New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 130039 = | 101 (1.340) | 3 (0.040) | 3/254 | NT | 3.0% | coding (1222/1854 nt) | yacH | DUF3300 family protein |
? | NC_000913 | 130075 = | 94 (1.290) | coding (1186/1854 nt) | yacH | DUF3300 family protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GGTCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCC > NC_000913/129893‑130187 | tgTCTGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGGCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTtgct < 1:223591/147‑1 (MQ=255) ggTCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTtgct < 4:68586/148‑1 (MQ=255) tcaccggtgagcatcttactgataagaatatggcatggcggcacaatccaaactaccgtaatggtgtgccctatcatgatcaggatatggcaaagcggtttcatcaaaccgatgtcaacggcggaatgagcgccacgcaattacCTgc > 7:151807‑M1/145‑148 (MQ=255) tCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTgcc > 3:14572/1‑149 (MQ=255) tCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGGATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGGGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTgcc < 2:179666/149‑1 (MQ=255) tCAGTGGTTGGCGACGCCTGAAGTCGTGGAAGTCTTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATAAAAACTCTGTTCCTCTGCCTGACGATGGGTATCTCGTGTAATCACTGTTGAGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATATGCTgcc > 8:38893/1‑149 (MQ=255) tgtGGAGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGGCATAGCTCCCATAGTGTTGAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGACTGCCGTTGTGTTTGTCGTGTAATGACTGGTTCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGACGCCTGa < 8:329059/147‑1 (MQ=255) gCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACgct > 2:288240/1‑149 (MQ=255) cGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACgctg < 5:117573/149‑1 (MQ=255) cGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACgctg < 4:72736/149‑1 (MQ=255) gACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACgctgg > 8:193931/1‑149 (MQ=255) gACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACgctgg > 2:183074/1‑149 (MQ=255) cGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACgctggct > 1:159751/1‑149 (MQ=255) cTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTc > 6:310835/1‑149 (MQ=255) aaGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTTCCTGACGTTGGGTATCTCGATTACTGACTGGAGCGGCGTGTTTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTcgcg < 1:91334/149‑1 (MQ=255) gTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTcgcgcg > 5:206692/1‑149 (MQ=255) cGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGGTTTAATCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGACTGACGTTGGGTATCTCTTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGtt < 4:175715/149‑1 (MQ=255) tGGAAGGCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTgg < 7:266713/149‑1 (MQ=255) 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tcATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTaa > 3:151184/1‑149 (MQ=255) aGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTCCACCGCTGTGCCGCTGCCTGCCGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGc > 5:90502/1‑149 (MQ=255) aGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGc > 6:89799/1‑149 (MQ=255) aGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGAGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGc > 5:90505/1‑149 (MQ=255) tCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTg > 4:82655/1‑149 (MQ=255) ccATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCGCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTg < 3:266829/147‑1 (MQ=255) cATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGgcg > 1:179200/1‑149 (MQ=255) tAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCt > 7:57422/1‑149 (MQ=255) aaactaccgtaatggtgtgccctatcatgatcaggatatggcaaagcggtttcatcaaaccgatgtcaacggcggaatgagcgccacgcaattacCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAgg < 6:184175‑M1/37‑1 (MQ=255) ttCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTggg < 5:279859/124‑1 (MQ=255) ttCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTggg > 6:279859/1‑124 (MQ=255) ttCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCAtt < 7:193931/148‑1 (MQ=255) ttCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTc > 6:182147/1‑149 (MQ=255) aGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCGGAACCTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTccgc > 4:215832/1‑149 (MQ=255) cTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTg < 1:147272/134‑1 (MQ=255) cTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTg > 2:147272/1‑134 (MQ=255) tCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGCAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGtt > 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gtgtgtTCGTTGCTGTAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTAc < 6:90502/149‑1 (MQ=255) gtgtgtTCGTTGCGGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTTGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGGTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTAc < 6:90505/149‑1 (MQ=255) tgtgtTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACg < 6:80501/149‑1 (MQ=255) gtgtTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACgg > 5:68967/1‑149 (MQ=255) tgtTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACgg > 2:67496/1‑148 (MQ=255) ttCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTa < 4:253567/148‑1 (MQ=255) ttCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAg > 3:168432/1‑149 (MQ=255) gTTGCTGAAACTGATTTTCTGCCTCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCTTTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACTGTAGttt < 4:14434/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGtt > 6:85327/1‑148 (MQ=255) tGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGAtt > 8:251609/1‑149 (MQ=255) gAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTTGCTGTCGCGCGTTGGTGAAGTTAATTGCGTGGCGCTCATTACTCCGTTGACATCGGTTTGATGAGAACGCTTTTCCATATCATGATAATGATAGGGACAACAATTACTGTAGTGTGTATtg > 4:179497/1‑149 (MQ=255) gAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGa > 6:110339/1‑113 (MQ=255) gAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGa < 5:110339/113‑1 (MQ=255) aaaCTGCTTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGAGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATggt < 6:316622/149‑1 (MQ=255) aaaCTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATtgt > 5:163705/1‑149 (MQ=255) aaaCTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATtgt > 8:200570/1‑149 (MQ=255) aaaCTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATtg < 1:338370/148‑1 (MQ=255) cTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTgcc < 2:62834/149‑1 (MQ=255) cTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTgcc < 8:214765/149‑1 (MQ=255) aTTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTgccgc < 4:200189/148‑1 (MQ=255) CTGCCGCCTGAGGCTGGCTGTCGCGCGTTTGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGAGGATACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGCTAGTTTGGATTGTGCCgccatgc > 1:159178‑M1/1‑148 (MQ=255) CTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCgccatgcc > 7:251609‑M1/1‑149 (MQ=255) | GGTCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGACGCTGGCTGTCGCGCGTTGGGGCAGGTAATTGCGTGGCGCTCATTCCGCCGTTGACATCGGTTTGATGAAACCGCTTTGCCATATCCTGATCATGATAGGGCACACCATTACGGTAGTTTGGATTGTGCCGCCATGCC > NC_000913/129893‑130187 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |