Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,231,314 | Δ1 bp | 5.5% | coding (129/1269 nt) | umuC → | translesion error‑prone DNA polymerase V subunit; DNA polymerase activity |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,231,314 | 0 | G | . | 5.5% | 248.0 / 7.6 | 73 | coding (129/1269 nt) | umuC | translesion error‑prone DNA polymerase V subunit; DNA polymerase activity |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/37); new base . (2/2); total (34/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.65e-01 |
GTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGTGATGTCGACGCTGGAAGAGC > NC_000913/1231166‑1231456 | gtcgtTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAg > 3:58640/1‑149 (MQ=255) aGGGGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAgg < 7:288685/149‑1 (MQ=255) gcTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCg > 7:329857/1‑149 (MQ=255) gcTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCg > 3:202901/1‑149 (MQ=255) tGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTAGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGt > 3:231791/1‑148 (MQ=255) aTGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTa < 8:44649/148‑1 (MQ=255) gCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTCTGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAACGCGCTTGGCGTTAAAATgg < 5:105317/148‑1 (MQ=255) gCCCTCTGTGATGTAAACGCGGTTTATGCCAGCTGGGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGGTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATgg < 7:150675/148‑1 (MQ=255) gCCCTCTGTGATATAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATgg < 1:293945/148‑1 (MQ=255) ctctGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGa > 7:225849/1‑149 (MQ=255) tgtgATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATcc > 1:278634/1‑149 (MQ=255) tgATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCt > 7:235852/1‑149 (MQ=255) gTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTcaaacaa > 2:150476/1‑148 (MQ=255) tttATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTcaaacaaa > 5:149831/1‑147 (MQ=255) ctaGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCg > 1:267051/3‑111 (MQ=255) ctaGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCg < 2:267051/109‑1 (MQ=255) ccAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCt < 1:265880/148‑1 (MQ=255) cAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATgg > 6:258378/1‑119 (MQ=255) cAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATgg < 5:258378/119‑1 (MQ=255) aGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGtt > 3:135653/1‑149 (MQ=255) aGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGtt < 4:135653/149‑1 (MQ=255) cTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTtc < 6:56970/149‑1 (MQ=255) agaCGTTGGTCCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTTCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAACGCGCTTGGCGTTAAAATTGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGc < 8:156060/149‑1 (MQ=255) cGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCtgt < 4:58640/149‑1 (MQ=255) tttCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGt > 6:151/1‑149 (MQ=255) tCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGGGGCGTg < 6:149831/148‑1 (MQ=255) gCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTcaaa > 6:122987/1‑116 (MQ=255) gCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGGGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTcaaa < 5:122987/116‑1 (MQ=255) ccTGATTTATGGGGTAATCCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGCTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTg > 1:52204/1‑149 (MQ=255) ccTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGAt > 5:28070/1‑123 (MQ=255) ccTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGAt < 6:28070/123‑1 (MQ=255) cTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGc < 5:151/149‑1 (MQ=255) tGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCt > 6:185248/1‑149 (MQ=255) ttATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTag > 5:371659/1‑149 (MQ=255) ttATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGATGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTag > 8:346791/1‑149 (MQ=255) aTGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTtc > 1:321084/1‑122 (MQ=255) aTGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTtc < 2:321084/122‑1 (MQ=255) tGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATCATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTagcag < 5:186660/149‑1 (MQ=255) tGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTagcag > 8:312576/1‑149 (MQ=255) gggTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAAAAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTagcagc > 5:174644/1‑148 (MQ=255) gTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGTCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAAt > 3:352712/1‑149 (MQ=255) aaCCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTAt > 7:87295/1‑149 (MQ=255) aaCCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTAt < 4:171504/149‑1 (MQ=255) ccGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGa < 4:231791/149‑1 (MQ=255) cGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAg < 4:286312/149‑1 (MQ=255) cGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAg < 7:312576/149‑1 (MQ=255) ggtggtTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGc < 2:278634/149‑1 (MQ=255) gtTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGtt > 5:144457/1‑104 (MQ=255) gtTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGtt < 6:144457/104‑1 (MQ=255) ttGTGCTATCGAATAATGACGGGTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCGTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTAc < 1:319572/149‑1 (MQ=255) tATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCtt > 3:339315/1‑121 (MQ=255) tATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCtt < 4:339315/121‑1 (MQ=255) tATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGa > 8:223102/1‑148 (MQ=255) tCGAATAATGACGGTTGCGTTATCTCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGCTCTGTTTCGTCTCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATCAGCTTTACTCAGACAt > 8:182585/1‑149 (MQ=255) gAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAAGAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGa < 8:225849/149‑1 (MQ=255) gAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGa < 2:347045/149‑1 (MQ=255) atGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAAt < 1:150476/149‑1 (MQ=255) ggTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGTCAAAGGCGATTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTGTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGt < 7:182585/149‑1 (MQ=255) ggTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTgg > 3:8024/1‑95 (MQ=255) ggTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTgg < 4:8024/95‑1 (MQ=255) ggTTGCGGTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTGCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGt < 4:202901/149‑1 (MQ=255) gTTGCGCTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGTg < 2:52204/149‑1 (MQ=255) ttGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGTGa < 8:329857/149‑1 (MQ=255) gCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGTGATg > 3:89947/1‑149 (MQ=255) aTCGCCCGAAACGCTGAGGCAAACGCGCTTGGCGTAAAAATGGGCGATCCCAGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGTGATGTCGAc > 2:286745/1‑149 (MQ=255) gCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGTGATGTCGACGCt > 4:340546/1‑149 (MQ=255) gCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGGGATGTCGACGc < 8:235852/148‑1 (MQ=255) gAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGTGATGTCGACGCTGGaa < 6:371659/149‑1 (MQ=255) gAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGTGATGTCGACGCTGGaa < 4:352712/149‑1 (MQ=255) gCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGTGATGTCGACGCTGGAAGAGc > 3:294390/1‑148 (MQ=255) gCTGA‑GCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCgg < 6:246097/125‑1 (MQ=255) gCTGA‑GCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCgg < 6:240827/125‑1 (MQ=255) gCTGA‑GCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCgg > 5:246097/1‑125 (MQ=255) gCTGA‑GCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCgg > 5:240827/1‑125 (MQ=255) | GTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGTGATGTCGACGCTGGAAGAGC > NC_000913/1231166‑1231456 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |