| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,722,608 | T→C | 5.1% | S886P (TCA→CCA) | pka → | protein lysine acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,722,608 | 0 | T | C | 5.1% | 376.3 / 7.8 | 118 | S886P (TCA→CCA) | pka | protein lysine acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/62); new base C (3/3); total (53/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.19e-01 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGACCACTTAATCGGGACTGGTGTTATTATTGCCCGCTTATGTCGTCTGCATTGCACAGAGGACCCTTCAATGAACAGAGAAGAAATGCACTGTGATGTTGTCAAAATTTAAGCGTAATAAACA > NC_000913/2722463‑2722755 | tCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATTGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGTATCGTTGGGCTTACTCTAAATCTTGCCCAGCGCTAGGAATCAt < 7:8422/149‑1 (MQ=255)tCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCAt < 7:90921/149‑1 (MQ=255)tCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCAt < 6:41251/149‑1 (MQ=255) aCGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCAt > 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tACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAgg > 5:398742/1‑149 (MQ=255) cAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTAGAAGAGGTGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTa > 6:531689/1‑149 (MQ=255) aaCGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCa > 6:109099/1‑137 (MQ=255) aaCGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCa < 5:109099/137‑1 (MQ=255) aaCGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTAc > 6:469629/1‑149 (MQ=255) 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tAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGACCACTTAATCGGGACTGgtg > 5:120928/1‑70 (MQ=255) tAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGACCACTTAATCGGGACTGGTGTTATTATTGCCCGCTTATGTCGTCTGCATTGCACAGAGGACCCTTCAATGAACAGAGAAGAAATGCACTGTGAtgttgt > 4:344834/1‑149 (MQ=255) tAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGACCACTTAATCGGGACTGGTGTTATTATTGCCCGCTTATGTCGTCTGCATTGCACAGAGGACCCTTCAATGAACAGAGAAGAAATGCACTGTGAtgttg > 1:363911/1‑148 (MQ=255) ccAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGACCACTTAATCGGGACTGGTGTTATTATTGCCCGCTTATGTCGTCTGCATTGCACAGAGGACCCTTCAATGAACAGAGAAGAAATGCACTGTGATGTTGTCAAAAttt > 3:90807/1‑147 (MQ=255) ccAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGACCACTTAATCGGGACTGGTGTTATTATTGCCCGCTTATGTCGTCTGCATTGCACAGAGGACCCTTCAATGAACAGAGAAGAAATGCACTGTGATGTTGTCAAAATTTaa < 3:344834/149‑1 (MQ=255) aGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGACCACTTAATCGGGACTGGTGTTATTATTGCCCGCTTATGTCGTCTGCATTGCACAGAGGACCCTTCAATGAACAGAGAAGAAATGCACTGTGATGTTGTCAAAATTTAAGCGtaat > 3:333785/1‑148 (MQ=255) aTCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGACCACTTAATCGGGACTGGTGTTATTATTGCCCGCTTATGTCGTCTGCATTGCACAGAGGACCCTTCAATGAACAGAGAAGAAATGCACTGTGATGTTGTCAAAATTTAAGCGTAATAAACa < 7:364648/149‑1 (MQ=255) | TCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGACCACTTAATCGGGACTGGTGTTATTATTGCCCGCTTATGTCGTCTGCATTGCACAGAGGACCCTTCAATGAACAGAGAAGAAATGCACTGTGATGTTGTCAAAATTTAAGCGTAATAAACA > NC_000913/2722463‑2722755 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |