Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,435,428 | C→A | 5.7% | L64L (CTG→CTT) | uspF ← | stress‑induced protein, ATP‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,435,428 | 0 | C | A | 5.7% | 229.1 / 3.6 | 70 | L64L (CTG→CTT) | uspF | stress‑induced protein, ATP‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/32); new base A (2/2); total (36/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.00e-01 |
AATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCTCTTCCTCAACGTGGCTAATCACGCGTT > NC_000913/1435281‑1435567 | aaTGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGGTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCa < 4:237050/149‑1 (MQ=255) atgatgATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAg < 6:227907/149‑1 (MQ=255) gatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCAt > 2:173326/1‑149 (MQ=255) gggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGGGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTaa < 1:225658/149‑1 (MQ=255) aTCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTc > 7:9310/1‑149 (MQ=255) cttcttCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTg > 3:44555/1‑149 (MQ=255) cttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGc < 1:6046/147‑1 (MQ=255) cGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGa < 8:238531/147‑1 (MQ=255) cGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGGCATCCATTGCCGGTAATTCTGCgg < 5:180888/146‑1 (MQ=255) cGCCAATTCCAGAATGCGGTATTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGCACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTTATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCgg < 5:160764/146‑1 (MQ=255) gCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATa > 1:184736/1‑149 (MQ=255) gCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCACTTGCGATTTGGCATCCGCTATCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTCCGGAAt < 1:33469/148‑1 (MQ=255) ccAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATAc > 8:176476/1‑149 (MQ=255) aaTTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGc > 8:78468/1‑149 (MQ=255) cAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCa < 6:53436/119‑1 (MQ=255) cAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCa > 5:53436/1‑119 (MQ=255) aaTGCGGTCTTTGGGCGCGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCAGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAAcc > 6:89093/1‑147 (MQ=255) tGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCaga < 8:102797/149‑1 (MQ=255) tGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCa > 7:133346/1‑147 (MQ=255) cGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCagaga < 6:344153/149‑1 (MQ=255) ggTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCagagag > 6:291838/1‑149 (MQ=255) ggCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCAtagta < 5:115156/149‑1 (MQ=255) gAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAggg > 7:104557/1‑149 (MQ=255) gAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAggg > 1:187022/1‑149 (MQ=255) gCCTTCCTCAACATGGACATGGACTCTGTCGGGTGGCATTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGTTTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCa < 8:9310/149‑1 (MQ=255) gCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCa < 2:187022/149‑1 (MQ=255) ttCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCTGAATACGCTAAACACAGAGAGGCATAGTAGGGCAGt > 7:264918/1‑148 (MQ=255) ttCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGt > 1:25612/1‑148 (MQ=255) ttCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTAAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGt > 2:182706/1‑148 (MQ=255) ttCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTAAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGt > 2:188309/1‑148 (MQ=255) tCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAgg > 8:349245/1‑149 (MQ=255) tCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTAGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAgg > 3:98990/1‑149 (MQ=255) aaCATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAACCCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTa > 4:299539/1‑149 (MQ=255) aaCATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGt < 4:140953/148‑1 (MQ=255) aCATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTAt > 4:122606/1‑149 (MQ=255) aTGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTa < 8:133346/149‑1 (MQ=255) aTGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTa < 3:122606/149‑1 (MQ=255) gACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCg > 1:202400/1‑149 (MQ=255) aCATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGt < 5:337402/149‑1 (MQ=255) aTGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCa < 7:349245/149‑1 (MQ=255) gCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAg > 7:106173/1‑148 (MQ=255) cACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAgg < 2:202400/148‑1 (MQ=255) ctctGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGaaa < 7:78468/149‑1 (MQ=255) tctGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAAt > 1:221887/1‑149 (MQ=255) tCGGTTTGAACTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTAATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGATAGGCATAGTAGCGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGaa < 5:161266/148‑1 (MQ=255) tCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCAtagta < 6:153059/116‑1 (MQ=255) tCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCAtagta > 5:153059/1‑116 (MQ=255) tCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAAc < 7:176476/149‑1 (MQ=255) gTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGcatca < 5:321540/149‑1 (MQ=255) tttAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGcataat > 3:226257/1‑149 (MQ=255) aaaTTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAg > 8:227697/1‑126 (MQ=255) aaaTTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAg < 7:227697/126‑1 (MQ=255) aaaTTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGAGGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGGAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACGTCTGCATGATCaa > 4:9354/1‑149 (MQ=255) aaTTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCATGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGTAATACGCTAAACCCAGAGAGTCATATTAGGGCAGTGAAGGTATTACCTTCAGGAAATGAACCTCTGAATCATCaa > 7:251101/1‑148 (MQ=255) ttttAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCtt < 8:106173/148‑1 (MQ=255) ttAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGc > 2:56095/1‑149 (MQ=255) tAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGc < 2:349502/148‑1 (MQ=255) aTGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCctc > 5:339617/1‑149 (MQ=255) tGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCctct > 8:182774/1‑149 (MQ=255) tctcTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCTCTTcc > 5:340923/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTAAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCTCTTCCTCAACGt < 1:188309/149‑1 (MQ=255) cAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTAAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCTCTTCCTCAACGt < 1:182706/149‑1 (MQ=255) gTTGCTATTTGGCTTCCTCTTTCAGGGAATCCATTGCCGGTAATTGTGCGGAATACGCTAAACCCATAGATGCATAGTAGGGCAGTGAATGTATTACCGTCATGAAATGATACTCTGCATAATCAATCTTTGCCTCTTCCTCTACGTgg < 8:264918/149‑1 (MQ=255) gTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCTCTTCCTCAACGTgg < 6:340923/149‑1 (MQ=255) gTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGGGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCTCTTCCTCAACGTgg < 5:242324/149‑1 (MQ=255) gTTGCGATTTGGCTTCAGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCTCTTCCTCAACGTgg > 8:149878/1‑149 (MQ=255) gaattGGCATCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCTTCAGGAAATGAACCACTGCATCATCAATCTATTCCACTTCCTCAACGTGGCTAAt > 4:56846/4‑149 (MQ=255) gATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCTCTTCCTCAACGTGGCTaa > 8:89437/1‑148 (MQ=255) ttCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCTCTTCCTCAACGTGGCTAATCACGCGtt > 4:224782/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCTCTTCCTCAACGTGGCTAATCACGCGtt < 4:44555/147‑1 (MQ=255) | AATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCTCTTCCTCAACGTGGCTAATCACGCGTT > NC_000913/1435281‑1435567 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |