New junction evidence | |||||||||||
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ATTGCTGATGGGGATTTTGCCGAAAAGGTGGTCGCGGTTGTTCTTCCGGTGAATGCTGCCATGGTGGTTACGTTGCAATATTCCGTGGGCCGCCGACTTAACCCGGCTAACATCCGCGCGCTGATGACAGCAGGCACCCTCTGTTTCGTCATCGGTCTGGTCGGTTTTATTTTTTCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGCAGCCCGCGCTTTGTTGATTTAAGTCGAACACAATAAAGATTTAATTCAGCCTTCGTTTAGGTTACCTCTGCTAATATCTTTCTC > NC_000913/1622037‑1622586 | aTTGCTGATGGGGATTTTGCCGAAAAGGTGGTCGCGGTTGTTCTTCCGGTGAATGCTGCCATGGTGGTTACGTTGCAATATTCCGTGGGCCGCCGACTTAACCCGGCTAACATCCGCGCGCTGATGACAGCAGGCACCCTCTGTTTCGTCATCGGTCTGGTCGGTTTTATTTTTTCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGa > 2:477062/1‑289 (MQ=255) 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cGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGCAGCCCGCGCTTTGTTGATTTAAGTCGAACACAATAAAGATTTAATTCAGCCTTCGTTTAGGTTACct < 1:149532/289‑1 (MQ=255) ggCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGt > 1:84028/1‑178 (MQ=255) ggCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGt < 2:84028/178‑1 (MQ=255) gtgattgaCCATATTGCGCCAGCAGAAATGAAAGCCAGCGATTTTTCCGGCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCTTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGCGCAAGACCGTGGGGGCAGCCCGCGCTTTGTTGATTTAAGTCGAACACAATAAAGATTTAATTCAGCCTTCGTTTAGGTTACCTCTGCTAATATCttt < 2:359842/288‑1 (MQ=255) attgaCCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCTTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGCAGCCCGCGCTTTGTTGATTTAAGTCGAACACAATAAAGATTTAATTCAGCCTTCGTTTAGGTTACCTCTGCTAATATCTTtctc > 1:359842/1‑289 (MQ=255) attgaCCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGt > 2:244988/1‑149 (MQ=255) attgaCCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGt < 1:244988/149‑1 (MQ=255) ccgccAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGCAGCCCGCGCTTTGTTGATTTAAGTCGAACACAATAAAGATTTAATTCAGCCTTCGTTTAGGt < 2:174587/252‑1 (MQ=255) ccgccAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGCAGCCCGCGCTTTGTTGATTTAAGTCGAACACAATAAAGATTTAATTCAGCCTTCGTTTAGGt > 1:174587/1‑252 (MQ=255) | ATTGCTGATGGGGATTTTGCCGAAAAGGTGGTCGCGGTTGTTCTTCCGGTGAATGCTGCCATGGTGGTTACGTTGCAATATTCCGTGGGCCGCCGACTTAACCCGGCTAACATCCGCGCGCTGATGACAGCAGGCACCCTCTGTTTCGTCATCGGTCTGGTCGGTTTTATTTTTTCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGCAGCCCGCGCTTTGTTGATTTAAGTCGAACACAATAAAGATTTAATTCAGCCTTCGTTTAGGTTACCTCTGCTAATATCTTTCTC > NC_000913/1622037‑1622586 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |