| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3898629 = | NA (NA) | 3 (0.040) | 3/248 | NT | NA | intergenic (+20/+42) | cbrC/yieK | UPF0167 family protein/putative 6‑phosphogluconolactonase |
| ? | NC_000913 | 3898659 = | NA (NA) | intergenic (+50/+12) | cbrC/yieK | UPF0167 family protein/putative 6‑phosphogluconolactonase | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GATTGTGAGAATTTCGGTATTAGAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGC > NC_000913/3898481‑3898776 | gggtaaagcgcaggcactgaaaaatgttctgcaaggtccggttaccgaagatgttccagcttccgtgttgcagctgcatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataa > 1:364973‑M1/149‑149 (MQ=255) ggtaaagcgcaggcactgaaaaatgttctgcaaggtccggttaccgaagatgttccagcttccgtgttgcagctgcatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAg > 7:162328‑M1/148‑149 (MQ=255) ttGTGAGAATTTCGGTATTAGAAATTCTGATCTAGCTATATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGAAGTTATTTAAATAATGAGAACAgg < 4:229212/149‑1 (MQ=255) ttGTGAGAATTTCGGTATTAGAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCCCTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAgg > 8:193645/1‑149 (MQ=255) gtaaagcgcaggcactgaaaaatgttctgcaaggtccggttaccgaagatgttccagcttccgtgttgcagctgcatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAgg < 2:166416‑M1/3‑1 (MQ=255) gtaaagcgcaggcactgaaaaatgttctgcaaggtccggttaccgaagatgttccagcttccgtgttgcagctgcatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAgg > 4:244324‑M1/147‑149 (MQ=255) aaagcgcaggcactgaaaaatgttctgcaaggtccggttaccgaagatgttccagcttccgtgttgcagctgcatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGcc < 2:177347‑M1/5‑1 (MQ=255) tgAGAATTTCGGTATTAGAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCg > 6:96501/1‑149 (MQ=255) aagcgcaggcactgaaaaatgttctgcaaggtccggttaccgaagatgttccagcttccgtgttgcagctgcatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGcc > 8:245516‑M1/144‑148 (MQ=255) agaATTTCGGTATTAGAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGa < 8:305750/149‑1 (MQ=255) aaTTTCGGTATTAGAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAg < 5:152433/148‑1 (MQ=255) caggcactgaaaaatgttctgcaaggtccggttaccgaagatgttccagcttccgtgttgcagctgaatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGAGCg < 2:122449‑M1/11‑1 (MQ=255) tATTAGAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGCCTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTca > 8:292806/1‑149 (MQ=255) gaaaaatgttctgcaaggtccggttaccgaagatgttccagcttccgtgttgcagctgcatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataa > 7:297108‑M1/131‑131 (MQ=255) gaaaaatgttctgcaaggtccggttaccgaagatgttccagcttccgtgttgcagctgcatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataa < 8:297108‑M1/1‑1 (MQ=255) aTTAGAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTca > 7:254283/1‑148 (MQ=255) gAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAt > 3:182919/1‑149 (MQ=255) aTTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCg < 2:373951/149‑1 (MQ=255) ttCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCgg > 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aTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTc > 4:183826/1‑149 (MQ=255) tttAAATAATGAGCACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCg < 4:243874/149‑1 (MQ=255) tttAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTc < 6:324366/148‑1 (MQ=255) aaaTAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGGCTTATTTCTTAAGCGTATCCGAGTGCTTATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGATGCTCCACGGAAGCTGGAACATCTTCGGt > 6:70066/1‑148 (MQ=255) taatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAcc < 7:292806/149‑1 (MQ=255) taatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAcc > 1:166416/1‑149 (MQ=255) tGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGa < 6:162012/149‑1 (MQ=255) tGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCAGCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGa > 2:334893/1‑149 (MQ=255) gcgaACAGGCCGGAGCGTATTTCACACATACGGAATTATTTGATAAGCTTAAGCTAGTGCTAAGTCTGCGGCAGCGGCGTTATCATCGATTACCATCAGCTAAGGATGCAGCTGAAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCTGag > 2:183914/3‑148 (MQ=255) agaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGAcc < 5:14175/149‑1 (MQ=255) agaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGAcc < 2:77695/149‑1 (MQ=255) aCAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTg < 7:136138/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGc < 8:275721/149‑1 (MQ=255) | GATTGTGAGAATTTCGGTATTAGAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGC > NC_000913/3898481‑3898776 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |