| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,128,066 | G→A | 5.0% | intergenic (‑45/‑206) | glcD ← / → glcC | glycolate oxidase subunit, FAD‑linked/glycolate‑inducible glc operon transcriptional repressor; autorepressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,128,066 | 0 | G | A | 5.0% | 257.3 / 2.3 | 79 | intergenic (‑45/‑206) | glcD/glcC | glycolate oxidase subunit, FAD‑linked/glycolate‑inducible glc operon transcriptional repressor; autorepressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/38); new base A (2/2); total (39/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.49e-01 | |||||||||||
TCAAGTCCAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGT > NC_000913/3127924‑3128213 | tcAAGTCCAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCgctgc > 1:65115/1‑149 (MQ=255)tcAAGTCCAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCgctgc > 7:23533/1‑149 (MQ=255) gTCCAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCt < 7:153769/149‑1 (MQ=255) cAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCtgtg < 2:332346/149‑1 (MQ=255) cAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCtgt < 6:170681/148‑1 (MQ=255) ggACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAAc < 1:177828/149‑1 (MQ=255) aCGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAg > 3:275942/1‑149 (MQ=255) cAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCgg < 7:225595/149‑1 (MQ=255) cATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCtttt > 2:279587/1‑149 (MQ=255) cATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACACTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCtttt > 8:117012/1‑149 (MQ=255) aTCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCttttc < 8:135509/149‑1 (MQ=255) aTCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCttttc > 7:135509/1‑149 (MQ=255) aGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCttttcgtt < 8:23533/149‑1 (MQ=255) tACCGATGTGCGGGCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTGCGCTTTGTTGTGTGGTGTGGCAGCTGAGTTGTGCGCGCTGCTTCGGTGAACAGTTAGTAAGCGGGCgtgtcggtgt > 5:254758/1‑145 (MQ=255) ccGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCttttcgttttc < 3:183194/148‑1 (MQ=255) gATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTc > 1:18325/1‑149 (MQ=255) ggTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCtgt < 2:186111/109‑1 (MQ=255) ggTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCtgt > 1:186111/1‑109 (MQ=255) ggTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCttttcgttttc < 7:87716/139‑1 (MQ=255) ggTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCttttcgttttc > 8:87716/1‑139 (MQ=255) gTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCtgt < 2:239315/108‑1 (MQ=255) gTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCtgt > 1:239315/1‑108 (MQ=255) gTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCtt > 3:336945/1‑149 (MQ=255) tCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCttt < 8:173657/149‑1 (MQ=255) gtcATCGGGTAATGCTCCATCTAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTGATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCTGCTGTTTTTTTCGCGCTGCTTGTGTGAACTGTTATTATGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTa < 4:275942/146‑1 (MQ=255) gtcATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGTACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTa < 7:371434/146‑1 (MQ=255) gaaaTCGTGTAACTCTCCTTCAATACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGTCTTCGCTTTGTTGGTTTGGGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTATGCGGTCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTa < 6:254758/145‑1 (MQ=255) gACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTa < 1:279587/148‑1 (MQ=255) gACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACACTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTa < 7:117012/148‑1 (MQ=255) cATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCttttcgttt < 6:22225/131‑1 (MQ=255) cATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCttttcgttt > 5:22225/1‑131 (MQ=255) aTCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCCGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTAtct > 8:38986/1‑140 (MQ=255) aTCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCCGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTAtct < 7:38986/140‑1 (MQ=255) tCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGaa < 8:78276/104‑1 (MQ=255) tCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGaa > 7:78276/1‑104 (MQ=255) tAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGt > 8:203842/1‑148 (MQ=255) aaGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCa < 2:18325/148‑1 (MQ=255) aTCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAg > 1:379506/1‑142 (MQ=255) aTCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAg < 2:379506/142‑1 (MQ=255) aTCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGATTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGCCCA‑‑ttt > 5:39431/1‑149 (MQ=255) cAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCACGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑ttttt > 8:263978/1‑149 (MQ=255) aaGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑tttttt > 7:324606/1‑149 (MQ=255) gCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTc < 1:224674/147‑1 (MQ=255) gCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTc > 2:224674/1‑147 (MQ=255) tctTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTa > 5:69883/1‑120 (MQ=255) tctTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTa < 6:69883/120‑1 (MQ=255) ttCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGctc > 3:231621/1‑149 (MQ=255) gTAAAAGATGATAATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATGTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTATTCGATTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACAA‑‑ATTTTTATCCAGCTCtgt > 6:183487/1‑149 (MQ=255) tACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTAACGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTAtgt > 4:215093/1‑148 (MQ=255) aGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTc > 4:91659/1‑100 (MQ=255) aGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTc < 3:91659/100‑1 (MQ=255) gATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCtt > 8:229709/1‑149 (MQ=255) tGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGATGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTa < 1:371339/107‑1 (MQ=255) tGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGATGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTa > 2:371339/1‑107 (MQ=255) cTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCt > 3:231146/1‑149 (MQ=255) tCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGCCCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTGTGGGACCTTGTcgt > 2:154595/1‑147 (MQ=255) gCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTc > 6:48151/1‑119 (MQ=255) gCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTc < 5:48151/119‑1 (MQ=255) ttCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGGGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCa < 7:355957/119‑1 (MQ=255) ttCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCa > 8:355957/1‑119 (MQ=255) cGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATg < 4:231621/148‑1 (MQ=255) cGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGt > 3:234195/1‑149 (MQ=255) gCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGtt < 2:65115/149‑1 (MQ=255) cTTTGTAGTGTTCTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCATCTGTGAACAGATAATAAGCGCGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCGTTACCTACAGGACAGACCA‑‑TTTTTATTCCAGCACTCTGACCTAGGATTGGATAACTCAATGtg > 6:333832/1‑147 (MQ=255) tgttgtgttgTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTaaa < 7:229709/148‑1 (MQ=255) gttgtgttgtGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAAt < 4:231146/148‑1 (MQ=255) ttgtgttgtgTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTg < 7:164855/149‑1 (MQ=255) tgttgtgtGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCtgt > 4:120612/1‑114 (MQ=255) tgttgtgtGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCtgt < 3:120612/114‑1 (MQ=255) ttgtgtGGCAGCTGATTTTTGCACGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGt < 7:263978/148‑1 (MQ=255) gtgtgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTaa < 4:234195/148‑1 (MQ=255) tgtgGCAGCTGATTTTTGAGAGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCTTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAAc < 3:215093/148‑1 (MQ=255) gCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAAt > 4:270948/1‑149 (MQ=255) aGCTGATTTTTGCACGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATa > 7:51409/1‑145 (MQ=255) aGCTGATTTTTGCACGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATa < 8:51409/145‑1 (MQ=255) gCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCAc < 4:336945/149‑1 (MQ=255) gCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCAc > 3:184779/1‑149 (MQ=255) tGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCATTTTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATc < 2:70267/147‑1 (MQ=255) tGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCATTTTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATc > 1:70267/1‑147 (MQ=255) cgcgcTGCTTCTGTGAACAGTTATTAATCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGAtgt < 1:154595/149‑1 (MQ=255) | TCAAGTCCAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGT > NC_000913/3127924‑3128213 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |