| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,348,803 | C→T | 5.1% | intergenic (+35/+19) | yfaE → / ← inaA | ferredoxin involved with ribonucleotide reductase diferric‑tyrosyl radical (Y*) cofactor maintenance/acid‑inducible Kdo/WaaP family putative kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,348,803 | 0 | C | T | 5.1% | 257.8 / 2.2 | 78 | intergenic (+35/+19) | yfaE/inaA | ferredoxin involved with ribonucleotide reductase diferric‑tyrosyl radical (Y*) cofactor maintenance/acid‑inducible Kdo/WaaP family putative kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/38); new base T (2/2); total (38/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.38e-01 | |||||||||||
CGCCTGGTTGCAGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTATCGCGACGCAAGCGGCGACGACTTTTC > NC_000913/2348655‑2348948 | cGCCTGGTTGCAGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTc < 7:81333/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTTGCAGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCt < 5:257959/149‑1 (MQ=255) cTGGTTGCAGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTa > 4:198107/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATc < 3:152229/148‑1 (MQ=255) ttGCAGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTg > 5:204766/1‑149 (MQ=255) gCAGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGc > 2:140402/1‑149 (MQ=255) cAGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGc‑c < 6:129008/149‑1 (MQ=255) cAGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGc < 8:113152/148‑1 (MQ=255) cAGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGc < 3:303761/148‑1 (MQ=255) cAGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATAAGACGCATAAGCGTTGTATCTGGca < 6:279444/149‑2 (MQ=39) aGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGc‑c > 7:177992/1‑148 (MQ=255) gTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTa > 7:153868/1‑148 (MQ=255) tCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTAc > 1:303669/1‑148 (MQ=255) aaGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAAc > 4:258303/1‑149 (MQ=255) cTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTAAGCCGGGGGAAATTTTGCCCAGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACa > 2:315340/1‑149 (MQ=255) tGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACAt > 8:97375/1‑149 (MQ=255) gATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACAtcg > 4:350701/1‑147 (MQ=255) gATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGCGGTAAATTTTGCCCTGTTGTGGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACAt < 3:191521/147‑1 (MQ=255) ccGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCgtag < 8:153868/149‑1 (MQ=255) cGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCgtagt < 5:219329/149‑1 (MQ=255) aaCCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTaa > 5:238281/1‑149 (MQ=255) ccGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCACTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTTGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATa < 4:202190/149‑1 (MQ=255) cGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTCCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATAc < 5:337568/149‑1 (MQ=255) cGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGGGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATAc < 7:336726/149‑1 (MQ=255) ttAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGc < 8:177992/149‑1 (MQ=255) cTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATgg > 3:278150/1‑131 (MQ=255) cTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATgg < 4:278150/131‑1 (MQ=255) cTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCa > 8:17725/1‑149 (MQ=255) tttATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGAtt < 4:221025/124‑1 (MQ=255) tttATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGAtt > 3:221025/1‑124 (MQ=255) ttttGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTg < 3:350701/149‑1 (MQ=255) ttGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTgg < 1:140402/148‑1 (MQ=255) ttGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTgg < 8:215823/148‑1 (MQ=255) ccTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGc > 6:372862/1‑88 (MQ=255) ccTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGc < 5:372862/88‑1 (MQ=255) cTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGGTGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGAAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTg > 3:246196/1‑149 (MQ=255) cTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCgta < 5:178583/108‑1 (MQ=255) cTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCgta > 6:178583/1‑108 (MQ=255) tgttgtTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTgg < 7:261431/142‑1 (MQ=255) tgttgtTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTgg > 8:261431/1‑142 (MQ=255) ttgCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCa < 1:315340/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTg > 6:248652/1‑141 (MQ=255) gCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTg < 5:248652/141‑1 (MQ=255) aaaGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTc < 3:198107/149‑1 (MQ=255) aaaGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTc < 2:303669/149‑1 (MQ=255) aaGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTc > 3:195907/1‑148 (MQ=255) ggCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAg > 7:132313/1‑149 (MQ=255) atatTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTgg > 8:232946/1‑149 (MQ=255) ttGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATAtt > 5:76360/1‑135 (MQ=255) ttGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATAtt < 6:76360/135‑1 (MQ=255) gAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCgta > 5:253255/1‑80 (MQ=255) gAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCgta < 6:253255/80‑1 (MQ=255) aaaTCGAGGTGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGAAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGaa < 4:246196/148‑1 (MQ=255) aaaTCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAg > 7:26950/1‑149 (MQ=255) gagaTGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCAt < 8:26950/148‑1 (MQ=255) gagaTGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATg < 3:258303/149‑1 (MQ=255) agaTGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGa < 8:132313/149‑1 (MQ=255) agaTGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGa > 3:228125/1‑149 (MQ=255) aaTTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCg > 5:289951/1‑149 (MQ=255) ttGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTg > 2:240747/1‑98 (MQ=255) ttGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTg < 1:240747/98‑1 (MQ=255) gTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGAt > 1:381969/1‑138 (MQ=255) gTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCACCTGGCGGAAGTCATGAt < 2:381969/138‑1 (MQ=255) gTTGTAG‑GCCAGATAAGACGCATAAGCGTTGTATCTGGCACTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCa > 5:100892/1‑108 (MQ=18) gTTGTAG‑GCCAGATAAGACGCATAAGCGTTGTATCTGGCACTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCa < 6:100892/108‑1 (MQ=18) ttGTAG‑GCCAGATAAGACGCATAAGCGTTGTATCTGGCACTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTAt > 4:281283/1‑149 (MQ=37) gTGCCAGATACAGCGGGTATGCGTCTTAGCTGGG‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCGCCTGCTGCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTATCGCGa > 8:317997/1‑149 (MQ=255) gTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTATCGCGa < 7:232946/149‑1 (MQ=255) cAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTATCGCGACGc > 8:275128/1‑148 (MQ=255) aaCGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACCTGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTATCGCGACGCAAgcggcg > 2:49177/1‑149 (MQ=255) aaCGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCgta < 8:12372/44‑1 (MQ=255) aaCGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTATCGCGCCGCAAgcggcg > 6:52729/1‑149 (MQ=255) cGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTATCGCGACGCAAGCGGcgac < 7:275128/149‑1 (MQ=255) cTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTATCGCGACGCAAGCGGcgacga < 7:17725/149‑1 (MQ=255) ttATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTATCGCGACGCaa < 7:86741/138‑1 (MQ=255) ttATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTATCGCGACGCaa > 8:86741/1‑138 (MQ=255) gCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGc < 6:79089/54‑1 (MQ=255) gCGTCTTATCTGCC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGc > 5:79089/1‑54 (MQ=255) cGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTATCGCGACGCAAGCGGCGACGACTTTtc > 6:133464/1‑149 (MQ=255) | CGCCTGGTTGCAGGTCAAGTTGACTGGATTGCCGAACCGTTAGCCTTTATTCAGCCGGGGGAAATTTTGCCCTGTTGTTGCCGGGCAAAAGGCGATATTGAAATCGAGATGTGAATTGGTTGTAGTGCCAGATACAACGCTTATGCGTCTTATCTGGC‑CTACAACGATTACATGGCGTAGTAATACGCTTTCACCTGCTCCCAGTCCGCTTTGGGGATTGGCTCCAGATATTTTTCCAGCTGGCGGAAGTCATGATTAATCGCTTTATCGCGACGCAAGCGGCGACGACTTTTC > NC_000913/2348655‑2348948 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |