New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1685320 | 61 (1.220) | 6 (0.120) | 6/472 | NT | 10.3% | coding (1269/1404 nt) | fumC | fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
? | NC_000913 | = 1685547 | 46 (0.950) | coding (1042/1404 nt) | fumC | fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
ATTGCACTGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTT > NC_000913/1685036‑1685608 | aTTGCACTGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTcg > 2:95270/1‑288 (MQ=255) aCTGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCt < 2:196428/289‑1 (MQ=255) aCTGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCt < 1:390573/289‑1 (MQ=255) aCTGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCt < 1:209604/289‑1 (MQ=255) tGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCttt > 1:228296/1‑289 (MQ=255) aTTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCCACCCCGGCCGCTTTGt > 2:211448/1‑289 (MQ=255) ggATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAAcc < 1:201131/288‑1 (MQ=255) aTAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAAt > 1:412495/1‑289 (MQ=255) tGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTgg < 1:95270/289‑1 (MQ=255) ggCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTggg > 1:8253/1‑289 (MQ=255) 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aCCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGCCgttca > 1:304793/1‑289 (MQ=255) aCCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACgttca > 1:490329/1‑289 (MQ=255) gCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGc < 2:138855/142‑1 (MQ=255) gCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGc > 1:138855/1‑142 (MQ=255) 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gcAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTgatcg > 1:14656‑M2/1‑281 (MQ=255) cAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcag < 1:418952/289‑1 (MQ=255) aGCCCTTCTTTATGCGTTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCCTTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCACATGTTGACCGCCACGTCGTTACCAATCACCTCAcag > 2:379068/1‑288 (MQ=255) 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cGATCaacatggggggcgcttccggtaactttgaactgaacgtcttccgtccaatggtgatccacaatttcctgcaatcggtgcgcttgctggcagatggcatggaaagttttaacaaacactgcgcagtgggtattgaaccgaatcgtgagcgaatcaatcaattactcaatgaatcgctgatgctggtgactgcgcttaacacccacattggttatgacaaagccgccgagatcgccaaaaaagcgcataaagaagggctgaccttaaaagctgcggcccttgc > 1:14656‑M1/1‑5 (MQ=255) tCaacatggggggcgcttccggtaactttgaactgaacgtcttccgtccaatggtgatccacaatttcctgcaatcggtgcgcttgctggcagatggcatggaaagttttaacaaacactgcgcagtgggtattgaaccgaatcgtgagcgaatcaatcaattactcaatgaatcgctgatgctggtgactgcgcttaacacccacattggttatgacaaagccgccgagatcgccaaaaaagcgcataaagaagggctgaccttaaaagctgcggcccttgcgctggg < 2:14656‑M1/289‑288 (MQ=255) caacatggggggcgcttccggtaactttgaactgaacgtcttccgtccaatggtgatccacaatttcctgcaatcggtgcgcttgctggcagatggcatggaaagttttaacaaacactgcgcagtgggtattgaaccgaatcgtgagcgaatcaatcaattactcaatgaatcgctgatgctggtgactgcgcttaacacccacattggttatgacaaagccgccgagatcgccaaaaaagcgcataaagaagggctgaccttaaaagctgcggcccttgcgctgggg < 1:123539‑M1/289‑289 (MQ=255) | ATTGCACTGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTT > NC_000913/1685036‑1685608 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |