New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4205219 = | 131 (1.190) | 5 (0.050) | 5/262 | 6.5 | 4.1% | coding (713/1290 nt) | purD | phosphoribosylglycinamide synthetase phosphoribosylamine‑glycine ligase |
? | NC_000913 | 4205254 = | 112 (1.070) | coding (678/1290 nt) | purD | phosphoribosylglycinamide synthetase phosphoribosylamine‑glycine ligase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
ATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAACGATGCGATGACCCGCGTCGC > NC_000913/4205108‑4205399 | atcaGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGtt < 2:396508/149‑1 (MQ=255) atcaGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGtt > 4:422271/1‑149 (MQ=255) atcaGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGtt < 2:12379/149‑1 (MQ=255) tcaGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGttt > 2:163669/1‑149 (MQ=255) aGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGttt > 6:469318/1‑147 (MQ=255) aGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGttt < 5:469318/147‑1 (MQ=255) aGGCCCGCGTAGAGAAAACCCGTGTATGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTg < 4:12903/148‑1 (MQ=255) cccGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTcc < 8:453613/149‑1 (MQ=255) cccGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTcc < 8:303874/149‑1 (MQ=255) ccGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCg > 4:347725/1‑149 (MQ=255) gcgTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGt < 7:233382/149‑1 (MQ=255) gcgTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGCTGTTTGGTCCgg > 6:394352/1‑148 (MQ=255) tAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATc < 3:200910/149‑1 (MQ=255) gagaAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTAACtt > 2:157504/1‑149 (MQ=255) gaAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTa > 7:40442/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTg > 5:33522/1‑134 (MQ=255) aaaaCCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTg < 6:33522/134‑1 (MQ=255) aaaaCCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATc > 7:329639/1‑144 (MQ=255) aaaaCCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATc < 8:329639/144‑1 (MQ=255) aaaaCCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTAt > 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tAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTAcgcg > 4:275812/1‑149 (MQ=255) ggTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGt < 2:154561/148‑1 (MQ=255) gtgtTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGttt < 7:170458/149‑1 (MQ=255) gtgtTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGttt > 2:130505/1‑149 (MQ=255) gtgtTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGttt < 7:478526/149‑1 (MQ=255) tgtTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTtg < 1:130505/149‑1 (MQ=255) tgtTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTtg > 1:53226/1‑149 (MQ=255) gCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGa < 3:210141/148‑1 (MQ=255) gCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGAt > 6:281197/1‑149 (MQ=255) ccTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGAt < 1:163669/148‑1 (MQ=255) ccTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATc < 5:271761/149‑1 (MQ=255) cTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGtt < 6:169633/112‑1 (MQ=255) cTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGtt > 5:169633/1‑112 (MQ=255) cTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATcc > 6:341646/1‑149 (MQ=255) gccgccATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCctggct > 7:231196/1‑149 (MQ=255) gccgccATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCctggct > 2:82776/1‑149 (MQ=255) 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tacCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAgg > 1:205323/1‑148 (MQ=255) tacCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAgg > 2:400660/1‑148 (MQ=255) tacCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATCCTCGCCGTCAACCATCACGATAAAGCTCGCTACTTCGCCATCGAgg > 6:275767/1‑148 (MQ=255) ccGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAAc > 5:154558/1‑149 (MQ=255) cgggggggTGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGGTTGGTCCGGTTTCTTTATCGCCCACGCGGTTGTGATCCTGGGTGGTACGCATCGGCATGACATGCTCGGCGGCCACCATCACGTTAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCtt < 8:253956/146‑1 (MQ=255) cgcgGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAAct > 6:126305/1‑146 (MQ=255) gcgGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTc < 6:345547/149‑1 (MQ=255) gTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAAcga > 2:75962/1‑149 (MQ=255) tAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAAcgat > 8:228788/1‑149 (MQ=255) tAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAAcgat > 1:485297/1‑149 (MQ=255) aGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAAcgatg < 5:394352/148‑1 (MQ=255) cccATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGTAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAAcgatgcgat > 5:296117/1‑148 (MQ=255) cccATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAAcgatgcgatg < 3:275812/149‑1 (MQ=255) ccATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAACGATGCGATGa > 2:298532/1‑149 (MQ=255) aTCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAACGATGCGATGAcc > 4:70400/1‑149 (MQ=255) aTCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAACGATGCGATGAcc > 8:38396/1‑149 (MQ=255) aTCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGACATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAACTATGCGATGAcc > 3:335560/1‑149 (MQ=255) ccgccgGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAACGATGCGATGACCcgc < 4:129044/149‑1 (MQ=255) ccgccgGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAACGATGAGATGACCcgc > 8:115867/1‑149 (MQ=255) ccgGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAACGATGCGATGACCCGCGTc < 2:485297/149‑1 (MQ=255) gtgtTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCttcttc > 6:455603/1‑104 (MQ=255) gtgtTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCttcttc < 5:455603/104‑1 (MQ=255) | ATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGTGTTTGGTCCGGTATCTTTATCGCCTACGCGTTTGTGATCCTGGCTGGTAGCCATCGGCAGCACATGCTCGCCGTCCACCATCACGATAAAGCTCGCTTCTTCGCCATCGAGGAACTCTTCGATAACGATGCGATGACCCGCGTCGC > NC_000913/4205108‑4205399 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |