| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | CP009273 | 542,271 | IS5 (–) +4 bp | coding (136‑139/1668 nt) | fdrA → | putative NAD(P)‑binding acyl‑CoA synthetase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP009273 | 269666 = | NA (NA) | 25 (0.590) | 23/296 | 1.0 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
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| * | ? | CP009273 | = 270860 | NA (NA) | 62 (1.460) | 47/296 | 0.0 | 100% | noncoding (320/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | CP009273 | 542271 = | 0 (0.000) | coding (136/1668 nt) | fdrA | putative NAD(P)‑binding acyl‑CoA synthetase | |||||
AGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTC‑AGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAGCGGCGGATGCGGGGATCGCGCAGGCGATTATGCAGCAGCTTGAAGAGGCGCTAAAACAACTGGCGCAGGGG > CP009273/542126‑542420 | aGGAGTTTTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGG‑GTTTTCTAGGATGTGGTCATTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTACGTAATGATGGCTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAg < 2:323139/149‑1 (MQ=255) ggattggttATGATCCACGCCTGTATTAAAAAAGGGTGTTTGT‑AGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAgg < 1:315757/143‑2 (MQ=255) gacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAg < 2:282656‑M2/4‑1 (MQ=255) aGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTC‑AGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGAGGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGgga > 1:654400‑M2/1‑146 (MQ=255) gttgttATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTC‑AGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGggaa > 1:520661‑M2/1‑145 (MQ=255) tATGATCCCCGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTC‑AGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCGAATAAAGCGTTATTAGggaaggtgc > 1:348668‑M2/1‑140 (MQ=255) aTGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTC‑AGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTAAGCGAATCAGAAAATGATGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGggcaggggcg < 2:308631‑M2/149‑11 (MQ=255) tctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATAc < 1:54332‑M2/8‑1 (MQ=255) tctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATAc > 2:54332‑M2/136‑143 (MQ=255) tcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATACCACAGGtt > 2:482361‑M2/134‑149 (MQ=255) tttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgacccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATACCACAGGTTTCt < 1:693302‑M2/19‑1 (MQ=255) cACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTC‑AGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGggaaggtgcgaataag < 2:282743‑M2/149‑17 (MQ=255) ttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATACCACAGGTTTCTg < 1:544348‑M2/20‑1 (MQ=255) 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ttgttcgcaccttccTTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAGCGGCGGATGCGGGGATCGCGCAGGCGATTATGCAGCAGCTTGAAGAGGGGCTaaa > 2:169037‑M2/16‑149 (MQ=255) ttgttcgcaccttccTTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAGCGGCGGATGCGGGGATCGCGCAGGCGATTATGCAGCAGCTTGAAGAGGCGCTaaa < 1:471022‑M2/134‑1 (MQ=255) aTAAAGCGTTATTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttaggccgtttcttcgccatttaaggcgg < 2:642350‑M2/149‑135 (MQ=255) cgcaccttccTTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAGCGGCGGATGCGGGGATCGCGCAGGCGATTATGCAGCAGCTTGAAGAGGCGCTAAaacaac < 1:390930‑M2/139‑1 (MQ=255) cgcaccttccTTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAGCGGCGGATGCGGGGATCGCGCAGGCGATTATGCAGCAGCTTGAAGAGGCGCTAAaacaac > 1:168481‑M2/11‑149 (MQ=255) gcaccttccTTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAGCTGCGGATGCGGGGATCGCGCAGGCGATTATGCAGCAGCTTGAAGAGGCGCTAAAACAACt > 2:499756‑M2/10‑149 (MQ=255) ccttccTTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAGCGGCGGATGCGGGGATCGCGCAGGCGATTATGCAGCAGCTTGAAGAGGGGCTAAAACAACGGgc > 2:199404‑M2/7‑149 (MQ=255) ttccTTAGGTACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAGCGGCGGATGCGGGGATCGCGCAGGCGATTATGCAGCAGCTTGAAGAGGCGCTAAAACAACTGgcgc < 2:82021‑M2/145‑1 (MQ=255) cTTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAGCGGCGGATGCGGGGATCGCGCAGGCGATTATGCAGCAGCTTGAAGAGGCGCTAAAACAACGGGCGCAgg > 1:283785‑M2/2‑149 (MQ=255) gtaGATACCACAGGTTTCGGGCATGACGATTTTAAGAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAGCGGCGGATGCGGGGATCGCGCAGGCGATTATGCAGCAGCTTGAAGAGGCGCTAAAACAACTGGCGCAggg < 1:499642/148‑1 (MQ=255) taGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAGCGGCGGATGCGGGGATCGCGCAGGCGATTATGCAGCAGCTTGACGAGGCGCTAAAACAACTGGCGCAgggg > 1:484374/1‑149 (MQ=255) | AGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTC‑AGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAGCGGCGGATGCGGGGATCGCGCAGGCGATTATGCAGCAGCTTGAAGAGGCGCTAAAACAACTGGCGCAGGGG > CP009273/542126‑542420 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |