| New junction evidence | |||||||||||
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AGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTGGGAATATATGGCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAGGCGGCGCGGGTCTTGCGCCTTGAC > NC_000913/1251218‑1251782 | aGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTGGGAATATATGGCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCa < 1:269539/289‑1 (MQ=255) 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atGGCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTg > 1:430873/1‑288 (MQ=255) tGGCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGc < 1:223776/289‑1 (MQ=255) ggCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATGGCGCTgggc > 2:222933/1‑287 (MQ=255) 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ttCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAgg > 2:252887/1‑289 (MQ=255) ggTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGACAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAGGCGGCGCgg > 1:191712/1‑289 (MQ=255) aCTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTT‑GAAAGTATTGATTATGGCGTGATTAAGTGGGACGGGGCAGGTAATTTGCAATTTATTTATTCCCAggccgccgcggt > 1:99414/1‑281 (MQ=255) tctGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAGGCGGCGCGGGTCtt < 2:148236/289‑1 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTg > 2:311890‑M2/6‑220 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTg < 1:311890‑M2/215‑1 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAAt > 2:343268‑M2/6‑251 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAAt < 1:343268‑M2/246‑1 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAGGCGGCGCGGGTCTTGCGCCTTGAc > 1:55423‑M2/6‑289 (MQ=255) ggcctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAGGCGGCGCGGGTCTTGCGCCTTGAc > 1:340254‑M2/6‑289 (MQ=255) cctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAg > 1:413319‑M2/4‑87 (MQ=255) cctTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAg < 2:413319‑M2/84‑1 (MQ=255) | AGCGATGCTGACGCTCGGGCAGGCTGCGCTGGAAGATGCCTGGGAATATATGGCACCGCGAGAGTGTGCGCTGTTTATCCTCGATGAAACCGCCTGCATTCTCAGCCGTAATGGCGATCCGCAAACCTTGCAGCAGCTAAGTGCACTGGGATTCAATGACGGCACGTATTGCGCCGAGGGAATTATTGGTACTTGTGCGCTATCGTTAGCGGCTATCTCTGGTCAGGCCGTGAAAACGATGGCCGATCAACATTTCAAACAGGTACTCTGGAACTGGGCCTTTTGTGCAACGCCGTTGTTTGACAGCAAGGGCCGATTGACGGGAACAATAGCGCTGGCGTGTCCGGTTGAGCAAACTACCGCAGCTGATTTGCCGTTGACGTTGGCAATCGCCCGCGAGGTCGGAAATTTACTGCTGACGGACAGTTTGCTCGCTGAAACTAACCGTCATTTAAATCAACTTAATGCCCTGTTAGAAAGTATGGATGATGGCGTGATTAGCTGGGACGAGCAGGGTAATTTGCAATTTATTAATGCCCAGGCGGCGCGGGTCTTGCGCCTTGAC > NC_000913/1251218‑1251782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |