Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_000913 | 523,618 | A→G | 13.1% | S120G (AGC→GGC) | rhsD → | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 523,618 | 0 | A | G | 13.1% | 202.7 / 2.3 | 86 | S120G (AGC→GGC) | rhsD | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (21/50); new base G (5/9); total (27/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.53e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGCGCGCCCACCGGCGTGGCGTGCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGCTGGTGC‑GCGGTGGTAAGGCAGCACAGCCGGACGGCCATACGCTGGCGCGGCTGTGGGGGGCGCTGCCGCCGGATATCCGGTTAAGCCCGCATCTTTACCTGGCGACCAACAGCGCACAGGGGCCGTGGTGGAT‑ACTGGGGTGGTCTGAGCGGGTGCCGGGTGCTGAGGACGTACTGCCAGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTGCT > NC_000913/523345‑523886 | gnggggccacccGGCGGGGGGGGCGCGGTGGGTGCGGGCGGGATGACTTCGGGGAACCCGGTAAATCCGCTGGTAGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGGTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGa < 2:1146548/264‑1 (MQ=25) cgcgcCCACCGGCGTGGCGTGCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑Gc > 1:464748/1‑274 (MQ=255) cgcgcCCACCGGCGTGGCGTGCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCa > 1:1477338/1‑275 (MQ=255) gggtggtgCGCGGGGTGTCCGGTGGGGATGACTTCGGGCGAACCGGGAAGTCCGCTGCTGGGGTCGAAGTTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCTGCCGGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGc < 2:1036304/269‑1 (MQ=37) ggcgtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATCTCCGCTTACAGCTACGTGATGCCGGCCTGATACTCAACCACAACGGCGGGCGGG‑GCAATCCCTTTGAGcccg > 2:447627/1‑273 (MQ=255) tgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGACGGCGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCAGCTGCCGTTCCTTTTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGACGACGCCTGCCCCGGTGGGCGGTTTCGGCCCCGGCTGGAAAACGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACCCAACGACAACGGCGGGCGGG‑GCATTCTCTTTGCGCCcccgct > 1:138589/1‑275 (MQ=255) tgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTCAGCCgctgcc > 1:1101226/1‑274 (MQ=255) cTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGCCGGGCGGA‑GACTTCACTTTGAGCCgctgct > 1:778388/1‑273 (MQ=255) tgtgtCCGGGCGGGATGACTTCGGGCACCCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTCCAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATCCTCAACGACAACGGCGGGGGGAGGCATCCCCTTT‑CGCCCCTGCTCCCggg > 2:214260/1‑274 (MQ=25) tCCGGGCGGCATGACGGCGGGCAACCCGGGAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCAAAGCGGACCTT‑GCGCTGCCCGTCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCggggg < 1:1345478/272‑1 (MQ=255) ccGGGCGGGGTGACTTCGGCCAACCGGGTAAATCCCCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAgg < 2:464747/274‑1 (MQ=255) cgggATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGGTGCCGGGGGAGGCGgtg < 1:389271/274‑1 (MQ=255) gggATGCCTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGTTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTa < 1:1391068/275‑1 (MQ=255) ggATGGCGTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGCCGGACCTT‑GCCCGGCCCGGCCCCCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGGCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCGGACATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTa < 2:474534/274‑1 (MQ=255) aTGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGTCGGGGGGGGCGGTGTaacg > 1:38564/1‑272 (MQ=255) gcctgcGGGCAACCCGGTACATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCAGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTCCAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGATGTACAGc < 1:847060/269‑1 (MQ=255) ttCGGGCAACCCGGTAGATCCCCGGCTGGGGGCGAAGGTGCGGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCa < 2:38564/275‑1 (MQ=255) ttCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCCACGTGATGACGGACTGATACTCAACAACAACGGCGGGCGGG‑GCCATACCTTTGAGCCCCCGCCTCCGGGGGGGGCGGTGGACAGCCGcc > 2:35725/1‑274 (MQ=37) gtCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCa < 1:664854/274‑1 (MQ=255) gcGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGACGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCa < 1:992927/273‑1 (MQ=255) tAAAGCCGCTGCTGGGGCCGAAGGGGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTGCATTCTCTCCCGCACCGACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACGGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGTGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTgg < 1:657974/275‑1 (MQ=255) aaaTCCGCTGCTGGGGGAGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTACACTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGG‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGc < 1:32111/275‑1 (MQ=255) ctgctgGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGGCGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCGGCCGTTCATTCTCTCCCGCACTTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTTGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGCTGGTgc‑g < 1:1341369/275‑1 (MQ=255) tgctgGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGCCGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGCTGGTgc‑gc < 1:704732/275‑1 (MQ=255) gctgcCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGCTGGTGC‑GCGGTGGTAAGgcagca < 1:107149/274‑1 (MQ=255) cGGCGAGGCGGACCTT‑TCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCCTTCTCTCCCTCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGGACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAGGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTTATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGTCGGG‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGCTGGTGC‑GCGGTGGTAAGGCAGCACAGCCg < 2:665524/274‑1 (MQ=255) cGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCTTTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCCGGGGGGGGGGGGTCCGGCCGCAGTGGCTCAATGTGGGTGGTTC‑GCCGTGGTGAGGACGCACAACCgg > 2:135319/1‑275 (MQ=37) cGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGACCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGCTGGTGC‑GCGGTGGTAAGGCAGCACAGCCg < 1:1244610/274‑1 (MQ=255) 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cTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGCTGGTGC‑GCGGTGGTAAGGCAGCACAGCCGGa < 1:748597/257‑1 (MQ=255) tccccggaccgCTGCCGTTCAGTCTCTCCCGCACCTACGGTAGCTACCGGACGAAGACGCCTGGACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGCTGGTGC‑GCGGTGGTAAGGCAGCACAGCCGGACGGCCATACGCTGGcgcg < 1:886207/272‑1 (MQ=255) cccggcccgCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCCTTCCCTCTTAGCCGCCCCTGCCCGGGGGGGCGGGGTGCAGCCGCAGCGAGTCAAAGTGGCGGCGGC‑GCGGGGGGAAGGGGCAACACCCGGACGGCCATCCgacgggggggc > 2:1051700/1‑264 (MQ=21) cccggcccgCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGCTGGTGC‑GCGGTGGTAAGGCAGCACAGCCGGACGGCCATACGCTGGCGCgg < 1:1319133/273‑1 (MQ=255) cccgCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCTTTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGCTGGTgc‑gc < 1:1103478/226‑1 (MQ=255) tGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGG‑GCACTCACTTTGTGCCCCCGCCGCCCGGGGAGGGGGGGTTACGCCCCCGTGGGGCAAAGTGGGCCGTGC‑GCGGGGGGAAGGCGGCACCGCGCGGCCGCCATCAACCCGCGCGGACGTggggggg > 2:484449/1‑273 (MQ=21) 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cACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCAATTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGGGAGTCAATGTGGCTGGTGC‑GCGGTGGTAAGGCAGGCTAGCCGGACGGGCACACGCTGGCCGGGCTGTGGGGGGCGCTGCCGCCGGATAAACGGt > 1:1585351/1‑275 (MQ=255) aCCGACGGCAGCTGCCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTGTCGGCCCCGGCGCGAAGGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTAGGTGATGACGGACTGACACTCAACGACAACGGCGGGCAGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCGGTGAGTGAATGTGGCTGGTGC‑GCGGTGGTAAGGCAGCACAGCCGGACGGCCATACGCTGGCGCGGCTGTGGGGCGCGCTGCCGCCGGATATCCGGtt < 2:87803/275‑1 (MQ=255) aCAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGTA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGCTGGTgc‑gc < 1:535229/197‑1 (MQ=255) 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GGCGCGCCCACCGGCGTGGCGTGCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTT‑GCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGACGAAGACGCCTGCACCGGTGGGCGTTTTCGGCCCCGGCTGGAAAGCGCCTTCTGATATCCGCTTACAGCTACGTGATGACGGACTGATACTCAACGACAACGGCGGGCGGA‑GCATTCACTTTGAGCCGCTGCTGCCGGGGGAGGCGGTGTACAGCCGCAGTGAGTCAATGTGGCTGGTGC‑GCGGTGGTAAGGCAGCACAGCCGGACGGCCATACGCTGGCGCGGCTGTGGGGGGCGCTGCCGCCGGATATCCGGTTAAGCCCGCATCTTTACCTGGCGACCAACAGCGCACAGGGGCCGTGGTGGAT‑ACTGGGGTGGTCTGAGCGGGTGCCGGGTGCTGAGGACGTACTGCCAGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTGCT > NC_000913/523345‑523886 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |