| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 755,709 | Δ75 bp | coding (150‑224/348 nt) | sdhD → | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 755709 | 755783 | 75 | 40 [0] | [0] 40 | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 755708 | 0 (0.000) | 38 (1.050) | 33/238 | 0.2 | 100% | coding (149/348 nt) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| ? | NC_000913 | 755784 = | 0 (0.000) | coding (225/348 nt) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 | |||||
CGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTT > NC_000913/755639‑755930 | taagcaacgcctccgcattaggacgcaatggcgtacatgatttcatcctcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCAtg > 4:136828‑M2/146‑149 (MQ=255) acgcctccgcattaggacgcaatggcgtacatgatttcatcctcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAg < 3:136828‑M2/10‑1 (MQ=255) cgcattaggacgcaatggcgtacatgatttcatcctcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGa < 5:1945‑M2/17‑1 (MQ=255) 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8:87447‑M2/62‑1 (MQ=255) acgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCAc < 6:73194‑M2/77‑1 (MQ=255) acgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCAc < 6:156952‑M2/77‑1 (MQ=255) tctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGtt > 8:120488‑M2/68‑140 (MQ=255) tctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGtt < 7:120488‑M2/73‑1 (MQ=255) tacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTggtggt > 1:122275‑M2/66‑149 (MQ=255) 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taccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgt > 2:51495‑M2/37‑149 (MQ=255) cagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTggg < 5:120979‑M2/116‑1 (MQ=255) gcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtgtg > 1:69979‑M2/29‑149 (MQ=255) acatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgatga < 1:51495‑M2/127‑1 (MQ=255) tgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGcc < 2:69979‑M2/134‑1 (MQ=255) 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CGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTT > NC_000913/755639‑755930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |