New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 438164 = | 180 (0.900) | 13 (0.070) | 9/292 | 23.0 | 6.7% | intergenic (‑29/+151) | yajO/dxs | 2‑carboxybenzaldehyde reductase/1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑requiring |
? | NC_000913 | 438263 = | 187 (0.960) | intergenic (‑128/+52) | yajO/dxs | 2‑carboxybenzaldehyde reductase/1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑requiring | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
TAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAAAGAAGT > NC_000913/438118‑438412 | tAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAattatt > 1:1014280/1‑150 (MQ=255) gggggTTGTATGGCGTGGGGCCGGTCCGGGTGTGCTCGTCATACTTCAAGTGGCATGTGGTGCGGCTGCATTCGTTCGCCCCAGTCACTTACTTATGTAGGCTCCTGGTGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTa < 2:1167055/149‑1 (MQ=14) aGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCGGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTa < 1:672858/150‑1 (MQ=255) aGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTa < 2:20296/150‑1 (MQ=255) aGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTa < 1:2098455/150‑1 (MQ=255) aGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTa > 2:1564031/1‑150 (MQ=255) gggTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTaga < 2:615853/150‑1 (MQ=255) ggtGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGt < 2:1221815/148‑1 (MQ=255) gTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGt > 1:1916099/1‑150 (MQ=255) gTTGTATCGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATGCTTTAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCCCCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTACTGGGGCTTCACTCGTCTGCCGCCTTCCTGCCACTCGACTCATTTagagg > 4:513206/1‑149 (MQ=18) ctATTGCATGCTGCCACTCATGCTATAATCGTCATAC‑TCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCCCTCGTTTGCCGCCTTCATGCAACTCGACTTATTTAAAGTCTAt > 2:1806695/2‑150 (MQ=18) tATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTAt > 3:389942/1‑150 (MQ=255) tATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTAt > 4:540952/1‑150 (MQ=255) aTTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATg < 1:178706/150‑1 (MQ=255) cATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGaata > 2:1528804/1‑150 (MQ=255) tgctgcCCCGCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGaataat < 2:43341/150‑1 (MQ=255) tgcCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTc > 3:527225/1‑150 (MQ=255) ccACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCtt < 2:1014038/150‑1 (MQ=255) aCTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTaa < 3:560346/150‑1 (MQ=255) aCTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTaa > 1:318209/1‑150 (MQ=255) cTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAg < 2:1339808/150‑1 (MQ=255) cTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAg > 2:248326/1‑150 (MQ=255) cTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAg > 2:879462/1‑150 (MQ=255) cTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAAAGTCTATGAATAATTTCTTAAg > 2:1750344/1‑150 (MQ=255) cTCCTGCTATACTCATCATACTTAAAGTTGTATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAATCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTACCTGCAACTCGAATTATTTATAGTCTATGAATAATTTCTTAAg < 2:693173/150‑1 (MQ=18) tCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGc > 1:538324/1‑150 (MQ=255) cTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCAt > 1:1824418/1‑150 (MQ=255) cTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCAt < 1:577491/150‑1 (MQ=255) tGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATa > 1:1610179/1‑150 (MQ=255) cTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGc > 4:664553/1‑150 (MQ=255) cTATACTCGTCATACTTCAAATTGCATGTGCTGCGGCTGCATACTAAAACCACAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAACAATTTAGAGACTATGAATAATTTCTTAAGCATAGc > 2:1587460/1‑150 (MQ=17) taCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGCCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAgg > 1:2073366/1‑150 (MQ=255) cGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAggagtg < 4:29717/150‑1 (MQ=255) 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cTCGTTTGCCGCCGTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCCGGAGGGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCGTTGATTTTGGCTTCCAGACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATttct < 1:1681871/150‑1 (MQ=255) tCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATttctt > 3:455622/1‑150 (MQ=255) gTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCTAGCACGAGTTCGGCGCGCATTTCTTcc > 1:784690/1‑150 (MQ=255) gTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTcc > 1:1382424/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCTTCCTGCAACTCGAAGTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGGGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGa > 1:1521613/1‑150 (MQ=255) cgccTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGtt > 2:1424199/1‑150 (MQ=255) gccTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTc > 1:1694950/1‑150 (MQ=255) ccTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTcc < 2:94335/150‑1 (MQ=255) ttCCTGCNACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCTTTCCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCtt < 2:1708966/150‑1 (MQ=255) tCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTg > 1:367153/1‑150 (MQ=255) 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aCTTGAAGTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATa > 2:1158774/1‑150 (MQ=255) cTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATaa > 1:187498/1‑150 (MQ=255) tCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATaaa < 1:2174465/150‑1 (MQ=255) cGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAaag < 2:1006318/150‑1 (MQ=255) gAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAaaga > 1:306003/1‑150 (MQ=255) 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aaTTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAaagaa < 2:2097583/150‑1 (MQ=255) aaTTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGAGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGTTTTTTGCTTCCATACCAGCGGCATCTAGGCCGAGTTCGGCTCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAaagaa > 4:849657/1‑150 (MQ=255) | TAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAAAGAAGT > NC_000913/438118‑438412 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |