| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,613,051 | A→G | 5.2% | Y214C (TAC→TGC) | yjjU → | putative patatin‑like family phospholipase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,613,051 | 0 | A | G | 5.2% | 237.8 / 3.0 | 77 | Y214C (TAC→TGC) | yjjU | putative patatin‑like family phospholipase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/36); new base G (2/2); total (39/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 | |||||||||||
GCGATACCTGGCTTTTATCGTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAACCACCGGGCAAGCTGCG > NC_000913/4612903‑4613192 | gCGATACCTGGCTTTTATCGTAGCGGAGGGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGta < 6:30459/149‑1 (MQ=255) cGATACCTGGCTTTTATCGTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGta < 7:74354/148‑1 (MQ=255) cTGGCTTTTATCGTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACAcg > 4:170544/1‑149 (MQ=255) tGGCTTTTATCGTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACAcgc > 3:169635/1‑149 (MQ=255) gCTGTTATCGTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACAcgccg < 4:210095/149‑1 (MQ=255) ttttATCGTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACAcgccg > 3:234951/1‑147 (MQ=255) aTCGTTGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTTACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATTCGATTCCGGTTAAAGAGGCTGAAAGGCTGGTCGCTAAAACGTTGGTCTTCATTCTAAATTTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTg < 2:33101/148‑1 (MQ=255) aTCGTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGTTCAGTGATTCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGAACTACACGCAGCAGTgg > 3:262431/1‑149 (MQ=255) aTCGTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTgg > 7:21263/1‑149 (MQ=255) cGTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGt < 6:287256/148‑1 (MQ=255) gTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTATCTACCTGGATGGCGGGATCATTGATTCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGATGGTCGGCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTc < 4:262431/149‑1 (MQ=255) gTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGTATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGGCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGtt < 6:255661/148‑1 (MQ=255) gTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGtt < 3:170544/148‑1 (MQ=255) gCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCaaa < 3:25825/149‑1 (MQ=255) gtCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATg > 1:220569/1‑148 (MQ=255) tCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATgg > 3:307329/1‑148 (MQ=255) cTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTGCTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACg > 4:47325/1‑149 (MQ=255) cTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTGCTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACg > 4:52187/1‑149 (MQ=255) cATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGctggctgg < 3:137876/149‑1 (MQ=255) aTTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTggg > 6:124895/1‑149 (MQ=255) aTTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTggg > 7:391757/1‑149 (MQ=255) ttAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGt < 1:366252/149‑1 (MQ=255) aaCTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCAGAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGa > 1:266416/1‑149 (MQ=255) ccTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGt < 8:145073/148‑1 (MQ=255) ccTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGt < 6:97879/148‑1 (MQ=255) ccTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTa < 4:307329/149‑1 (MQ=255) gATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACTAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTCGCCt > 2:336015/1‑149 (MQ=255) gATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCt < 4:169635/149‑1 (MQ=255) gATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCt > 7:118702/1‑149 (MQ=255) aTGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTg < 7:378061/149‑1 (MQ=255) ggCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCCAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACCGTAGCCTg > 5:276467/1‑147 (MQ=255) ggAGCAGTGATGCGATTCCGGGTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTGGGGCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGGACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCg < 6:244763/149‑1 (MQ=255) tCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTg < 8:391757/149‑1 (MQ=255) tCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGACGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTg > 1:324653/1‑149 (MQ=255) aTGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAAt > 5:169310/1‑149 (MQ=255) tGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATc > 6:234330/1‑149 (MQ=255) cGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTg < 7:213232/149‑1 (MQ=255) cGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTgca < 4:220335/148‑1 (MQ=255) cGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTgca < 4:274024/148‑1 (MQ=255) aaaGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTGCTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGcatc < 3:47325/148‑1 (MQ=255) aaaGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTGCTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGcatc < 3:52187/148‑1 (MQ=255) aaaGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGcatca > 6:378010/1‑149 (MQ=255) aaaGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGcatc < 2:191763/148‑1 (MQ=255) aaaGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGcatc < 5:234330/148‑1 (MQ=255) aaGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTTGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGcatcat < 1:48715/149‑1 (MQ=255) aaGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACgct < 7:287726/99‑1 (MQ=255) aaGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACgct > 8:287726/1‑99 (MQ=255) agagGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGcatcat > 8:6981/1‑148 (MQ=255) gagGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCATCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATg > 6:45784/1‑148 (MQ=255) gcggcAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGGTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAAc < 3:113874/149‑1 (MQ=255) ggcAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAAc > 4:159465/1‑147 (MQ=255) aGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTTGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGt < 4:234951/149‑1 (MQ=255) aGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGt > 7:144596/1‑149 (MQ=255) aGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAACCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGt > 2:41663/1‑149 (MQ=255) ggtAAAACGTTGGTCGTCAAACGAACAGTGAAGTCACAAATGTACTACAAGCCGCACAGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTACCCTGCAGCCCCAGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTTACAt > 8:84164/3‑149 (MQ=255) aaaaCGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCCGCTATCGTGACATTcc > 5:253861/1‑148 (MQ=255) aaaCGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAACCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAg < 1:41663/149‑1 (MQ=255) gTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAAt > 8:236049/1‑149 (MQ=255) gTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAAt > 6:91574/1‑149 (MQ=255) gtcgtcATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTa < 3:159465/148‑1 (MQ=255) gtcgtcATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTAt < 5:124895/149‑1 (MQ=255) gtcggcATTCCCACTGGGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCGGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTa < 6:276467/148‑1 (MQ=255) tcgtcATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACTCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTAtt < 5:378010/149‑1 (MQ=255) tcgtcATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTAtt < 6:169310/149‑1 (MQ=255) cgtcATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTAtt > 1:350552/1‑148 (MQ=255) aTTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTgaga > 4:180697/1‑148 (MQ=255) ttCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTCAAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGaaa > 2:251966/1‑149 (MQ=255) gCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACAAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAacca > 7:304850/1‑149 (MQ=255) tgtgCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGTTGCAGCATCATGACACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAACCACCgg > 4:236672/1‑149 (MQ=255) tgCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAACCACCggg < 8:21263/148‑1 (MQ=255) gCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAACCACCGGGc > 3:244571/1‑148 (MQ=255) cGTCACAAATGTACTACACGCCGAAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGATATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAACCACCTGGCAAg < 2:324653/149‑1 (MQ=255) gTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAACCACCGGGCAAGc > 8:1646/1‑149 (MQ=255) acaAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCCGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAACCACCGGGCAAGCTGc > 6:178828/1‑149 (MQ=255) acaAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCATTTTATTGAGAAACCACCGGGCAAGCTGc < 4:86365/149‑1 (MQ=255) acaAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAACCACCGGGCAAGCTGc < 5:45784/149‑1 (MQ=255) acaAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAACCACCGGGCAAGCTGc > 5:238099/1‑149 (MQ=255) acaAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTACAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAACCACCGGGCAAGCTGc < 2:220569/149‑1 (MQ=255) aaaTGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAACCACCGGGCAAGCTGCg > 3:186243/1‑148 (MQ=255) | GCGATACCTGGCTTTTATCGTAGCGGAGTGTCGCTGGAAGGCATTAACTACCTGGATGGCGGGATCAGTGATGCGATTCCGGTTAAAGAGGCGGCAAGGCAGGGCGCTAAAACGTTGGTCGTCATTCGCACTGTGCCGTCACAAATGTACTACACGCCGCAGTGGTTCAAACGCATGGAACGCTGGCTGGGTGACAGTAGCCTGCAGCCGCTGGTCAATCTGGTGCAGCATCATGAAACCAGCTATCGTGACATTCAGCAATTTATTGAGAAACCACCGGGCAAGCTGCG > NC_000913/4612903‑4613192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |