| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3576788 = | NA (NA) | 91 (1.390) | 64/292 | 0.0 | 95.8% | intergenic (+10/‑55) | yrhA/insA | pseudogene, interrupted by IS1E/IS1 repressor TnpA |
| ? | CP009273 | = 3649852 | 4 (0.060) | coding (249/333 nt) | hdeA | stress response protein acid‑resistance protein | |||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
TTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTCCACAGCCAGGAAATCTTCACAGGTCCAGGAGTT > CP009273/3649704‑3649998 | ttttAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCGTGTTGATCTGGAGTACAAGCCTGAACg > 1:1005196/1‑149 (MQ=255) aagaagATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtga < 1:1009885‑M2/149‑6 (MQ=255) aagaagATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtga > 1:73648‑M2/1‑144 (MQ=255) agaagaTATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTGAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGg < 2:591458‑M2/144‑2 (MQ=255) gaagaTATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatg < 1:296725‑M2/149‑8 (MQ=255) gaagaTATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTGTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGATTACAAGCCTGAACGgg < 2:586681‑M2/144‑3 (MQ=255) ctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTgg > 1:634341‑M2/133‑149 (MQ=255) ctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTgg > 1:552582‑M2/133‑149 (MQ=255) aagaTATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggt < 2:229371‑M2/144‑4 (MQ=255) ttCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaa > 1:646260‑M2/1‑135 (MQ=255) ctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTAc > 1:158774‑M2/127‑149 (MQ=255) cGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgcc < 2:297003‑M2/144‑13 (MQ=255) ggCCTGTTCAATATGCAAGGAACTACTATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgcca > 2:403935‑M2/1‑131 (MQ=255) gcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTg > 1:432302‑M2/122‑149 (MQ=255) gcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCATGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTg < 1:562861‑M2/28‑1 (MQ=255) gCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaa > 2:1001539‑M2/1‑130 (MQ=255) tGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactga < 1:1076229‑M2/149‑23 (MQ=255) tGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGgggggtgctgccaacttgctgt < 1:880089‑M2/149‑23 (MQ=255) cacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgatctcaaaatcggtggagctgcctgaaaaagtcatcgggcattataagaacatgaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAAt > 1:821943‑M2/118‑149 (MQ=255) accgggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTg < 2:928111‑M2/28‑1 (MQ=255) cggggacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagcggcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATAcc < 1:447299‑M2/35‑1 (MQ=255) acggctgggacggaagtcgcggtcgttctcaatatcggtggagcttcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataatttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATAcc < 2:503967‑M2/35‑1 (MQ=255) gCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTCAACGggtgatgctgcccacttactgctttactgttt < 1:875179‑M2/149‑33 (MQ=255) ggctgtgacggaagtcgctgtcgttcacaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggaggcattgccGCCTGAAAGATAGTTGGGGGCACGGTTGCAATACCCt > 2:899942‑M2/108‑144 (MQ=255) cAAGGTAGTACGATGTAACGCATTCCCGGACTTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagt > 2:969734‑M2/1‑116 (MQ=255) cAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagt > 2:19257‑M2/1‑116 (MQ=255) ggcgggagtcgcagtcgttctcaaagtcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACAt < 2:1028665‑M2/43‑1 (MQ=255) cGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 1:913040‑M2/149‑44 (MQ=255) tcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCAtc > 1:320425‑M2/94‑149 (MQ=255) gTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAACTTCGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt > 2:515410‑M2/1‑102 (MQ=255) aaCGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggt < 1:907184‑M2/149‑50 (MQ=255) cATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctc > 1:450062‑M2/1‑96 (MQ=255) cATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctc > 1:179545‑M2/1‑96 (MQ=255) ttCCCGGAATTACATATTTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg > 2:474536‑M2/1‑94 (MQ=255) gttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCAtcttc < 2:494504‑M2/59‑1 (MQ=255) gttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactataaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAAGACCCTGAACATCTAAAACCGCAtcttc > 2:186903‑M2/86‑144 (MQ=255) tCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgc > 2:298252‑M2/1‑93 (MQ=255) ccGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAAGTTTGTCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGTACGggtgctgctgccaacttactgatttagtgtatgatgttgtgtttgaggttctt < 2:108729‑M2/144‑54 (MQ=255) ggAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc > 1:377038‑M2/1‑89 (MQ=255) caaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGtt > 2:945109‑M2/81‑144 (MQ=255) caaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaagaagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCt > 1:861079‑M2/81‑149 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCtt > 1:607736‑M2/80‑149 (MQ=255) tcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTttgtt < 1:665600‑M2/74‑1 (MQ=255) 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ttAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgcccctcctgttcagctactgacggggtggtgc < 1:411668‑M2/149‑111 (MQ=255) aacactatcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAgg > 2:772597‑M2/30‑144 (MQ=255) aaGTTGGCTTGTTTCTGGTGAGGAGAGGCCTGAACGggtgaggctgcctacttactgatttagtttagtatggtgtttttgaggggctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgtcggtgtggt > 2:713162‑M2/1‑36 (MQ=255) tcaataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGACCATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGGGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTc > 2:756521‑M2/23‑144 (MQ=255) caataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACAACTAAAACCGCATCATATGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTcc > 2:702933‑M2/22‑144 (MQ=255) cTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaac < 2:875378‑M2/144‑116 (MQ=255) aataagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTCCACAGcc > 1:461875‑M2/21‑149 (MQ=255) tGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagggtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcacctactgacggggtggtgcgtaacgg < 2:157849‑M2/144‑118 (MQ=255) gTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggc > 2:309782‑M2/1‑26 (MQ=255) aagttggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTCCACAGCCAgg > 1:212002‑M2/18‑149 (MQ=255) tttATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtggtgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttatgagatgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagc < 1:687349‑M2/149‑125 (MQ=255) tttATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcggctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagc < 1:840286‑M2/149‑125 (MQ=255) gttggagtcattaccGCCTGAACGCTAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTCCACAGCCAGGaa > 1:834126‑M2/16‑149 (MQ=255) tATCCTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaa > 2:269313‑M2/1‑23 (MQ=255) ggagtcattaccGCCTGAACGATAGCTGGGATTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTGGGCTGGAAGGATTCGTCCACAGCCACGCAATc > 1:585403‑M2/13‑149 (MQ=255) cTGAGTACAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagca < 2:686970‑M2/144‑126 (MQ=255) gaccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACGGGAGTTGGCCGGAAGGATTAGTCCACAGCCAGGAAATCTTc < 2:674744‑M2/140‑1 (MQ=255) gccGCCGGAACGATAGCTTGGGTTACTGTTGCAATTCCCTGAACATCTAAACCCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTCCACAGCCAGGAAATCTTca < 2:224096‑M2/141‑1 (MQ=255) cAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatc > 1:100207‑M2/1‑12 (MQ=255) cAAGCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaagtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaacagcaccgccggacata < 1:658016‑M2/149‑138 (MQ=255) ccGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTCCACAGCCAGGAAATCTTCACAGGTc < 1:840354‑M2/147‑1 (MQ=255) cGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTCCACAGCCAGGAAATCTTCACAGGTcc < 1:355657‑M2/148‑1 (MQ=255) gCCTGAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggaca < 2:348364‑M2/144‑136 (MQ=255) gCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTCCACAGCCAGGAAATCTTCACAg < 2:388596/144‑1 (MQ=255) cctaaCGAGAGCGGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTCCACAGCCAGGAAATCTTCACAGGt < 2:497401/141‑1 (MQ=255) gAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacgtcaa < 2:212479‑M2/144‑140 (MQ=255) aCGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACCTCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTCCACAGCCAGGAAATCTTCACAGGTCCAGGAGtt < 1:67975/149‑1 (MQ=255) | TTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTGCAGTTGGCTGGAAGGATTCGTCCACAGCCAGGAAATCTTCACAGGTCCAGGAGTT > CP009273/3649704‑3649998 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |