Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,502,271 | C→T | 5.7% | V739I (GTT→ATT) | fryA ← | putative PTS enzyme: Hpr, enzyme I and IIA components |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,502,271 | 0 | C | T | 5.7% | 227.6 / 2.4 | 71 | V739I (GTT→ATT) | fryA | putative PTS enzyme: Hpr, enzyme I and IIA components |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/33); new base T (2/2); total (36/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 |
GTTAGCACCCAGCGTCAGCATGATCACCAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATT > NC_000913/2502125‑2502415 | gTTAGCACCCAGCGTCAGCATGATCACCAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACg < 7:76457/148‑1 (MQ=255) gCACCCAGCGTCAGCATGATCACCAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCgg < 1:300778/148‑1 (MQ=255) aCCCAGCGTCAGCATGATCACCAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACAAACGCCggtgg < 8:258297/149‑1 (MQ=255) aGCGTCAGCATGATCACCAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTaa > 6:249144/1‑148 (MQ=255) gTCAGCATGATCACCAGTGCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAAt < 7:271395/149‑1 (MQ=255) aGCATGATCACCAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAAtctc < 5:70649/149‑1 (MQ=255) aTGATCACCAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTc < 6:164991/149‑1 (MQ=255) aTGATCACCAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTc < 3:53342/149‑1 (MQ=255) tGATCACCAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTcc > 1:209216/1‑149 (MQ=255) gATCACCAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTccc > 8:82643/1‑149 (MQ=255) tCACCAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGCTACTGGAATGACGGAGCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGGAACAATCTCTTCCCGc > 2:237798/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGc > 5:33162/1‑148 (MQ=255) agatCGACTTCGCCCATATCTGACTGCCAGCCACTCGGTGTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTCGACTCACGCATCCACTGAGATTTGGTCTGCGGGATCTCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCa < 4:191715/146‑1 (MQ=255) ttCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTaa < 6:5940/128‑1 (MQ=255) ttCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTaa > 5:5940/1‑128 (MQ=255) ttCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGa > 2:94846/1‑149 (MQ=255) ttCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGAAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCTGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGa < 2:93871/149‑1 (MQ=255) gACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCggtg > 3:48090/1‑121 (MQ=255) gACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCggtg < 4:48090/121‑1 (MQ=255) cGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACAtcttc < 2:189467/148‑1 (MQ=255) ccATTTCTGACTGCCAGCCTATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATCACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTcc < 5:70755/149‑1 (MQ=255) cATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCa < 3:211524/149‑1 (MQ=255) aCTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCaaa < 5:249144/148‑1 (MQ=255) ccagccaATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACgg < 8:30358/147‑1 (MQ=255) gccaATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGtt < 6:33162/149‑1 (MQ=255) ccaATCGGTTACGCCAGCCGGGCAATGCAGATACTGGAATGACGGATCCACAGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTATTCCCGCTGCCAGACATATTCTGCCAGCTCAAACGGATCtt > 6:105320/1‑148 (MQ=255) aaTCGGTTTAGCCAGCAGGGCAATGCTGATACTGGAATGACTAAGCCACTGAGATTTGGTGTTCGGTCTCGCAACTCAAAAACCAAAGCCGGGGGTAACAAGCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCATACGGATCTTCAg > 4:209027/1‑149 (MQ=255) aTCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGt < 8:89667/149‑1 (MQ=255) aTCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGt < 1:242124/149‑1 (MQ=255) gCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGt > 3:200043/1‑148 (MQ=255) cGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTTGTAACAATGTCTTCCCGCTGCCAGACAGCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGcc < 8:329797/149‑1 (MQ=255) tGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAg > 2:25726/1‑148 (MQ=255) gAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGcc > 7:100617/1‑121 (MQ=255) gAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGcc < 8:100617/121‑1 (MQ=255) tGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAATGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCACACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTg > 6:167241/1‑149 (MQ=255) tGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAATGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTg > 6:181219/1‑149 (MQ=255) aCGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGcaca > 4:323860/1‑140 (MQ=255) aCGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGcaca < 3:323860/140‑1 (MQ=255) aCGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGa > 7:53645/1‑149 (MQ=255) cGGATCCACTGAGATTTTGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGAt < 1:324144/149‑1 (MQ=255) cGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGAt < 1:94846/149‑1 (MQ=255) cACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCt < 7:82643/148‑1 (MQ=255) aCTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCTAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGc > 7:38538/1‑149 (MQ=255) aCTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGc > 6:298567/1‑149 (MQ=255) cTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGct > 7:84096/1‑149 (MQ=255) tGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGctc > 1:285810/1‑149 (MQ=255) tGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGctc > 1:152478/1‑149 (MQ=255) tGAGATTTGGTGTGAGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGctc > 5:324178/1‑149 (MQ=255) agaTTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCtt > 6:1382/1‑149 (MQ=255) aTTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCTAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTa < 8:38538/149‑1 (MQ=255) aTTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTa > 4:195743/1‑149 (MQ=255) tttGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTAt > 2:54747/1‑149 (MQ=255) tGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTAtt < 2:285810/148‑1 (MQ=255) tgtgCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCt > 7:283633/1‑148 (MQ=255) tgCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCACTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTaa > 2:213964/1‑148 (MQ=255) gggATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATc < 5:298567/149‑1 (MQ=255) ggATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGcc > 2:61004/1‑128 (MQ=255) ggATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGcc < 1:61004/128‑1 (MQ=255) ggATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATcc > 6:121998/1‑149 (MQ=255) gATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCt < 4:200043/149‑1 (MQ=255) gCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGAt < 8:84096/148‑1 (MQ=255) tACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATcaa > 8:204005/1‑149 (MQ=255) tACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATcaa > 7:324014/1‑149 (MQ=255) ccAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACaaa < 5:296643/149‑1 (MQ=255) cAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATcaaca > 8:178905/1‑146 (MQ=255) cAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAg < 8:324014/149‑1 (MQ=255) aaaaCCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATcaaca > 1:193049/1‑145 (MQ=255) aaaaCCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATcaaca > 7:163896/1‑145 (MQ=255) aaCCAACGCCGGTGGTAACAATCTATTACCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATCTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCTGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGata > 4:109985/1‑149 (MQ=255) ccAATGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATAtt < 5:167241/149‑1 (MQ=255) ccAATGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATAtt < 5:181219/149‑1 (MQ=255) | GTTAGCACCCAGCGTCAGCATGATCACCAGTTCGACTTCGCCCATTTCTGACTGCCAGCCAATCGGTTTCGCCAGCCGGGCAATGCTGATACTGGAATGACGGATCCACTGAGATTTGGTGTGCGGGATCGCTACGCCAAAACCAACGCCGGTGGTAACAATCTCTTCCCGCTGCCAGACATCTTCTTCCAGCTCAAACGGATGTTCAGTGCGCCCGTTAACGCCGAGGTTGCCGCACAGGAACTGGATCGCCTGCTCTTTATTGCTAAAATCCTGATCAACAAAGATATT > NC_000913/2502125‑2502415 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |