New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4522063 | 84 (1.070) | 4 (0.060) | 4/230 | NT | 4.9% | intergenic (‑43/+64) | yjhF/yjhG | putative transporter/putative dehydratase |
? | NC_000913 | = 4522085 | 80 (1.110) | intergenic (‑65/+42) | yjhF/yjhG | putative transporter/putative dehydratase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGAAGCATTGCCCATAGC > NC_000913/4521939‑4522232 | aCGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGTCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGag < 1:216200‑M2/149‑3 (MQ=255) aCGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTACTCTCATAACAGCGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGag < 3:273730‑M2/149‑3 (MQ=255) aacaaacGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtcgg > 8:184402‑M2/1‑143 (MQ=255) acaaacGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCATGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtcgga > 1:62427‑M2/1‑142 (MQ=255) acaaacGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtcgga > 4:50837‑M2/1‑142 (MQ=255) tATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCa < 5:114516/149‑1 (MQ=255) ttAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAg < 5:182775/148‑1 (MQ=255) ttAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAg < 7:386376/148‑1 (MQ=255) aaGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGgt < 2:24448/148‑1 (MQ=255) aaGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGgt < 6:73990/148‑1 (MQ=255) cTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCt < 1:247184/149‑1 (MQ=255) ttAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCAGACTGAGCAAATAACGAATGCTGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGGCTg > 2:107474/1‑149 (MQ=255) aaTTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAg < 4:302366/140‑1 (MQ=255) aaTTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAg > 3:302366/1‑140 (MQ=255) tttttATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAATGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATg > 4:334763/1‑149 (MQ=255) aTGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCTCAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGATCAAATTACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGtgtt < 6:274127/148‑1 (MQ=255) tGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTttta < 2:63087/149‑1 (MQ=255) ggTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTtttat > 6:327984/1‑149 (MQ=255) gTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTtttatt < 5:327984/149‑1 (MQ=255) gCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCtt > 5:225495/1‑149 (MQ=255) cAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTTTCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCttt > 5:172/1‑149 (MQ=255) ggAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGCGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCa < 4:273730/149‑1 (MQ=255) tAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGttt < 1:107474/149‑1 (MQ=255) aaGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGtttt > 5:116224/1‑148 (MQ=255) aTCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGgt > 4:56048/1‑111 (MQ=255) ccTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGttttt > 8:68925/1‑122 (MQ=255) ccTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGttttt < 7:68925/122‑1 (MQ=255) cTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATaa > 7:41981/1‑148 (MQ=255) ccACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATc > 5:239904/1‑149 (MQ=255) acaACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGc < 7:311241/124‑1 (MQ=255) acaAAGATAAATAGTGGCATAACCTCCTATCATAACAGTGTAGCGACCCATCATTATCAGACTGATCAAATAACGAATGATGCAGAGACCGATAATTCAGGTATATGGATGATTTTATTTATGc > 8:311241/1‑124 (MQ=255) aaCGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGTATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATcgcg > 4:33728/1‑148 (MQ=255) aaCGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTtttat < 4:24006/116‑1 (MQ=255) aaCGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTtttat > 3:24006/1‑116 (MQ=255) aaCGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATcgcg > 1:278780/1‑148 (MQ=255) 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atcatTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtcggataatgatgggtcgctaccctgttatgagaggacgttatgccactaattatcgttgtggcagggattgctttactcctgcttttaaccataaaaattaagcttaata < 2:374590‑M2/149‑114 (MQ=255) atcatTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAAATTTGTTTACAAAATAAATAAAACCGGTCCATGt > 4:118712/1‑149 (MQ=255) gACTGAGCAAATAACGCATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGTTGTCTGGATGTTTTGATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTc > 4:144375/1‑149 (MQ=255) gACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACt > 1:310928/1‑148 (MQ=255) gACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTc > 4:271123/1‑149 (MQ=255) gACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTc > 3:61069/1‑149 (MQ=255) cAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCt > 6:35937/1‑149 (MQ=255) aaaTAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAAtttt > 1:310044/1‑101 (MQ=255) aaaTAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAAtttt < 2:310044/101‑1 (MQ=255) aTAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGaa < 6:250796/149‑1 (MQ=255) aTAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGaa < 6:116224/149‑1 (MQ=255) aCGAATGATGCAGagtcggataatgatgggtcgctaccctgttatgagaggacgttatgccactaattatcgttgtggcagggattgctttactcctgcttttaaccataaaaattaagcttaatacgtttgtttcgttaattattgt > 2:247301‑M2/1‑13 (MQ=255) aaTGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGaa < 1:75177/143‑1 (MQ=255) aaTGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGaa > 2:75177/1‑143 (MQ=255) atgatgCAGAGTCGTATAATTCAGGTTTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAAtttt < 6:89594/92‑1 (MQ=255) agagTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGAAGCATTGCCCATAGc > 6:356393/1‑149 (MQ=255) | ACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGAAGCATTGCCCATAGC > NC_000913/4521939‑4522232 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |