| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2269346 | 10 (0.090) | 121 (1.080) | 81/290 | 0.3 | 92.4% | coding (595/1026 nt) | yejE | microcin C transporter YejABEF, permease subunit; ABC family |
| ? | CP009273 | 3576788 = | NA (NA) | intergenic (+10/‑55) | yrhA/insA | pseudogene, interrupted by IS1E/IS1 repressor TnpA | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TGACTCTCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2269200‑2269346‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTC > CP009273/3576788‑3576935 TGACTCTCTGGTCCAGCGGGATGGGCGGGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGG < 1:523785/149‑1 GACTCTCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGT < 1:190761/149‑1 CTCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTGTTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATG < 1:1100447/149‑1 CTCTGTTCCAGCGTGAGGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGG < 2:697942/143‑1 TCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGC > 1:432812/1‑149 TCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGG > 2:1003986/1‑143 ggTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGC < 1:612269/147‑1 GTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGC < 1:948768/149‑1 gCCAGCGTGAGGGGCGTGCGGGGGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATG < 2:813412/142‑1 CAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAGGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTATTTGATTATTTTACTTTCCCGCGTCGGGGTATGCTGCCAAC > 1:525731/1‑149 CAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCT < 2:1322584/143‑1 AGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGCCAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTGTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGGGATCCTG > 2:366030/1‑143 AGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTG > 2:1060350/1‑143 GCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTT > 1:389887/1‑149 GCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAAATT > 1:390190/1‑149 CGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTc > 1:769369/1‑148 GTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGCTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:1556129/1‑149 GGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTA < 2:866916/143‑1 GGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTCTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTA < 2:402715/143‑1 GGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCGACTTAC > 2:491371/1‑143 GCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:1482597/149‑1 GCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGACCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:1333052/149‑1 TGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 2:510407/143‑1 GGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:737281/149‑1 GGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGGCGGGGATGCCGGCGCTGTGTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCGGCCAACTTACgcatatggagt > 2:27125/1‑132 GGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGGTTTAGTGTATG > 2:294661/1‑143 GGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTAGATCTAAGACAACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTCTTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCACCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 1:460513/1‑149 GCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 1:1111928/149‑1 CGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTATTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT < 1:1173527/149‑1 AAGGCTATTACGGCGGTAATGTCGAGCTCTGTGGACAACGCTTTATTGAAGTCTGGTCGGGGATGGTCAAGCTGTTGTTGACTTTTTTGCTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:1872927/149‑1 GCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTGTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 1:368925/149‑1 TATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGTTGTTTTTGA < 2:210300/143‑1 ATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTCTGccagtacctgtgtg < 2:880956/143‑15 TTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGACGTATGGTCGGGCATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCATCGGGTGATGCTGGCAACGTACTGACGTGGTGTAGGATGGTGTTTTTGGGG > 2:1154989/1‑143 GGCGGTCAAGTCGAACTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT > 2:210987/1‑143 GTAAAGTCGATCTCTGGGGACATCGCATTATTGAAGTATACTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATTATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCACTGGCTT > 1:462858/1‑149 GTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG > 2:620944/1‑143 TCGATCTCTGGGGAGAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCCGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 1:1889498/149‑1 TCGATCTCTGGGGACAACGCTGTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGCTTTTGATTATTTTACTTTCCCGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACGGATTTAGTGTATGATGGTGTTTATGCGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 1:956349/149‑1 TCGATCTCTGGGGACAACGCCTTATTGAAGTATGGTCGGGGATTCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTACGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 1:875393/149‑1 GATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT > 1:751496/1‑149 ATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 1:881141/149‑1 ATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGGGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTc > 1:179158/1‑148 CTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 2:486286/1‑143 CTGGCGACAACGCTTTATTGTAGTACGGTCGGGGCTGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATGTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 1:25021/149‑1 GGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCTGCGTCGGTTGGTGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 2:1055627/143‑1 GGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTTTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT > 2:287291/1‑143 GGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 1:647948/149‑1 tACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA > 2:1169545/2‑143 ACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 2:256712/143‑1 AACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT > 1:1555860/1‑149 CGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 1:1359913/1‑149 CGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 1:523340/1‑149 CTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC < 2:563384/143‑1 CTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC < 2:358993/143‑1 CTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC < 2:358705/143‑1 TTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTGCCTCCTGT > 1:824920/1‑149 TTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATAAGCTCTCCCTCCTGT > 1:1532593/1‑149 TATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC < 2:1735835/143‑1 ATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTGTCAGCTGTCCCTCCTGTTCA > 1:564602/1‑149 ATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA < 1:703429/149‑1 ATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCGGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCCGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTTTCCCTCCGGTTCA > 1:268385/1‑149 TTGCAGTATTGTCGGGGATGCGGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTCCCATCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGTTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT < 2:645387/143‑1 TTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT < 2:935014/143‑1 TTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT > 2:1734895/1‑143 TTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTATTTTGATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTCATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGCTTCTATCAGCTGTCCCTCCT > 2:1246902/1‑143 acGTATGCTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT < 2:861644/141‑1 AAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTTTCAACTGTCCCACCTGTT > 2:20759/1‑143 GTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < 1:603507/149‑1 GTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGG < 1:1040413/149‑1 TCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT > 2:1134228/1‑143 CGGGTATGCCTACGCNGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGG < 1:1768763/149‑1 TGCCGGAGCTGGTTTTGATTATTTTGCTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGTTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGC < 1:537150/149‑1 GCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGGGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCCGCTACTGACGGGGTGGGGCG > 1:248779/1‑149 CCGACGCTGGTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT < 1:320286/149‑1 CGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTCCTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTCTCAGCTGTCCCTCCTGTCCCGCCCCTGACGGCGTGG > 2:1163795/1‑143 ggCGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAA < 1:869065/147‑1 ACGGTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAAC < 1:1428693/149‑1 GCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGG > 1:1657051/1‑149 GCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCG < 2:520044/143‑1 TGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGGGGTGCGTAACGGCA > 1:1695674/1‑149 ttgTTGATTATTTTACGTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGGTTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAAC < 2:1360580/140‑1 TTTTGTTTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACG < 2:945240/143‑1 TTTTCATTATTTTACTTCCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAA < 1:229916/149‑1 TGATTATTTTCCTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTCGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTTTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCA < 1:733777/149‑1 TGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCA > 2:1411997/1‑143 GATTATTTTACTTTCCAGCGGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCGGTGCAGCTACTGACGGGGTGGGGCGTAGCGGCca > 2:955535/1‑141 TTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCG > 2:557786/1‑143 TTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCG > 2:86919/1‑143 TTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCATGGTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATC > 1:364069/1‑149 TTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGGGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCG > 2:261244/1‑143 TTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGG > 2:1372551/1‑143 TCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAGGCACCGCCGGACATCAG > 1:891757/1‑149 CAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAGGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG > 1:284169/1‑149 GCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGGACCGCCGGACAgc > 2:927833/1‑141 GCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCT > 1:635939/1‑149 CGTCGGGTGATTCTGCTCACCTACTGATTTATTGTTTGGTGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCTTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGGGTATCGGCAAAAGCACCGCCGGACATCA < 2:262648/143‑1 TCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATC > 1:117719/1‑149 TCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATC > 1:266113/1‑149 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCACCCACTAGCGGGGTGGTGCGTAACGGCAAACGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTC > 1:364620/1‑149 TGACTCTCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2269200‑2269346‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTC > CP009273/3576788‑3576935 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |