Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3796824 | 3797413 | 590 | 31 [27] | [26] 29 | [waaC]–[waaL] | [waaC],[waaL] |
GCCATTTCGTGCTACTTACCATAGTTATTTAAATACTGCCAAAATATTTATATTTGGTTCTTTTATTGTTTTCTTGACACTAACTAGCCAGCTAAAATCAAAAAAAGAGAGTGTATTATACACTTTGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATATTA > NC_000913/3797238‑3797700 | gCCATTTCGTGCTACTTACCATAGTTATTTAAATACTGCCAAAATATTTATATTTGGTTCTTTTATTGTTTTCTTGACACTAACTAGCCAGCTAAAATCAAAAAAAGAGAGTGTATTATACACTTTGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGag < 2:331536/224‑1 (MQ=255) gCCATTTCGTGCTACTTACCATAGTTATTTAAATACTGCCAAAATATTTATATTTGGTTCTTTTATTGTTTTCTTGACACTAACTAGCCAGCTAAAATCAAAAAAAGAGAGTGTATTATACACTTTGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGag > 1:331536/1‑224 (MQ=255) ataCACTTTGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCg > 1:159399/1‑151 (MQ=255) ataCACTTTGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCg < 2:159399/151‑1 (MQ=255) acTTTGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTtgctgc < 1:568895/272‑1 (MQ=255) acTTTGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTtgctgc > 2:568895/1‑272 (MQ=255) tttGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGa > 2:636572/1‑128 (MQ=255) tttGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGa < 1:636572/128‑1 (MQ=255) tGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCata < 1:306574/106‑1 (MQ=255) tGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCata > 2:306574/1‑106 (MQ=255) tGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCt > 2:192648/1‑211 (MQ=255) tGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCt < 1:192648/211‑1 (MQ=255) tGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTCTTAtaataa > 1:354400/1‑289 (MQ=255) ggATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTA‑TTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACt < 1:566028/281‑1 (MQ=255) ggATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTA‑TTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACt > 2:566028/1‑281 (MQ=255) tAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTaa < 1:108732/74‑1 (MQ=255) tAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTaa > 2:108732/1‑74 (MQ=255) tAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCAc > 1:564182/1‑261 (MQ=255) tAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCAc < 2:564182/261‑1 (MQ=255) gCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCAtt > 1:584321/1‑223 (MQ=255) gCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCAtt < 2:584321/223‑1 (MQ=255) gCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATc < 2:738768/244‑1 (MQ=255) gCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATc > 1:738768/1‑244 (MQ=255) gCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATAtt > 1:416333/1‑289 (MQ=255) cATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCt > 2:503097/1‑195 (MQ=255) cATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCt < 1:503097/195‑1 (MQ=255) ttCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATATta > 1:740409/1‑287 (MQ=255) ttCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGGTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACt < 2:252923/104‑1 (MQ=255) ttCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGGTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACt > 1:252923/1‑104 (MQ=255) | GCCATTTCGTGCTACTTACCATAGTTATTTAAATACTGCCAAAATATTTATATTTGGTTCTTTTATTGTTTTCTTGACACTAACTAGCCAGCTAAAATCAAAAAAAGAGAGTGTATTATACACTTTGTATTCTCTGTCATTTCTAATTGCTGGATATGCAATGTATATTAATAGCATTCATGAAAATGACCGCATTTCTTTTGGTGTAGGAACGGCAACAGGAGCAGCATATTCAACAATGCTAATAGGGATAGTTAGTGGCGTTGCGATTCTTTATACTAAGAAAAATCATCCTTTTTTATTTTTATTAAATAGTTGCGCGGTACTTTATGTTCTGGCGCTAACACAAACCAGAGCAACCCTACTCCTGTTCCCTATAATTTGTGTTGCTGCATTAATAGCTTATTATAATAAATCACCCAAGAAATTCACTTCCTCTATTGTTCTACTAATTGCTATATTA > NC_000913/3797238‑3797700 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |