| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 756,423 | C→T | 24.3% | Q173* (CAG→TAG) | sdhA → | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 756,423 | 0 | C | T | 24.3% | 142.6 / 46.3 | 78 | Q173* (CAG→TAG) | sdhA | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/34); new base T (9/10); total (34/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.45e-01 | |||||||||||
AAAAACTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACG > NC_000913/756276‑756570 | gcggtcagtcgaaaaacttcggcggcACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCa < 2:392340‑M2/123‑1 (MQ=255) aaaaCTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAg > 6:146222/1‑149 (MQ=255) aaCTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGa < 7:36199/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTTTCTCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAACCCAGGa > 4:14610/1‑149 (MQ=255) agtcgaaaaacttcggcggcACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCAAACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATgg > 4:330623‑M2/21‑149 (MQ=255) gaaaaacttcggcggcACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACCCCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGcgcg > 1:120138‑M2/17‑149 (MQ=255) aaaacttcggcggcACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCggt < 2:120138‑M2/135‑1 (MQ=255) gcgAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCggtg < 4:357269/149‑1 (MQ=255) cAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCGCACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTggg < 1:11504/149‑1 (MQ=255) cAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGtggtgg > 5:307034/1‑148 (MQ=255) cAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGtggtgg < 6:307034/148‑1 (MQ=255) cAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCggtggt > 3:81455/1‑146 (MQ=255) cAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCggtggt < 4:81455/146‑1 (MQ=255) aGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGCTTTTTCTCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGGGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGtggtgg < 8:354022/149‑1 (MQ=255) ggcggcACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAGAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGtt > 8:268866‑M2/7‑149 (MQ=255) cggcACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTg > 2:278602‑M2/5‑148 (MQ=255) ggcACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTa > 5:152744‑M2/4‑149 (MQ=255) ggcACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTa < 1:56747‑M2/146‑1 (MQ=255) ggcACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTa < 5:246268‑M2/146‑1 (MQ=255) acgcacTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCg > 3:309276/1‑149 (MQ=255) tGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCAATGTTGCAAACTC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCAACATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATCGCGCGGGGGTGGGTTGTAACGAACtgt > 6:278951/1‑149 (MQ=255) tGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTAACGAACTGTTTCTCACTC‑‑TTTATCAGCAGAACCTTAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCTTTTGTGGGTTGTACCGCACtgt < 5:278951/149‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACtgt < 6:54443/147‑1 (MQ=255) cagcagCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATc < 6:257142/149‑1 (MQ=255) cagcagCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATc < 6:152744/149‑1 (MQ=255) aCCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCg < 5:301694/147‑1 (MQ=255) gTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGaa < 4:309276/149‑1 (MQ=255) tACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGt < 3:184717/145‑1 (MQ=255) tACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGt > 4:184717/1‑145 (MQ=255) ccGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGACCCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTg > 2:226493/1‑149 (MQ=255) cGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTgg > 5:246050/1‑149 (MQ=255) ggTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGt < 8:314224/149‑1 (MQ=255) gTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGtt < 8:297832/149‑1 (MQ=255) gTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCAc > 7:251455/1‑123 (MQ=255) gTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCAc < 8:251455/123‑1 (MQ=255) gTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGtt > 7:260632/1‑149 (MQ=255) gTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGGGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAAc < 4:285606/136‑1 (MQ=255) gTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGCGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAAc > 3:285606/1‑136 (MQ=255) tCAGGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGGAGAACCTGAAAAACCACCCCACCATTTTCTCCGAGTGGTATTCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGTTGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGt < 1:251973/147‑1 (MQ=255) cGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTAtt > 4:258046/1‑149 (MQ=255) aCTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCa < 6:174576/149‑1 (MQ=255) tGTTGCACACGC‑‑TTTATCGGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGt < 8:226424/131‑1 (MQ=255) tGTTGCACACGC‑‑TTTATCGGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGt > 7:226424/1‑131 (MQ=255) cacaCGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAATCCACACCTCCTTTTTGTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAATAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTg < 2:283910/132‑1 (MQ=255) cacaCGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAg > 1:400164/1‑130 (MQ=255) cacaCGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAg < 2:400164/130‑1 (MQ=255) acacGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCcgc > 6:394376/1‑149 (MQ=255) acGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCgcgc > 2:116623/1‑149 (MQ=255) gC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGcc < 4:272021/142‑1 (MQ=255) gC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGcc > 3:272021/1‑142 (MQ=255) gC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTa > 7:35094/1‑149 (MQ=255) tttATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTGCGAGTGGTATGCGCTAGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCTCGGTGGTGGGTTGTACCGAAGTGTGCATGGAAACCGTTGAAGTGGTTTTTTTAAATGCCCGCGCTAcc > 1:359707/1‑149 (MQ=255) tCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTg < 5:394376/148‑1 (MQ=255) gcagAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCg < 2:365506/110‑1 (MQ=255) gcagAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCg > 1:365506/1‑110 (MQ=255) cagAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGt < 2:216813/111‑1 (MQ=255) cagAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGt > 1:216813/1‑111 (MQ=255) cTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGTGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTgg < 3:330623/149‑1 (MQ=255) cTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTgg > 2:154869/1‑149 (MQ=255) cTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTgg > 5:223149/1‑149 (MQ=255) tGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGc > 1:362366/1‑149 (MQ=255) aaaaaCCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGc < 8:330968/147‑1 (MQ=255) aaaCCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAg < 2:362366/149‑1 (MQ=255) caccacCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGc < 8:35094/149‑1 (MQ=255) accaTTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTAt < 2:38087/149‑1 (MQ=255) ccaTTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTAtt < 3:258046/149‑1 (MQ=255) caTTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTAtt > 7:301256/1‑148 (MQ=255) ttCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATc < 1:154869/148‑1 (MQ=255) tctcCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCa < 6:223149/148‑1 (MQ=255) cGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGc > 1:235271/1‑117 (MQ=255) cGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACTAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGc < 2:235271/117‑1 (MQ=255) cGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGTCTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTcc < 1:226493/148‑1 (MQ=255) gATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGa > 6:62163/1‑65 (MQ=255) gATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGa < 5:62163/65‑1 (MQ=255) gTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAac < 5:146222/147‑1 (MQ=255) gTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCACGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGAGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAacac > 6:361675/1‑149 (MQ=255) ggAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACAcc < 1:229865/148‑1 (MQ=255) aCCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGAc < 8:260632/149‑1 (MQ=255) ccAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACg < 7:268866/149‑1 (MQ=255) | AAAAACTTCGGCGGCGAGCAGGCGGCACGCACTGCGGCAGCAGCTGACCGTACCGGTCACGCACTGTTGCACACGC‑‑TTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACG > NC_000913/756276‑756570 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |