New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 910902 | 1956 (51.170) | coding (148/1719 nt) | poxB | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 2453 total aligned reads displayed.
TGAGCGGCAATCGCCAGTACCGGAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATCCACTCGATGGTGCCCATGCGATTAAGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGT > NC_000913/910748‑911044 | gAGCGGCAATCGCCAGTACCGGAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCAct > 1:29454/1‑149 (MQ=255) ggCAATCGCCAGTACCGGAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCActtctt < 5:17682/149‑1 (MQ=255) gCAATCGCCAGTACCGGAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACttcttc > 3:84115/1‑149 (MQ=255) ccAGTACCGGAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCgtggcgg < 4:50769‑M2/149‑8 (MQ=255) ccAGTACCGGAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCgt < 2:198169‑M2/144‑3 (MQ=255) cAGTACCGGAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACgaagaagtggcggc > 4:96286‑M1/1‑135 (MQ=255) cAGTACCGGAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCggg < 7:34232/149‑1 (MQ=255) aGTACCGGAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCGGGt > 1:15695/1‑149 (MQ=255) tACCGGAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCGGGTgg < 2:48656/149‑1 (MQ=255) ccGGAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACgaagaagtggcggcctttg < 5:121078‑M1/149‑20 (MQ=255) ggAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACAt > 2:155686/1‑149 (MQ=255) gAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACgaagaagtggcggcctttgccg < 8:72379‑M1/149‑23 (MQ=255) gAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATc < 6:189855/149‑1 (MQ=255) gAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATc > 8:153466/1‑149 (MQ=255) tGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATCCACTc < 4:1081/149‑1 (MQ=255) ggTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATCCACTCGATg < 3:148342/146‑1 (MQ=255) ggTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATCCACTCGATg > 4:148342/1‑146 (MQ=255) tGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATCCACTCGATGGTGcc < 1:181506/149‑1 (MQ=255) gCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATCCACTCGATGGTGccc < 1:110819/148‑1 (MQ=255) tcgaatcggcaggggtgaaacgcatctggggagtcacaggcgactctctgaacggtcttagtgacagtcttaatcgcatgggcaccatcgagtggatgtccacCCGCCACTTCTTCGTGGCggg < 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ccgccACgaagaagtggcggcctttgccgctggcgctgaagcacaacttagcggagaactggcggtctgcgccggatcgtgcggccccggcaacctgcacttaatcaacggcctgttcgattgccaccgcaatcacgttccggtactgg < 1:208974‑M1/149‑143 (MQ=255) cgccACgaagaagtggcggcctttgccgctggcgctgaagcacaacttagcggagaactggcgggctgcgccggatcgtgcggccccggcaacctgcacttaatcaacggcctgttcgattgccaccgcaatcacgttccggtactggc < 3:16161‑M1/149‑144 (MQ=255) CGCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATCCACTCGATGGTGCCCATGCGATTAAGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCt < 6:23177‑M1/85‑1 (MQ=255) GCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATCCACTCGATGGTGCCCATGCGATTAAGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTg > 5:75674‑M1/1‑142 (MQ=255) GCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATCCACTCGATGGTGCCCATGCGATTAAGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGt < 1:122748‑M1/149‑1 (MQ=255) ccACgaagaagtggcggcctttgccgctggcgctgaagcacaacttagcggagaactggcggtctgcgccggatcgtgcggccccggcaacctgcacttaatcaacggcctgttcgattgccaccgcaatcacgttccggtactggcga < 6:3526‑M1/149‑146 (MQ=255) CACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATCCACTCGATGGTGCCCATGCGATTAAGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCa < 5:108139‑M1/104‑1 (MQ=255) | TGAGCGGCAATCGCCAGTACCGGAACGTGATTGCGGTGGCAATCGAACAGGCCGTTGATTAAGTGCAGGTTGCCGGGGCCGCACGATCCGGCGCAGACCGCCAGTTCTCCGCTAAGTTGTGCTTCAGCGCCAGCGGCAAAGGCCGCCACTTCTTCGTGGCGGGTGGACATCCACTCGATGGTGCCCATGCGATTAAGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGT > NC_000913/910748‑911044 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |