| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2700077 | 128 (1.320) | 6 (0.070) | 6/246 | 10.0 | 4.7% | intergenic (+154/+40) | yfhL/shoB | putative 4Fe‑4S cluster‑containing protein/toxic membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 2700087 | 127 (1.440) | intergenic (+164/+30) | yfhL/shoB | putative 4Fe‑4S cluster‑containing protein/toxic membrane protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2699921‑2700077‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaggtgcgtccgGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTGGGCAGATACTATATAAATTAACTTAGTGAATGATTATGCTAATGTCATCAATTAAATAAATATAATGGCGTTAAGGCTTCCCAGTAATATAATTAATACTC < NC_000913/2700087‑2699942 TAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAG < 1:112320/148‑1TAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAG < 6:111471/148‑1 AATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGG < 3:247002/148‑1 ATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGT < 6:50464/148‑1 TTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGT < 8:423457/149‑1 TTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGT > 8:195345/1‑149 TCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTC > 3:138171/1‑149 TACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCC > 7:260279/1‑148 TCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGT < 7:301345/139‑1 TCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGT > 8:301345/1‑139 CTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAACTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACT < 1:296385/149‑1 TGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAA < 2:351177/108‑1 TGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAA > 1:351177/1‑108 GGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACT > 2:296385/1‑146 GCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTG > 5:360038/1‑149 GCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAA < 2:388397/94‑1 GCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAA > 1:388397/1‑94 CCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTGG < 6:360038/149‑1 ATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTGGGCAGATACTATATAAA > 5:76282/1‑140 ATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAAATATAAATAAGTGTCTGGGCAGATACTATATAAA < 6:76282/140‑1 AAGGTGCGTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTGGGCAGATACTATATAAATTAA < 1:59552/78‑1 AAGGTGCGTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTGGGCAGATACTATATAAATTAA > 2:59552/1‑78 AGGTGCGTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTGGGCAGATACTATATAAATTAACTTAGTGAATGATTATGCTAATGTCATCAATTAAATAAATATAATGGCGTTAAGGCTTCCCAGTAATATAA < 8:93835/148‑1 GGTGCGTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTGGGCAGATACTATATAAATTAACTTAGTGAATGATTATGCTAATGTCATCAATTAAATAAATATAATGGCGTTAAGGCTTCCCAGTAATATAATT < 1:283833/149‑1 GTGCGTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTGGGCAGATACTATATAAATTAACTTAGTGAATGATTATGCTAATGTCATCAATTAAATAAATATAATGGCGTTAAGGCTTCCCAGTAATATAATT > 8:260279/1‑148 GTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTGGGCAGATACTATATAAATTAACTTAGTGAATGATTATGCTAATGTCATCAATTAAATAAATATAATGGCGTTAAGGCTTCCCAGTAATATAATTAATAC > 5:301217/1‑149 GTCCGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTGGGCAGATACTATATAAATTAACTTAGTGAATGATTATGCTAATGTCATCAATTAAATAAATATAATGGCGTTAAGGCTTCCCAGTAATATAATTAATAC > 3:21475/1‑149 CGGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTGGGCAGATACTATATAAATTAACTTAGTGAATGATTATGCTAATGTCATCAATTAAATAAATATAATGGCGTTAAGGCTTCCCAGTAATATAATTAATACTC < 5:129181/148‑1 TAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2699921‑2700077‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaggtgcgtccgGTGAACCAGTCGGACGCACCTTTAATAACTATAAATAAGTGTCTGGGCAGATACTATATAAATTAACTTAGTGAATGATTATGCTAATGTCATCAATTAAATAAATATAATGGCGTTAAGGCTTCCCAGTAATATAATTAATACTC < NC_000913/2700087‑2699942 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |