| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,555,157 | A→G | 5.4% | I171I (ATT→ATC) | maeA ← | malate dehydrogenase, decarboxylating, NAD‑requiring; malic enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,555,157 | 0 | A | G | 5.4% | 231.9 / 2.9 | 75 | I171I (ATT→ATC) | maeA | malate dehydrogenase, decarboxylating, NAD‑requiring; malic enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/39); new base G (2/2); total (34/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.46e-01 | |||||||||||
GTCAGTGATACGCGGATTACGCCAGCCCATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATATTGTGCCGGTTCTGGTAAGAGATAAACACGCCGCGT > NC_000913/1555010‑1555304 | gtcAGTGATACGCGGATTACGCCAGCCCATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGaa < 6:321868/149‑1 (MQ=255) tcAGTGATACGCGGATTACGCCAGCCCATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAAt < 3:325166/149‑1 (MQ=255) tcAGTGATACGCGGATTACGCCAGCCCATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAAt < 2:283444/149‑1 (MQ=255) atgttatcgcgGTTTAAGCCATCCCATAAACACCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGc < 3:178998/142‑1 (MQ=255) gTGATACGCGGATTCCGCCAGCCCATATCCAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCTCCACAGGTAGGGTATACGCCGGGCTGATGCGGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGCTCGGAATGcc < 6:68732/149‑1 (MQ=255) gTGATACGCGGATTACGCCAGCCCATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGcc > 3:5179/1‑149 (MQ=255) cgcgGATTAAGCCAGCCCATATACATCGGATCGTTAAGGAGCTGTTTGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATccc < 4:239584/149‑1 (MQ=255) gATTACGCCAGCCCATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGCTCGGAATGCCCATCacgcc > 8:146895/1‑148 (MQ=255) gATTACGCCAGCCCATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCccgcc > 8:278361/1‑148 (MQ=255) ttACGCCAGCCCATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGAt < 7:369408/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCt < 1:97546/149‑1 (MQ=255) cAGCCCATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTg > 1:87208/1‑149 (MQ=255) gCCCATATACAGCGGTTCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTg < 8:259046/147‑1 (MQ=255) gCCCATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTg > 7:259046/1‑147 (MQ=255) cATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGGATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCAc > 5:370994/1‑149 (MQ=255) cATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGGATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCAc > 3:307155/1‑149 (MQ=255) cATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCAc > 7:347755/1‑149 (MQ=255) agataCAGCGGAGCGTTAAGCAGCGGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCGGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCAcc < 6:191362/147‑1 (MQ=255) cAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGcc > 2:316813/1‑149 (MQ=255) aGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGccc > 8:275325/1‑149 (MQ=255) gCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGcccc < 4:84450/149‑1 (MQ=255) gATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAg > 2:28980/1‑148 (MQ=255) agcTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCAcc > 4:345583/1‑149 (MQ=255) ttggttgTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGGATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCgtca < 6:370994/148‑1 (MQ=255) ttggttgTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGGATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCgtca < 4:307155/148‑1 (MQ=255) ttggttgTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCGTCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCgtcag > 2:41867/1‑149 (MQ=255) ttggttgTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCgtca < 1:116848/148‑1 (MQ=255) ttggttgTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCgtca < 4:49643/148‑1 (MQ=255) gttgttCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCgtcagaca > 7:395507/1‑149 (MQ=255) tcgttcCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTcaccac > 8:249593/1‑148 (MQ=255) gttcCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACaa < 7:249593/148‑1 (MQ=255) cgccATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACt > 7:229692/4‑149 (MQ=255) cGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACt > 7:121535/1‑149 (MQ=255) cGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACt < 4:5179/149‑1 (MQ=255) cGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACt > 2:334057/1‑149 (MQ=255) gACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACtt < 7:278361/149‑1 (MQ=255) aTCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTaa < 1:146727/149‑1 (MQ=255) ccAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACGGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAata > 2:49762/1‑149 (MQ=255) gCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAAtatta < 3:368712/149‑1 (MQ=255) caccaaCTGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGACACAGGCGGTATATATCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAAGGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAAtattat < 6:241563/149‑1 (MQ=255) caccGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGt < 3:345583/149‑1 (MQ=255) caccGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGt > 2:96000/1‑149 (MQ=255) tataCGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCgtca > 4:236688/1‑110 (MQ=255) tataCGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCgtca < 3:236688/110‑1 (MQ=255) cGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGc < 1:96000/148‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGCTCGGCATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTg > 7:351963/1‑146 (MQ=255) gCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTg > 7:95146/1‑146 (MQ=255) gggCTGATGCCGGCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAat < 7:146895/149‑1 (MQ=255) gggCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCgtcagt > 4:69399/1‑104 (MQ=255) gggCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCgtcagt < 3:69399/104‑1 (MQ=255) tGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAAtatt < 4:23182/121‑1 (MQ=255) tGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAAtatt > 3:23182/1‑121 (MQ=255) aTGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACCGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTc < 1:49762/149‑1 (MQ=255) aTGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTc < 1:316813/149‑1 (MQ=255) aTGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGGTGACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGAGGCCCTGGTCACCACGCCCCAGAATGCGGTCACCGTCAGTCACCACACTCCCTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTc < 3:304868/149‑1 (MQ=255) cgccACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGCCACCAAGCCCCAGAATGCGTTc > 3:22051/1‑85 (MQ=255) cgccACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGCCACCAAGCCCCAGAATGCGTTc > 3:22054/1‑85 (MQ=255) cgccACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGCCACCAAGCCCCAGAATGCGTTc < 4:22051/85‑1 (MQ=255) cgccACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGCCACCAAGCCCCAGAATGCGTTc < 4:22054/85‑1 (MQ=255) gccACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCAatat > 1:60559/1‑149 (MQ=255) ccACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATAtt < 6:137630/149‑1 (MQ=255) ccACAGGCGGTATAGAGCGACAGTGTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATAtt < 1:334057/149‑1 (MQ=255) cacaGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATATtg > 6:223954/1‑149 (MQ=255) acaGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCTTAGATATtgt > 2:124061/1‑149 (MQ=255) caGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCata > 2:362534/1‑144 (MQ=255) caGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCata < 1:362534/144‑1 (MQ=255) caGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATATtgtg < 8:121535/149‑1 (MQ=255) taGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATATTGTGCCGGTTCTg < 8:347755/149‑1 (MQ=255) taGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATATTGTGCCGGTTCTg > 8:249858/1‑149 (MQ=255) gagCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATATTGTGCCGGTTCTgg > 7:60836/1‑148 (MQ=255) gACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATATTGTGCCGGTTCTGGTAaga < 7:249858/149‑1 (MQ=255) aCAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATCGTGCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATATTGTGCCGGTTCTGGTAagag < 1:197038/149‑1 (MQ=255) gTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATATTGTGCCGGTTCTGGTAAGAGATa < 2:87208/149‑1 (MQ=255) aTCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGt < 1:66752/112‑1 (MQ=255) aTCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGt > 2:66752/1‑112 (MQ=255) gAAGGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTATAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATATTGTGCCGGTTCTGGTAAGAGATAAACACGCCGCGt < 6:368566/149‑1 (MQ=255) | GTCAGTGATACGCGGATTACGCCAGCCCATATACAGCGGATCGTTAAGCAGCTGTTGGTTGTTCGTTCCGACATCCAGCACCACCGGAAGGGTATACGCCGGGCTGATGCCGCCACAGGCGGTATAGAGCGACAGTTTACCGATCGGAATGCCCATCCCGCCGATGCCCTGGTCACCAAGCCCCAGAATGCGTTCACCGTCAGTCACCACAATCACTTTAATATTATGGTTCGGCACGTTTTGCAGAATATCGTCCATATTGTGCCGGTTCTGGTAAGAGATAAACACGCCGCGT > NC_000913/1555010‑1555304 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |