New junction evidence | |||||||||||
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AAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTCCGGCGCGGCGTTTGGCGTGGTGTTGATGCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCAGGCAAGTGGTGACCCGCGAATGGCGCAAGTGCTGACCTGGATTTCCGGTTCGACCTACAACGCGACCGATGCGCAGGTCTGGCGCACCGGAATTGTGATGGTGATTTTGCTGGCGATTACCCCGCTGTGCCGCCGCTGGCTGACCATTTTACCGCTGGGTGGTGATACCGCCCGAGCCGTAGGAATGGCGCTGACGCCGACGCGAATTGCGCTGCTGCTGTTAGCGGCTTGCCTGACGGCGACCGCGACGATGACTATTGGACCGTTGAGTTTTGTTGGTTTAATGGCACCGCATATTGCGCGGATGATGGGCTTTCGACGGACGATGCCACA > NC_000913/172721‑173287 | aaGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTCCGGCGCGGCGTTTGGCGTGGTGTTGATGCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCAGGCAAGTGGTGACCCGCGAATGGCGCAAGTGCTGACCTGGATTTCCGGTTCGAcc < 1:455095/289‑1 (MQ=255) 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tgTTGCAGGCAAGTGGTGACCCGCGAATGGCGCAAGTGCTGACCTGGATTTCCGGTTCGACCTACAACGCGACCGATGCGCAGGTCTGGCGCACCGGAATTGTGATGGTGATTTTGCTGGCGATTACCCCGCTGTGCCGCCGCTGGCTGACCATTTTACCGCTGGGTGGTGATACCGCCCGAGCCGTAGGAATGGCGCTGACGCCGACGCGAATTGCGCTGCTGCTGTTAGCGGCTTGCCTGACGGCGACCGcgacg > 1:676373/1‑257 (MQ=255) tgTTGCAGGCAAGTGGTGACCCGCGAATGGCGCAAGTGCTGACCTGGATTTCCGGTTCGACCTACAACGCGACCGATGCGCAGGTCTGGCGCACCGGAATTGTGATGGTGATTTTGCTGGCGATTACCCCGCTGTGCCGCCGCTGGCTGACCATTTTACCGCTGGGTGGTGATACCGCCCGAGCCGTAGGAATGGCGCTGACGCCGACGCGAATTGCGCTGCTGCTGTTAGCGGCTTGCCTGACGGCGACCGcgacg < 2:676373/257‑1 (MQ=255) tGCAGGCAAGTGGTGACCCGCGAATGGCGCAAGTGCTGACCTGGATTTCCGGTTCGACCTACAACGCGACCGATGCGCAGGTCTGGCGCACCGGAATTGTGATGGTGATTTTGCTGGCGATTACCCCGCTGTGCCGCCGCTGGCTGACCATTTTACCGCTGGGTGGTGATACCGCCCGAGCCGTAGGAATGGCGCTGACGCCGACGCGAATTGCGCTGCTGCTGTTAGCGGCTTGCCTGACGGCGACCGCGACGATGACTATTGGACCGTTGAGTTTTGTTGGTTTaa < 1:4523/288‑1 (MQ=255) 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AAGCCCGGAAGTGCTGGGGATTAGCTCCGGCGCGGCGTTTGGCGTGGTGTTGATGCTGTTTCTGGTGCCGGGTAATGCCTTTGGCTGGCTGTTACCTGCAGGCAGTCTCGGCGCGGCGGTGACGCTGTTGATCATTATGATCGCCGCCGGCCGCGGTGGATTTTCCCCACACCGTATGTTACTGGCGGGGATGGCGTTAAGCACCGCGTTCACCATGCTTTTGATGATGTTGCAGGCAAGTGGTGACCCGCGAATGGCGCAAGTGCTGACCTGGATTTCCGGTTCGACCTACAACGCGACCGATGCGCAGGTCTGGCGCACCGGAATTGTGATGGTGATTTTGCTGGCGATTACCCCGCTGTGCCGCCGCTGGCTGACCATTTTACCGCTGGGTGGTGATACCGCCCGAGCCGTAGGAATGGCGCTGACGCCGACGCGAATTGCGCTGCTGCTGTTAGCGGCTTGCCTGACGGCGACCGCGACGATGACTATTGGACCGTTGAGTTTTGTTGGTTTAATGGCACCGCATATTGCGCGGATGATGGGCTTTCGACGGACGATGCCACA > NC_000913/172721‑173287 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |