Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,771,897 | C→A | 5.1% | T276K (ACA→AAA) | ydiM → | putative MFS transporter, membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,771,897 | 0 | C | A | 5.1% | 258.1 / 3.5 | 79 | T276K (ACA→AAA) | ydiM | putative MFS transporter, membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/35); new base A (2/2); total (42/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.90e-01 |
GTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCT > NC_000913/1771749‑1772045 | gTTAGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCaacaac < 7:192040/149‑1 (MQ=255) aGCCAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCACAACAACAt > 3:318265/1‑148 (MQ=255) ccAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTAc > 8:130682/1‑149 (MQ=255) ccAGTGGCTGGCACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTAc > 7:65255/1‑149 (MQ=255) aGTGGCTGGCACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTAc < 5:27192/147‑1 (MQ=255) aGTGGCTGGCACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTAc > 6:27192/1‑147 (MQ=255) gTGGCTGGCACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGa < 6:35869/149‑1 (MQ=255) tggctggcACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGAt > 3:114368/1‑149 (MQ=255) tggctggcACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTACACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGAt > 1:306457/1‑149 (MQ=255) gctggcACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATg < 7:130682/148‑1 (MQ=255) gctggcACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATGc > 5:303898/1‑149 (MQ=255) ggcACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTg > 6:247044/1‑148 (MQ=255) gcACAGTACGGACAATTTGTTGCAGGCATGTCATACACTATGTCGATCAAACTACTCAGTATCTACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTGTa < 6:303898/149‑1 (MQ=255) 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acaacaTTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAAt > 2:182831/1‑149 (MQ=255) aacaTTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATgg > 7:313690/1‑149 (MQ=255) acaTTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGc < 3:51908/149‑1 (MQ=255) caTTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCt > 7:222862/1‑149 (MQ=255) caTTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCt < 8:60110/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |