MQ=255) aaGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAG‑‑‑TTGTAAGGTTAAGGAGTCACTGAAATGGTGCAAGACCACACACACTGTATCACAGAAATGTCCCTTAATCATAATTGAAACAAAAAg < 1:390732/144‑1 (MQ=255) caaatcaaaggcttttaaacagagaggtttgcctagggtgtcccttattaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACATAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACaaaa < 1:1075836‑M2/85‑1 (MQ=255) aaagggaagggtgttaaactgagaggttttcatagggtgtcctttagcaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTa < 2:778723‑M2/91‑1 (MQ=255) taaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTaaaaa > 2:542710‑M2/55‑149 (MQ=255) aaggcttttaaacagagaggttttcatcgggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACGTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATGGAAGCAAAAAGGTTAAAAAGt > 2:1061725‑M2/53‑149 (MQ=255) aaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaataccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAACCAAAAAGGTTAAAAAGt > 2:285006‑M2/53‑149 (MQ=255) aaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGCCAACATCACAGAAATGTACCTGGCTCATAATTTAAACAGAAAGGTTACACAGt > 2:502408‑M2/53‑149 (MQ=255) aggcgtttaaacagagaggttttcatagggtgaaatatagaaaaaccacagTAGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTTGATCAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTaaa < 1:536040‑M2/93‑1 (MQ=255) ggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaacaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGttt < 2:77755‑M2/99‑1 (MQ=255) ggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATACTTGAAACAAAAAGGTTaaaa > 1:1540542‑M2/51‑144 (MQ=255) cgtttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGa < 2:345592‑M2/101‑1 (MQ=255) ttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGt < 1:692948‑M2/97‑1 (MQ=255) ttaaacagagaggttttgatagggtgtcctttagtaaaacaacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTGAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATGGAAACAAAAAGGTTAAAAAGttt < 1:1109633‑M2/99‑1 (MQ=255) gagaaGTATTAATAGGAAGACGTTTAATAAATCCACAGG‑‑‑TGTAAGGTGAAGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCAAAGACATGTACCTGGATAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTgg < 1:918907/144‑1 (MQ=255) acagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCt > 2:452809‑M2/42‑149 (MQ=255) agagaggttttcataggttgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTg < 1:300228‑M2/105‑1 (MQ=255) gagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTgg < 1:918768‑M2/106‑1 (MQ=255) ggtgttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCg < 1:84271‑M2/110‑1 (MQ=255) agttttcaaagagtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTAGGGGGTACCTGCGGCCATAAAATAACACGCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCg < 1:1839995‑M2/110‑1 (MQ=255) gttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTAGCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTAAGCTGGCTCGCACaaa > 2:1118482‑M2/34‑149 (MQ=255) gttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGc > 1:1410483‑M2/34‑144 (MQ=255) tagggtgtcgtttggtaaaaccacagGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGTCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCAc < 2:1521062‑M2/123‑1 (MQ=255) agggtgtcctttagtaaaaccacagTTGGAAGGTTATGGGTTACCTGCGGCCTGAAAATAACACCCAGACAACATTACAGAAATGTACCTGGATCATAAGTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCa < 1:51537‑M2/119‑1 (MQ=255) gtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACt < 1:712248‑M2/124‑1 (MQ=255) ctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACtttt > 1:717082‑M2/18‑144 (MQ=255) ctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACtttt > 1:716819‑M2/18‑144 (MQ=255) tttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACttttt > 1:686349‑M2/17‑144 (MQ=255) ttcagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGt > 2:699760‑M2/17‑149 (MQ=255) tgtagtaaagccgcagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGATCACATCACAGAAATGGACCTGGATCAGAATTGATACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACttttt < 1:726341‑M2/128‑1 (MQ=255) tagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTaa < 1:118510‑M2/130‑1 (MQ=255) agtaaaaccacagGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtttt < 2:722434‑M2/136‑1 (MQ=255) taaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGCAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAATTTGGGCTGGCTCGCCCAAAACAGCCCTGTTAAAAGt > 1:61482‑M2/12‑144 (MQ=255) taaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGt > 2:1553402‑M2/12‑149 (MQ=255) taaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGCTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGt > 1:1189848‑M2/12‑144 (MQ=255) aaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGttt > 1:237903‑M2/10‑144 (MQ=255) ccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCACACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGt > 1:588070‑M2/7‑144 (MQ=255) cacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAg < 2:520949‑M2/144‑1 (MQ=255) cacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTAAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTa > 1:32409‑M2/6‑144 (MQ=255) cacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATCTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAACAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTa > 1:1148118‑M2/6‑144 (MQ=255) acagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGGTCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGt > 2:1501003‑M2/5‑149 (MQ=255) acagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGAAAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCCCACAAACCAGCACTTATTAAAGTTTTGTaa > 1:1401411‑M2/5‑144 (MQ=255) agTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGttt > 2:830684‑M2/3‑149 (MQ=255) | GCCGTCGCCAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTT > CP009273/3676688‑3676982 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |