| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3569758 | 91 (0.950) | 7 (0.080) | 7/262 | 9.3 | 7.1% | coding (1562/1974 nt) | glgX | glycogen debranching enzyme |
| ? | NC_000913 | = 3569778 | 96 (1.040) | coding (1542/1974 nt) | glgX | glycogen debranching enzyme | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AGCGGGAATGCGCTTGCGCAGATGGATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAATTGTTGTTGGTCCCGTCGC > NC_000913/3569631‑3569923 | aGCGGGAATGCGCTTGCGCAGATGGATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCgg < 5:199273/149‑1 (MQ=255) gggAATGCGCTTGCGCAGATGGATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGc > 4:191777/1‑147 (MQ=255) gggAATGCGCTTGCGCAGATGGATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCa < 5:301600/149‑1 (MQ=255) tGCGCTTGCGCAGATGGATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTaa > 2:413639/1‑148 (MQ=255) tGCGCTTGCGCAGATGGATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAAc < 6:83442/149‑1 (MQ=255) ttGCGCAGATGGATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCgg > 8:104872/1‑149 (MQ=255) gcgcAGATGGATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGc < 5:185956/148‑1 (MQ=255) aGATGGATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTACACCT‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTAcc < 7:393927/149‑1 (MQ=255) gATGGATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTAccc > 1:99818/1‑149 (MQ=255) tGGATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTg < 1:412568/149‑1 (MQ=255) ggATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTgg > 2:149446/1‑149 (MQ=255) cgacaCGCGGCGGTAAATGCGGGCACACCA‑CTGCTTGCCCGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGga < 6:215729/145‑1 (MQ=255) ttAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTgg > 8:431521/1‑146 (MQ=255) ttAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTgg > 3:384714/1‑146 (MQ=255) ttAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGga < 4:384714/148‑1 (MQ=255) aCGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCAAGTAACATCGGCGTACCCTGGGagag > 4:199755/1‑148 (MQ=255) gcggcgGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGcaa > 6:184873/1‑149 (MQ=255) gTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGgaga < 7:426781/139‑1 (MQ=255) 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aCCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGt > 7:120291/1‑149 (MQ=255) aCCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGt < 8:120291/149‑1 (MQ=255) ccA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTg < 2:17209/149‑1 (MQ=255) cA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACGACgttgt > 7:373043/1‑136 (MQ=255) cA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACGACgttgt < 8:373043/136‑1 (MQ=255) a‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAAc > 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4:366031/149‑1 (MQ=255) tgACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGACGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAAttgtt < 6:278834/149‑1 (MQ=255) gACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCACCCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAAttgttg > 3:360559/1‑149 (MQ=255) gACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAAtt < 7:83096/145‑1 (MQ=255) aCCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACt > 2:41094/1‑138 (MQ=255) aCCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACt < 1:41094/138‑1 (MQ=255) aCCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAAtt > 2:409474/1‑144 (MQ=255) aCCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAAtt < 1:409474/144‑1 (MQ=255) ccATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAAttgttgtt < 1:289739/149‑1 (MQ=255) cATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAAttgttgttg < 5:62335/149‑1 (MQ=255) cGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAATTGTTGTTGGTCCCg > 7:63032/1‑149 (MQ=255) gTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAATTGTTGTTGGTCCCGt > 8:22850/1‑149 (MQ=255) tCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAATTGTTGTTGGTCCCGTc > 6:279859/1‑149 (MQ=255) tCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAATTGTTGTTGGTCCCGTc < 1:357289/149‑1 (MQ=255) cACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAATTGTTGTTGGTCCCGTcg > 8:49395/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAATTGTTGTTGGTCCCGTcgc > 4:47203/1‑149 (MQ=255) | AGCGGGAATGCGCTTGCGCAGATGGATTAACGCGGCGGTAAATGCGGTTAAACCA‑CTGCTTGCCTGCGACCAGTCCAACCAGGTTAATTGGTTATCCTGACAGTAGGCATTGTTATTGCCATGCTGGCTGTGACCATGTTCGTCACCGGCCAGTAACATCGGCGTACCCTGGGAGAGCAACAACGTTGTTAACAGGGCGTGAATGCTGTCGCGCCGCCGTTCAACCAGGTCAAGAGAACCGCCTAACCCTTCTTTACCATGATTGTTACTGTAATTGTTGTTGGTCCCGTCGC > NC_000913/3569631‑3569923 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |