| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,317,667 | T→G | E737A (GAA→GCA) | rcsC ← | hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,317,667 | 0 | T | G | 100.0% | 269.7 / NA | 74 | E737A (GAA→GCA) | rcsC | hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (38/36); total (38/36) | |||||||||||
CCACACTGTGTACCCACTCCCCTGGCGCTTTCTCCAGCGGAATACCAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTTCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAGGAACTGACAGAGCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCAACCCTTCCACGCCTTTTTTCTGCGGGTACTGAGCGCCG > NC_000913/2317521‑2317804 | ccACACTGTGTACCCACTCCCCTGGCGCTTTCTCCAGCGGAATACCAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCg > 6:38787/1‑149 (MQ=255) cacaCTGTGTACCCACTCCCCTGGCGCTTTCTCCAGCGGAATACCAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCg > 8:192941/1‑148 (MQ=255) cacaCTGTGTACCCACTCCCCTGGCGCTTTCTCCAGCGGAATACCAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCg > 5:9239/1‑148 (MQ=255) tgtACCCACTCCCCTGGCGCTTTCTCCAGCGGAATACCAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTAtgttgt < 2:137049/149‑1 (MQ=255) aCTCCCCTGGCGCTTTCTCCAGCGGAATACCAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAacgac > 2:13050/1‑148 (MQ=255) tttCTCCAGCGGAATACCAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCcgctgcgct > 2:242667/1‑149 (MQ=255) tctcCAGCGGAATACCAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCcgctgcgct < 7:192941/147‑1 (MQ=255) cAGCGGAATACCAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAAc > 3:76541/1‑149 (MQ=255) cAGCGGAATACCAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAAc > 3:70393/1‑149 (MQ=255) tACCAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTTGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTc < 8:193374/148‑1 (MQ=255) tcaaaTCTGGCGACGACAGAAGGTCTCTTCCGCTCTGCCATGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCTGTCATCAACACATATTCTGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCa < 4:11937/146‑1 (MQ=255) ccAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCa < 4:76541/148‑1 (MQ=255) ccAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAg < 5:38787/149‑1 (MQ=255) ccAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAg > 6:163404/1‑149 (MQ=255) ccAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAg > 6:160159/1‑149 (MQ=255) ccAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAg < 4:70393/149‑1 (MQ=255) cAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAacgac < 1:85775/118‑1 (MQ=255) cAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAacgac > 2:85775/1‑118 (MQ=255) cAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTg > 2:179943/1‑140 (MQ=255) cAATATGGCGACGACAGAAGGTCACTACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTg < 1:179943/140‑1 (MQ=255) 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tACCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAGGAACTGACAGAGCGACGCATTGCGGa > 1:6493/1‑149 (MQ=255) aCCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAGGAACTGACagag < 8:80247/134‑1 (MQ=255) aCCGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAGGAACTGACagag > 7:80247/1‑134 (MQ=255) ccGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCa > 1:224426/1‑120 (MQ=255) ccGCTCTGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCa < 2:224426/120‑1 (MQ=255) ctctGCCCTGCCATTTTTTACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAGGAACTGACAGAGCGACGCATTGCGGACCgc > 5:226392/1‑148 (MQ=255) 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ttACTCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAGGAACTGACAGAGCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTAc < 2:99025/148‑1 (MQ=255) tCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAGGAACTGACAGAGCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACt > 2:139215/1‑148 (MQ=255) tCACTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAGGAACTGACAGAGCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACt > 2:25844/1‑148 (MQ=255) aCTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAGGAACTGACAGAGCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCaa < 6:179521/149‑1 (MQ=255) aCTACCTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCCGCTGCGCTGCAAACTGGTTTCCAGGAACTGACAGAGCGACGCATTGCGGACCGCCAGCCAGCAGCGTTTACCACTCaa > 5:179521/1‑149 (MQ=255) ccTCGTCAGTGATCAACACATCTTCGGGAGTCGGTTCCTGCCCTGCGTATGTTGTAACGACGATGCcgctgcgc > 8:191770/1‑74 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |