| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 3,676,860:1 | (GGTACCTGCGG)1→2 | 95.2% | intergenic (‑53/+130) | dctA ← / ← yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3676847 | 3 (0.120) | 58 (2.370) +GGGGTACCTGC |
47/228 | NT | 95.2% | intergenic (‑40/+143) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| ? | CP009273 | 3676848 = | 3 (0.110) | intergenic (‑41/+142) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase | |||||
TTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3676703‑3676847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTT > CP009273/3676848‑3676995 ||||||||||| TTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAACACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGG > 2:115310/1‑149 ATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTCAGGTCATGGAGTACC > 1:435048/1‑149 TCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGG < 2:299760/149‑1 ATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGATGATTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCT < 2:376199/149‑1 TTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGGTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTG > 1:414875/1‑149 cgcgagtgcgAAGGAGAATACCAATGGCTCGCGCTGTCAGGACCTGAGAGTAAAGGCTTTTAAACAGGGAGGTGTTCATGGGGTGTCCTGTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAA < 2:302953/139‑1 GAAATGGCCAAGGAGAATACCAAGGGCTATCGCTGTCAGGACCTGTAACTAGAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGCCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAA < 1:13469/149‑1 AAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAA > 1:315167/1‑149 AAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGGTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTGAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTGCCTGCGGCCGTGAAA > 1:391040/1‑149 TGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGCCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAA < 2:256321/149‑1 CCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAACATAACAC > 1:435245/1‑149 CCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACAC > 2:45892/1‑149 CCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACAC < 1:405121/149‑1 caaggtgtcTACCAATGGCTATCGCGGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCATGTAAGGTTATGGGGTAGCTGCGGGGGACCTGCGGGCGTAAAATAAGACC > 2:311040/10‑149 CAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACC > 1:86266/1‑149 CAAGGAAAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTCTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTATCTGCAGGGTACCTGCGGCCTTAAAATCACACg > 2:406961/1‑148 AGGAGAATACCCATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCA < 2:426919/149‑1 AGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCA > 1:250701/1‑149 GAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAGACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGA > 1:334678/1‑149 GAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGA > 2:434320/1‑149 AATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAA > 2:260712/1‑149 CAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGCGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCCGACAACATCA < 1:137791/149‑1 CAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACACCA > 2:246584/1‑149 aagGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCAC < 1:377253/146‑1 ATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACA < 1:449171/149‑1 TATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAT < 1:444745/149‑1 TATCGCTGCCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAACACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGTGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAT < 1:142566/149‑1 CTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACC > 1:264723/1‑149 TCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTCTGGCGTGCCTTCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAAAACCCAGACAAAATCACAGAAATGTACCTGG > 1:109550/1‑149 TCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGG > 1:452415/1‑149 TCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGG > 1:452436/1‑149 AGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGAT < 1:210813/149‑1 AGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGAT < 1:135179/149‑1 AGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGAT > 1:165751/1‑149 GAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATT > 2:18613/1‑149 GAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATT < 1:468573/149‑1 AAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCCGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCGTAATTG > 1:403926/1‑149 TAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAAC > 2:256810/1‑149 GCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAA > 2:236443/1‑149 TTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGG > 1:417916/1‑149 TTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGa > 1:263389/1‑148 TTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGGCAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTT < 1:390650/149‑1 ACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGGTAATAATTGAAACAAAAAGGATAAAA > 1:2325/1‑149 GAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGT < 2:26023/149‑1 AGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTT < 1:45892/149‑1 GAGGTTTGCATAAGGTTGCCTTTAGTAAAACAAAATGTATTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCATAGAAATGTACCTGGATTATAATTAAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTT < 2:406648/149‑1 AGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGTTATCTGCGGCCTTAAAATAACAGCCAGACAACATCACAGGAAGGTACCTGGAGCATAATTGAACCAAAGAGGTTAAAACGTTTG > 2:375500/1‑149 TAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTC > 2:109214/1‑149 GGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATCACACCCAGACAACATCACAGCAATGTACCTGGATCATCATTGAAACAAAAAGGGTAAAAAGTTTTAGTTGGCTCGgt > 2:16637/1‑147 TCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGCAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACGTCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAA < 1:287413/149‑1 CTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTAGCTGAGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTACGCTGGCTCGCACAAACC > 1:366116/1‑149 TTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTAGCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGGTCATAATTGACACACCAAGCATAAAAAGATTGAGCTGGCTCGCACAAACCA > 1:242889/1‑149 TTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAACGGTTCAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACCAACCA > 2:394789/1‑149 TTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCA > 2:296550/1‑149 AGTAAAGCCACATGTCTTGTAAGGGTATGGGGTACGTGAGGGGTACCTGCGGCCATAAAATAACACCCAGAGAACATCACAGAAATGTACTTGGATCAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCA < 2:245888/149‑1 GTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCAC > 1:116230/1‑149 TAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACT > 1:3717/1‑149 ACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAA > 1:428388/1‑149 TCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTT < 2:86266/149‑1 TGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAAACAGCACTTTTTCAAGTTTTGTA > 2:269641/1‑149 AAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTATTTAAAGTTTTGTAATC > 1:239036/1‑149 AGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACTTCCCAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCA > 1:441862/1‑149 AGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCCCAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGGTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCA > 2:142490/1‑149 GTTAGGGCGTACCTGCGGGGCACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGGGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGT < 2:119967/149‑1 GGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAACTAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGCTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGG < 1:314149/149‑1 GTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGCGCTGGCTCGCCCAAGCCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTc > 1:142507/1‑148 gcaCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAAGAACACCCAGATAACATCACAGAAATGTACCTGGATCAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAG < 2:13464/146‑1 TGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTAC > 2:246185/1‑149 GCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACT > 1:10579/1‑149 CGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTT < 1:401976/149‑1 ||||||||||| TTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3676703‑3676847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTT > CP009273/3676848‑3676995 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |