Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,149,544 | Δ1 bp | 5.4% | coding (786/954 nt) | fabH → | 3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthase III |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,149,544 | 0 | G | . | 5.4% | 254.5 / 6.8 | 74 | coding (786/954 nt) | fabH | 3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthase III |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/39); new base . (2/2); total (33/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.82e-01 |
CAAGGTTGCGGTAACGGAACTGGCGCACATCGTTGATGAGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCT > NC_000913/1149397‑1149692 | cAAGGTTGCGGTAACGGAACTGGCGCACATCGTTGATGAGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGGTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATg < 8:6085/148‑1 (MQ=255) aaGGTTGCGGTAACGGAACTGGCGCACATCGTTGATGAGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATgg < 3:321822/148‑1 (MQ=255) aaGGTTGCGGTAACGGAACTGGCGCACATCGTTGATGAGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGa > 8:34459/1‑149 (MQ=255) gCGGTAACGGAACTGGCGCACATCGTTGATGAGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATg < 2:205975/148‑1 (MQ=255) ggTAACGGAACTGGCGCACATCGTTGATGAGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTGCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCg < 2:144655/149‑1 (MQ=255) gAACTGGCGCACATCGTTGATGAGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGAc < 2:388179/149‑1 (MQ=255) tGGCGCACATCGTTGATGAGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTg > 5:128426/1‑149 (MQ=255) cacaTCGTTGATGAGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCg < 5:201443/149‑1 (MQ=255) cGTTGATGAGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACg < 5:176828/149‑1 (MQ=255) gatgaGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATc < 4:313414/139‑1 (MQ=255) gatgaGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATc > 3:313414/1‑139 (MQ=255) tgaGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATa < 6:128426/149‑1 (MQ=255) tgaGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATa < 6:135331/149‑1 (MQ=255) tgaGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACGCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATa > 8:41038/1‑149 (MQ=255) agaCGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATAc < 2:249353/148‑1 (MQ=255) gaCGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATa > 2:165953/1‑146 (MQ=255) gaCGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATa < 1:165953/146‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACctc > 2:51181/1‑149 (MQ=255) gcggcgAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCg < 8:142794/147‑1 (MQ=255) gcgAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATTAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCctc < 7:61110/149‑1 (MQ=255) ataatCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCGCTGTc < 5:365260/149‑1 (MQ=255) gACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATAc > 7:375294/1‑125 (MQ=255) gACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATAc < 8:375294/125‑1 (MQ=255) gACCATTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACTCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTgc < 5:214270/147‑1 (MQ=255) cGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCt > 8:409659/1‑149 (MQ=255) ctcAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCgg < 1:60324/126‑1 (MQ=255) ctcAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCgg > 2:60324/1‑126 (MQ=255) tcAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTAT‑GATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATg > 4:45591/1‑148 (MQ=255) tcAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTAT‑GATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATg > 4:40516/1‑148 (MQ=255) aaCTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTg < 3:355045/129‑1 (MQ=255) aaCTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTg > 4:355045/1‑129 (MQ=255) aaCTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGaa < 2:249249/149‑1 (MQ=255) aaCTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGa < 7:409659/148‑1 (MQ=255) actggactggCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAg < 8:129616/149‑1 (MQ=255) actggactggCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAg < 7:197708/149‑1 (MQ=255) ggactggCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTg > 8:33579/1‑149 (MQ=255) gactggCTGGTGCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCt < 1:51181/147‑1 (MQ=255) tggctggTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGCCGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTAcg > 3:254941/1‑149 (MQ=255) tggctggTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTAcg > 4:323930/1‑149 (MQ=255) gctggTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTAc < 7:404529/146‑1 (MQ=255) ctggTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGa > 2:81648/1‑149 (MQ=255) tggTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGAc > 8:100892/1‑149 (MQ=255) ggTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTAcg > 8:237479/1‑144 (MQ=255) ggTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTAcg < 7:237479/144‑1 (MQ=255) cGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACgg < 7:124306/145‑1 (MQ=255) cGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACgg > 8:124306/1‑145 (MQ=255) cGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTAT‑GATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGgcgc < 3:40516/148‑1 (MQ=255) cGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTAT‑GATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGACCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGgcgc < 3:45591/148‑1 (MQ=255) aCCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCgggg < 7:34459/149‑1 (MQ=255) aCCTGCGGATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGGGGTGACGCTGGAGCGCCACTGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCgg < 7:357871/147‑1 (MQ=255) ccTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGc < 7:33579/149‑1 (MQ=255) cTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCgggg > 1:125461/1‑147 (MQ=255) cTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCgggg > 8:269753/1‑147 (MQ=255) cTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGAGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCgggg > 1:62023/1‑147 (MQ=255) gTATTTTCAGTGCTACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGtt < 3:322140/148‑1 (MQ=255) tattatCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTgg > 4:174583/1‑149 (MQ=255) tattatCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTgg < 5:362524/149‑1 (MQ=255) atCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCt > 2:159012/1‑149 (MQ=255) atCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCt > 8:72947/1‑149 (MQ=255) tCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTg > 2:279826/1‑149 (MQ=255) gTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTaa < 2:308192/67‑1 (MQ=255) gTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTaa > 1:308192/1‑67 (MQ=255) gTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCtt > 1:302498/1‑149 (MQ=255) gAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGc > 2:315366/1‑137 (MQ=255) gAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTg > 4:323036/1‑149 (MQ=255) gAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTg < 1:81648/149‑1 (MQ=255) aaaaaCTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACTCTCGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGc > 7:397943/1‑149 (MQ=255) aaCTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGt < 3:323930/149‑1 (MQ=255) aaCTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGt > 3:106959/1‑149 (MQ=255) aCTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTg < 1:159012/149‑1 (MQ=255) gttATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGCCGCTTGAGAGCCACGGTAATAAGTCTGTGGCCTCTGTCCCGTGCGAGCTGGATGAAGCTGTACGAGACGGGGGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGGGGa < 6:217899/145‑1 (MQ=255) ggTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCt > 4:293543/1‑136 (MQ=255) ggTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCt < 3:293543/136‑1 (MQ=255) aTGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCAc < 4:254941/149‑1 (MQ=255) tGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGGCCCGTGCGCGCTGGAGGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCAcc < 1:266573/149‑1 (MQ=255) tGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGc < 4:222332/149‑1 (MQ=255) ggATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCt > 6:46691/1‑149 (MQ=255) | CAAGGTTGCGGTAACGGAACTGGCGCACATCGTTGATGAGACGCTGGCGGCGAATAATCTTGACCGTTCTCAACTGGACTGGCTGGTTCCGCATCAGGCTAACCTGCGTATTATCAGTGCAACGGCGAAAAAACTCGGTATGTCTATGGATAATGTCGTGGTGACGCTGGATCGCCACGGTAATACCTCTGCGGCCTCTGTCCCGTGCGCGCTGGATGAAGCTGTACGCGACGGGCGCATTAAGCCGGGGCAGTTGGTTCTGCTTGAAGCCTTTGGCGGTGGATTCACCTGGGGCT > NC_000913/1149397‑1149692 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |