New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3383284 = | 118 (1.140) | 4 (0.040) | 4/262 | 10.6 | 3.4% | intergenic (+17/+46) | degS/mdh | serine endoprotease, periplasmic/malate dehydrogenase, NAD(P)‑binding |
? | NC_000913 | 3383314 = | 118 (1.240) | intergenic (+47/+16) | degS/mdh | serine endoprotease, periplasmic/malate dehydrogenase, NAD(P)‑binding | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTACCCA > NC_000913/3383166‑3383460 | gCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTtta < 1:151544/149‑1 (MQ=255) cGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGc < 7:137158/148‑1 (MQ=255) gCCCTGGTTAGGTCATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCATGTCACCATTAATGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTa < 5:179950/149‑1 (MQ=255) ccTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAAt > 1:106061/1‑149 (MQ=255) gTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAAt < 6:36522/149‑1 (MQ=255) gTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACt > 3:202174/1‑148 (MQ=255) aTCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACttatt < 2:96611/149‑1 (MQ=255) cccTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACtta > 6:30622/1‑145 (MQ=255) cccTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACtta < 5:30622/145‑1 (MQ=255) ccTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTttatta > 1:307053/1‑125 (MQ=255) ccTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTttatta < 2:307053/125‑1 (MQ=255) ccTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAAc < 8:120134/149‑1 (MQ=255) cTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTAATTAAc > 7:99726/1‑148 (MQ=255) tGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACg > 8:61047/1‑148 (MQ=255) gtagtGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATc > 8:49507/1‑121 (MQ=255) gtagtGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATc < 7:49507/121‑1 (MQ=255) gtagtGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCTCTAATCAATTACTTATTAACGAActc > 2:220045/1‑149 (MQ=255) tagtGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTGTTTTATTATCCGCTAGTCACGTAGATATTAACGAActct > 6:34969/1‑149 (MQ=255) gATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGc > 4:403271/1‑149 (MQ=255) gTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAgg < 8:60181/149‑1 (MQ=255) tgatgaTAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAggg < 8:65122/149‑1 (MQ=255) gatgatAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTa < 5:158774/122‑1 (MQ=255) atAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGat < 1:305781/148‑1 (MQ=255) aGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtct < 1:272848/149‑1 (MQ=255) gCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctt > 6:206587/1‑149 (MQ=255) gCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctt > 4:326162/1‑149 (MQ=255) cAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtcttt < 2:106061/149‑1 (MQ=255) gTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCCGAGTCGGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCACAGCGATAactttcc > 4:95073/1‑148 (MQ=255) ttAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctttctt < 5:255315/149‑1 (MQ=255) aaCGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctttctt > 5:153729/1‑147 (MQ=255) aaCGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctttctt > 6:242321/1‑147 (MQ=255) aaCGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctttctt > 2:195414/1‑147 (MQ=255) aaCGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctttctt < 6:153729/147‑1 (MQ=255) aCGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAACCCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCa < 4:245365/148‑1 (MQ=255) aCGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCa < 3:396794/148‑1 (MQ=255) aCGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAg < 4:261974/149‑1 (MQ=255) aCGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAg > 1:91482/1‑149 (MQ=255) tGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtcttt < 3:238800/139‑1 (MQ=255) tGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtcttt > 4:238800/1‑139 (MQ=255) cAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTTCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATc < 3:57215/149‑1 (MQ=255) cAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGCACTCTTCGCCCAGGGGGAGATCTTTCTTCAGCGTATc > 2:328688/1‑149 (MQ=255) gtccgcATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGGTCCGGTTTTTTATTATACGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCATGGCGATTTATTTCTTCAGCGTATc > 5:227715/6‑146 (MQ=255) gTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAg > 1:251760/1‑149 (MQ=255) ccATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACTAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTAAGCGTATCCAGCATa > 7:304281/1‑149 (MQ=255) aTTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGACGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATAcc > 6:145841/1‑149 (MQ=255) aTTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTAATTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATAcc > 6:339896/1‑149 (MQ=255) 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cGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGGTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTc > 4:45577/1‑149 (MQ=255) cAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGt < 7:2218/149‑1 (MQ=255) aCCAATTAAGTCGTGCGCTAAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGGTCTTTATTATCCGCTAATCAATAACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTATTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGAGCGATCTGtt > 8:278728/1‑148 (MQ=255) ccAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACtt < 4:7208/76‑1 (MQ=255) ccAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACtt > 3:7208/1‑76 (MQ=255) ccAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTc > 7:35955/1‑148 (MQ=255) aTTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAAt < 1:34149/149‑1 (MQ=255) gTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCt > 3:77353/1‑149 (MQ=255) tCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTc < 6:178789/149‑1 (MQ=255) gTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATg > 7:168691/1‑142 (MQ=255) tGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtct > 2:179171/1‑95 (MQ=255) tGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAgg < 4:388154/149‑1 (MQ=255) gcTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTa > 2:312431/1‑149 (MQ=255) tCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTAcc > 1:123892/1‑149 (MQ=255) tCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTAcc > 8:177013/1‑149 (MQ=255) tCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTAcc > 7:360708/1‑149 (MQ=255) tCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTAcc > 3:135563/1‑149 (MQ=255) 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aaaaaaCCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGAt > 2:215807/1‑149 (MQ=255) aaaaaaCCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGAt > 5:115827/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATGTCTTTCTTCAGCGTAGCCAGCATACATTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGAttt > 3:221314/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGAtt > 6:224390/1‑148 (MQ=255) aaaCCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTa < 2:123892/149‑1 (MQ=255) aaaCCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTa < 6:115827/149‑1 (MQ=255) aCCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACg < 2:314001/149‑1 (MQ=255) gtaGTCTGTTCTCCGGTTCTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCTTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGctc < 7:278728/147‑1 (MQ=255) ggAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGctc < 3:113250/149‑1 (MQ=255) ggAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGctc < 3:95073/149‑1 (MQ=255) aGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCtt < 4:77353/149‑1 (MQ=255) tgtgCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCAc > 1:369209/1‑149 (MQ=255) gtgCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCt < 7:311626/105‑1 (MQ=255) gtgCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCt > 8:311626/1‑105 (MQ=255) tgCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCAc < 1:110400/147‑1 (MQ=255) cTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCg > 6:137694/1‑149 (MQ=255) cGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCACAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGttt > 8:144640/1‑149 (MQ=255) ttttttATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTa < 2:369209/149‑1 (MQ=255) ttttATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTAcc > 6:178925/1‑149 (MQ=255) ttttATTATCCGCTAATCAAATACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCAAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTCCCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTAcc > 6:276597/1‑149 (MQ=255) tttATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTAcc > 3:85751/1‑148 (MQ=255) | GCGGAAATTCGCCCTGGTTCGGTGATCCCTGTAGTAGTGATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGTTCTGTTCAAATGCGCTCAGGGTACCGATAGATTTACGCTCTTCCACGCCGTTTTTACCCA > NC_000913/3383166‑3383460 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |