| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2507756 = | NA (NA) | 131 (1.190) | 94/284 | 0.0 | 94.4% | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL1 | nucleoside (except guanosine) transporter/IS186 transposase |
| ? | CP009273 | = 3052017 | 8 (0.070) | intergenic (‑248/+8) | serA/rpiA | D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/ribose 5‑phosphate isomerase, constitutive | |||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
ATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCGTTTTCCATCGCTATCGGGTCAAGGATTTCCAT > CP009273/3051869‑3052165 | aTGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCC > 1:754684‑M2/1‑149 (MQ=255) ttGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCata < 1:869225‑M2/149‑4 (MQ=255) tGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATACGCTGTGTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataa > 1:526850‑M2/1‑145 (MQ=255) acaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTcccc > 2:667124‑M2/132‑143 (MQ=255) gAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGACTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAAGGAAGAGAATCATTTTAACGCGGGAGGTTccccct > 2:429438/1‑142 (MQ=255) gAAATATCACGCAAAGGTAATTCTGGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgc > 1:516119‑M2/1‑141 (MQ=255) aggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGAt < 1:669207‑M2/20‑1 (MQ=255) aaaTATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTTCCCataagcgct < 1:512308‑M2/149‑10 (MQ=255) tggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGCCAGACCAt > 1:124495‑M2/127‑149 (MQ=255) cACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgct > 2:45194‑M2/1‑134 (MQ=255) attcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTcac > 1:1108946‑M2/122‑149 (MQ=255) cGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaa < 2:480055‑M2/143‑12 (MQ=255) cAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaact > 2:30600‑M2/1‑130 (MQ=255) gTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtg > 1:1731130‑M2/1‑125 (MQ=255) agtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaccgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGa < 1:923687‑M2/39‑1 (MQ=255) tccctgaccgcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATtgttgt < 2:728789‑M2/37‑3 (MQ=255) tGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacg < 1:982227‑M2/149‑33 (MQ=255) cctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGt > 1:1225507‑M2/105‑149 (MQ=255) gATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgac < 1:430428‑M2/149‑35 (MQ=255) ctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCCTTTCACAATGGTTTTGac > 2:1519627‑M2/104‑143 (MQ=255) tGAATATGCTGGGTTAGAGGATTTATTTAGAGCAAGCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctg > 1:1844307‑M2/1‑113 (MQ=255) gAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattac > 2:1667564‑M2/1‑112 (MQ=255) tGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga > 1:1746973‑M2/1‑107 (MQ=255) ctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGc < 1:711980‑M2/54‑1 (MQ=255) ctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGc < 1:1075830‑M2/54‑1 (MQ=255) gCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctga < 2:320066‑M2/143‑38 (MQ=255) caaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCaa > 1:1258282‑M2/93‑149 (MQ=255) aaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGgttttgacacctgacggtgt < 2:1719220‑M2/52‑10 (MQ=255) aaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttacGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGgtgt < 2:1322685‑M2/52‑1 (MQ=255) tttAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga > 2:1609035‑M2/1‑101 (MQ=255) gagGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgc > 1:864832‑M2/1‑97 (MQ=255) caattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttgagttagcgcttatGGGAGGTTCACACGTCAGCTCATTTCGCTATGGTTTTGTCACCTTTAGGTGTGCCAAt < 2:1020794‑M2/58‑1 (MQ=255) aattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATc > 2:592201‑M2/85‑143 (MQ=255) ttgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAAc > 1:210230‑M2/83‑149 (MQ=255) tgaagaacgcgaggcattgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggtgcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAgc < 2:922529‑M2/62‑1 (MQ=255) ttttttaGAGCAATCGACAATTGGCTTGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATGTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgc > 2:1452027‑M2/1‑91 (MQ=255) ttatttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatga > 1:1901259‑M2/1‑91 (MQ=255) aagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGccaatcgacgc > 2:468332‑M2/80‑138 (MQ=255) gcacgcgagtcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaactcttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACCATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCaa < 2:956892‑M2/66‑1 (MQ=255) aattagaGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGCCACCAATTTTGTTGAAAAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTTCCCataagcgctaacttgagggttgtggtagtacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaat > 1:445093‑M2/3‑89 (MQ=255) aacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAAc < 2:1745952‑M2/67‑1 (MQ=255) gcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGcc > 1:630115‑M2/74‑149 (MQ=255) agCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaat > 2:787440‑M2/1‑83 (MQ=255) cAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGCAGCATGTCCCGATACTTAAGGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgactta > 2:791855‑M2/1‑81 (MQ=255) aaTCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattgaacgtgccgatgaattactctcac > 1:1417639‑M2/1‑80 (MQ=255) catcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacgcttacgttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCACCGTCCGCGcc > 2:1089859‑M2/68‑143 (MQ=255) catcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTAcgcgca > 2:1263225‑M2/68‑142 (MQ=255) aTCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGTTTCCCCataagcgctgacttaaggtttgtgggattacgtctgatatggtttaacgtgccgctgaattcat < 2:510129‑M2/143‑65 (MQ=255) ttgacAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactc < 2:887320‑M2/141‑66 (MQ=255) tCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacga < 1:77546‑M2/149‑72 (MQ=255) cgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCTAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGc < 1:1000273‑M2/85‑1 (MQ=255) aaTTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataact < 1:386684‑M2/149‑77 (MQ=255) gaggcaccgaggcgtcgcatgctgcagatggttcaacccttaagttagcggttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGcc < 1:728955‑M2/94‑1 (MQ=255) cTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcag < 1:324240‑M2/149‑83 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCa > 1:779671‑M2/55‑149 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACaa > 2:1429619‑M2/53‑143 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACaa < 2:1629058‑M2/91‑1 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTCCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACaa < 2:1054077‑M2/91‑1 (MQ=255) accgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGc < 2:1032731‑M2/93‑1 (MQ=255) ccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGcc < 2:1584540‑M2/94‑1 (MQ=255) cGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggc > 1:1365975‑M2/1‑57 (MQ=255) tcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCGTTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGc > 1:1012988‑M2/42‑149 (MQ=255) cgcattcttcggatggttcaacccttaagttcgcgcttaaGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTcac < 2:691326‑M2/103‑1 (MQ=255) cacaTGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgccggatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccata > 1:1584937‑M2/1‑52 (MQ=255) caTGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt > 1:1536369‑M2/1‑50 (MQ=255) aTGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattgaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattg > 1:1213239‑M2/1‑49 (MQ=255) gTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccat < 2:1423955‑M2/143‑97 (MQ=255) cttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAGTGGTTTTGTTACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACACCAggagt > 1:306461‑M2/35‑147 (MQ=255) ttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATc > 1:904034‑M2/34‑149 (MQ=255) aCCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt < 2:1735551‑M2/143‑100 (MQ=255) ccAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacgtaaggggtgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagc < 1:1314227‑M2/149‑107 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCa < 1:1645148‑M2/119‑1 (MQ=255) agatggtgcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAAGGGTTTTGACACCGCCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGa < 2:295483‑M2/113‑1 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGaa < 2:841160‑M2/114‑1 (MQ=255) atggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCAtt > 1:35484‑M2/29‑149 (MQ=255) tggttcaacccttaagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATc > 2:274283‑M2/28‑143 (MQ=255) tGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaact > 1:1181413‑M2/1‑33 (MQ=255) tGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccga > 2:1149940‑M2/1‑33 (MQ=255) agagAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactgga < 1:521316‑M2/149‑120 (MQ=255) gagaATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgaggcaaaacgcttgttgggatttcagttgtcgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagccccaagaa < 2:630957‑M2/143‑115 (MQ=255) taagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCg > 2:1349285‑M2/16‑143 (MQ=255) taagttagcgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCg > 2:1636211‑M2/16‑143 (MQ=255) gaATTTTGTTAACGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaact > 2:1002298‑M2/1‑27 (MQ=255) tttttttAACGGGGGAGGTTACCCataataaatgggttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggaccatattggtaagcccgaagaactgag < 2:1706096‑M2/143‑120 (MQ=255) ttagcgcttatGGGAGGCTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCGtttt < 2:507302‑M2/132‑1 (MQ=255) cgcttatGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCGTTTTCCAt > 2:352502‑M2/8‑143 (MQ=255) aCGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgctatgatttaacgtgccgatgggttactctcacgataactggtcagcaattctggcccagattggtaagcccgaagcactggatacctccg < 2:1491365‑M2/143‑128 (MQ=255) aCGGGGGAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcgg > 2:819460‑M2/1‑16 (MQ=255) gggggAGGTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggca > 2:548487‑M2/1‑14 (MQ=255) gggAGGTTCCCACGTAAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGAAAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGACCGCGACACGATTGGCAAACAAGCCAAACGTCACCACCCCATGAATCGCATATATGGCGTTTTCCATCGCTATc > 2:623581/1‑143 (MQ=255) ggTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgccggg < 1:1759644‑M2/149‑142 (MQ=255) gTTCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgccgggg > 1:1482099‑M2/1‑7 (MQ=255) tCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcactaaatgcc < 2:185383‑M2/143‑139 (MQ=255) tCCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatggc < 2:180088‑M2/143‑139 (MQ=255) ccccGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCGCCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCGTTTTCCATCGCTATCGGGTCAAGGATTTcc > 1:28789/1‑149 (MQ=255) cccattagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgccgg > 2:1282498‑M2/1‑3 (MQ=255) ccataagcgcgaacgtaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgccggggctcta > 1:582506‑M2/1‑2 (MQ=255) cataggcgctaacttaagggttgtggtattacgactgatatggtttaacgggcggatgaattactctcacggtaactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgccgggg > 2:372431‑M2/1‑1 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataacgggtcagcaatgctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgccggggctctaa > 1:1498422‑M2/1‑1 (MQ=255) cataagcgctaacgtaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgccgggg > 2:760648‑M2/1‑1 (MQ=255) | ATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAAACAAGCCAACAGTCACCACGCCAGGAATCGCATTTATGGCGTTTTCCATCGCTATCGGGTCAAGGATTTCCAT > CP009273/3051869‑3052165 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |