| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,403,867 | C→T | 5.9% | A233A (GCG→GCA) | abgA ← | p‑aminobenzoyl‑glutamate hydrolase, A subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,403,867 | 0 | C | T | 5.9% | 212.2 / 2.4 | 68 | A233A (GCG→GCA) | abgA | p‑aminobenzoyl‑glutamate hydrolase, A subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/36); new base T (2/2); total (30/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.25e-01 | |||||||||||
CCTGCATAACGCCCACGTTTACTCTGGAAGCTCCTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCACGCGTACC > NC_000913/1403719‑1404013 | cctgcATAACGCCCACGTTTACTCTGGAAGCTCCTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTgc < 2:197022/149‑1 (MQ=255) tgcATAACGCCCACGTTTACTCTGGAAGCTCCTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTgcgc > 1:307417/1‑149 (MQ=255) gcATAACGCCCACGTTTACTCTGGAAGCTCCTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGcgcg > 3:312454/1‑149 (MQ=255) cccACGGTTACGCTGGAAGCTCCTTCGCTGTGAGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGGGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTTAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAAttt < 5:58796/149‑1 (MQ=255) cACGTTTACTCTGGAAGCTCCTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGAAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCTTGCGCGACGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAAttttg > 3:115810/1‑147 (MQ=255) aCGTTTACTCCGGCAGCTCCATCGCGGCGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTtggt < 1:318643/149‑1 (MQ=255) cGTTTACTCTGGAAGCTCCTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAATAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTCCGCGTCAAATTtggtg < 7:42763/149‑1 (MQ=255) ctGGAAGCTCCTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGtt > 7:196702/1‑144 (MQ=255) ctGGAAGCTCCTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGtt < 8:196702/144‑1 (MQ=255) aaGCTCCTTCGCTGTGCGGGGCGTTTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTACTGGGTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATaaaa < 6:16780/149‑1 (MQ=255) aaGCTCCTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATaaaa < 7:317415/149‑1 (MQ=255) aaGCTCCTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATaaaa < 7:218134/149‑1 (MQ=255) ccTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTAt > 2:279604/1‑148 (MQ=255) cTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTAt < 8:325523/147‑1 (MQ=255) cTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTAt < 4:312454/147‑1 (MQ=255) cTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCa < 5:212557/149‑1 (MQ=255) cTGTGCGGGGCGATTGCATGGAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTTCCGCCAACAAGGAATTGTGAACGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGTCGGTACCTGTTAAGTTCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGcc < 5:120684/149‑1 (MQ=255) cTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGcc > 6:192970/1‑149 (MQ=255) ggggCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCTCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCacac > 3:130772/1‑149 (MQ=255) ggCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCAcacca < 7:66906/149‑1 (MQ=255) ggCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCAcacca > 4:148466/1‑149 (MQ=255) gcatgcaGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGcc > 7:64197/1‑149 (MQ=255) atgcaGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGGGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCg < 4:194000/149‑1 (MQ=255) caGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAg < 7:19661/149‑1 (MQ=255) caGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAg < 1:279604/149‑1 (MQ=255) caGTGCAAGAGTGGCTTCTGCGGCCGCCAACAAGCCATTGTGACCGTCTTCAGGAGTTGCGCCTGCGTGCGCGGCGGTACCGGGGAAGTGCGCGTCAAATTGGGTGGGTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAg < 2:94862/149‑1 (MQ=255) gTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAgg > 1:293043/1‑148 (MQ=255) cAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTAc < 3:148466/148‑1 (MQ=255) cAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACg > 7:243213/1‑149 (MQ=255) aaGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTCGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCCCGGTGCCAGCAGGTACGc > 6:112234/1‑149 (MQ=255) gTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGt < 3:97909/149‑1 (MQ=255) tgctgcCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAAtgt < 8:64197/149‑1 (MQ=255) tgcCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCa > 3:84278/1‑149 (MQ=255) cgccAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACgg > 7:68756/1‑149 (MQ=255) gccAACAACGCATTGTGCCCGACTTCTGGTTTTGCGCCTCCGTGAGCGGCGGTACAGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTCCCGCCCACCACCGTGCCCGCACTTACGCCAGTGCCAATGTGCAccg > 6:260529/1‑146 (MQ=255) ccAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCAcacc < 8:193457/110‑1 (MQ=255) ccAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCAcacc > 7:193457/1‑110 (MQ=255) ccAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCCGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCa < 2:45416/149‑1 (MQ=255) aacaaGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCGAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAg > 5:82451/1‑148 (MQ=255) aGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTaaaa > 8:170201/1‑149 (MQ=255) aGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTaaaa > 8:165479/1‑149 (MQ=255) ttGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATc < 2:183309/149‑1 (MQ=255) gtgACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCa < 5:260167/148‑1 (MQ=255) tgACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCaa > 1:66799/1‑148 (MQ=255) tgACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCaa < 5:113139/148‑1 (MQ=255) tgACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAAc < 2:66799/149‑1 (MQ=255) gACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAAca > 6:334556/1‑149 (MQ=255) cGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAAcatca > 5:153738/1‑149 (MQ=255) gTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAAcatcat > 1:177860/1‑149 (MQ=255) tcttctGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAgg > 4:267262/1‑104 (MQ=255) tcttctGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAgg < 3:267262/104‑1 (MQ=255) ttctGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCCTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGACAGTa < 2:81398/130‑1 (MQ=255) ttctGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCCTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGACAGTa > 1:81398/1‑130 (MQ=255) ctGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCTGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTAc < 4:115810/148‑1 (MQ=255) ctGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTAc < 2:177860/148‑1 (MQ=255) gTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGaca < 8:243213/149‑1 (MQ=255) ttttGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGTGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGacac > 8:140818/1‑149 (MQ=255) ttttGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGTGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGacac > 2:303305/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACAcc < 1:342676/148‑1 (MQ=255) ttGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGGTGCCATATAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACAcc < 7:23040/148‑1 (MQ=255) tGCGCCTTCGTTAGCGGCGGTACAGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCt < 4:130772/148‑1 (MQ=255) tGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCt < 2:307417/148‑1 (MQ=255) cGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGa < 5:192970/147‑1 (MQ=255) cGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGAc > 1:50136/1‑148 (MQ=255) cGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCAAACCACGGTGCCCTCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGa < 4:84278/147‑1 (MQ=255) cggTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCcgc > 6:159848/1‑149 (MQ=255) gTACCGGTGAAGTGTGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCcgcgc < 7:140818/149‑1 (MQ=255) gTACCGGTGAAGTGTGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCcgcgc < 1:303305/149‑1 (MQ=255) gTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCAcg > 7:96690/1‑149 (MQ=255) gTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCAcg > 1:135787/1‑149 (MQ=255) tGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCAcgc > 7:168674/1‑149 (MQ=255) ggcgcGTCAAATTTGGTGGGTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCACGCGTAcc < 5:131300/148‑1 (MQ=255) | CCTGCATAACGCCCACGTTTACTCTGGAAGCTCCTTCGCTGTGCGGGGCGATTGCATGCAGTGCAAGAGTGGCTTGTGCTGCCGCCAACAAGGCATTGTGACCGTCTTCTGGTTTTGCGCCTGCGTGAGCGGCGGTACCGGTGAAGTGCGCGTCAAATTTGGTGGTTGCCATAAAATTATCACTGCCGCACACCACGGTGCCCGCAGGTACGCCAGTGCCAATGTGCACGGCAGTAAAATAATCAACATCATCTACGACACCTGCATCGACCATCGCCCGCGCGCCACGCGTACC > NC_000913/1403719‑1404013 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |