Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4556315 | 4556782 | 468 | 35 [24] | [26] 29 | [yjiC] | [yjiC] |
TCCGATAGAGCATACGTCCTGTTGTTGTAATACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGTTTCTGTTGTAGTGATATCAACTCTACACGGTGATATTAAAGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTC > NC_000913/4556026‑4556563 | tCCGATAGAGCATACGTCCTGTTGTTGTAATACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCAt < 1:113135/289‑1 (MQ=255) tCCGATAGAGCATACGTCCTGTTGTTGTAATACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCAt < 2:629411/289‑1 (MQ=255) tCCGATAGAGCATACGTCCTGTTGTTGTAATACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCAt < 2:616878/289‑1 (MQ=255) tCCGATAGAGCATACGTCCTGTTGTTGTAATACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCAt < 1:367748/289‑1 (MQ=255) tCCGATAGAGCATACGTCCTGTTGTTGTAATACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTGTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCAt < 2:622144/289‑1 (MQ=255) agagCATACGTCCTGTTGTTGTAATACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACat < 1:226067/289‑1 (MQ=255) cGTCCTGTTGTTGTAATACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTa < 1:140109/289‑1 (MQ=255) gtAATACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACat < 2:467803/269‑1 (MQ=255) gtAATACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACat > 1:467803/1‑269 (MQ=255) gtAATACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGt > 2:281329/1‑289 (MQ=255) aTACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTAtt > 2:46959/1‑289 (MQ=255) aTCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCAt > 1:422001/1‑255 (MQ=255) aTCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCAt < 2:422001/255‑1 (MQ=255) tGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATaa > 2:294493/1‑289 (MQ=255) aTTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCAt > 1:552764/1‑225 (MQ=255) aTTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCAt < 2:552764/225‑1 (MQ=255) ttACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTaaa < 1:294493/289‑1 (MQ=255) tCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTGACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGAca > 1:505309/1‑289 (MQ=255) ttATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGTTTCTGTTGTAGTGATATCAACTCTACACGGTg < 1:281329/289‑1 (MQ=255) aTTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGttt < 2:559912/251‑1 (MQ=255) aTTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGttt > 1:559912/1‑251 (MQ=255) aTTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGTTTCTGTTGTAGTGATATCAACTCTACACGGTGATATTaaa > 1:470235/1‑289 (MQ=255) ttGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTgtagt > 1:493329/1‑217 (MQ=255) ttGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTgtagt < 2:493329/217‑1 (MQ=255) aaGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTGACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGTTTCTGTTGTAGTGATATCAACTCTACACGGTGATATTAAAGGGTAGGaaa < 2:505309/287‑1 (MQ=255) ttCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCAt < 2:314857/117‑1 (MQ=255) ttCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCAt > 1:314857/1‑117 (MQ=255) gtAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGTTTCTGTTGTAGTGATATCAACTCTACACGGTGATATTAAAGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa < 2:470235/289‑1 (MQ=255) aCTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGTTTCTGTTGTAGTGATATCAACTCTacac < 2:268423/202‑1 (MQ=255) aCTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGTTTCTGTTGTAGTGATATCAACTCTacac > 1:268423/1‑202 (MQ=255) gTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGTTTCTGTTGTAGTGatat < 2:450016/188‑1 (MQ=255) gTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGTTTCTGTTGTAGTGatat > 1:450016/1‑188 (MQ=255) tGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCa > 2:539254/1‑79 (MQ=255) tGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCa < 1:539254/79‑1 (MQ=255) cTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGTTTCTGTTGTAGTGATATCAACTCTACACGGTGATATTAAAGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTc < 1:46959/289‑1 (MQ=255) | TCCGATAGAGCATACGTCCTGTTGTTGTAATACCATCGGATTCTCTGCATGCTCCTGTCACATAATTAAATGGCCAAGGCTCTTTACTAATATCAAGTTTTCTAATTTCGACAACGCTTTTTCCATCGTAATTATGGTTATTGCCACGAGTAAGAGGCGGAAGATAGATGTTTTCCGAATCCATGCGTGCATATTTTAATTTACGTGTAAACTCACTGTCGACTATTGGGTGATGAAGGAAGTGAGCATCTGTAATAATTTGACTCTGAAGGGCATTGCTTAATGGCATAGACATAATAGTTACCTTTTATGAGTATTTCACTGATGTTTAGAAAAATAGATAAATTTTTCTGTAGTAAAAAGAGAAGTAAACAAATGACATGCATGTTTCTGTTGTAGTGATATCAACTCTACACGGTGATATTAAAGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTC > NC_000913/4556026‑4556563 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |