Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,501,325 | G→A | 5.1% | Q251Q (CAG→CAA) | tehA → | potassium‑tellurite ethidium and proflavin transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,501,325 | 0 | G | A | 5.1% | 251.8 / 2.3 | 78 | Q251Q (CAG→CAA) | tehA | potassium‑tellurite ethidium and proflavin transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/38); new base A (2/2); total (38/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.71e-01 |
ATTCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTTTATTATTGCA > NC_000913/1501179‑1501469 | aTTCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGc > 5:221056/1‑148 (MQ=255) ttCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCa > 6:113465/1‑149 (MQ=255) ttCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGGTATGGACTGCTGCCACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCAATGGGATCTCTCCCAGCCa > 4:237870/1‑149 (MQ=255) tCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGCGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCAt > 6:329111/1‑149 (MQ=255) aGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTTGTGGCTGGGTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGGTGGCTAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCAtt < 3:192179/148‑1 (MQ=255) aGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTTCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCAtt < 4:132493/148‑1 (MQ=255) aGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCAtt > 1:31697/1‑148 (MQ=255) ctctctcCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTaa < 3:97126/149‑1 (MQ=255) gctcCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAACCATTTAATGc > 2:15721/1‑149 (MQ=255) gctcCTGCGCTGGTGGATTCTAGTCCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTAATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAACCATTTAATGc > 2:22096/1‑149 (MQ=255) gCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGttt < 1:56466/149‑1 (MQ=255) gCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGtt > 2:231748/1‑148 (MQ=255) cTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTtc < 1:231748/149‑1 (MQ=255) ttGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGATACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTtct < 8:221325/149‑1 (MQ=255) ttGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTCCGGTTATGGACTGCTGCGACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTtct > 2:298829/1‑149 (MQ=255) tAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGt > 3:242188/1‑149 (MQ=255) aGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGtt > 5:305842/1‑149 (MQ=255) gTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGt < 5:25955/147‑1 (MQ=255) gTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGt > 6:25955/1‑147 (MQ=255) ccTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGc < 2:31697/149‑1 (MQ=255) cTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCg > 2:143949/1‑149 (MQ=255) tGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCg > 5:136622/1‑148 (MQ=255) tGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAAt > 8:401096/1‑116 (MQ=255) tGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAAt < 7:401096/116‑1 (MQ=255) tGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGa < 3:273753/129‑1 (MQ=255) tGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGa > 4:273753/1‑129 (MQ=255) tGAGCGACAACGGCGGCGAGGGAGCCACGCTGGCGAAAATGCTTTACGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTCTTTATGCTACGTCTGATGCCATGCTAACTCTCCCCGCCATTAAATGCTTCATACTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTAACt > 6:60421/1‑149 (MQ=255) gCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCa > 5:378451/1‑149 (MQ=255) cGTCAACGGCGGCGAGGGTGACTCGCTGGCGAAAATGGTTTTCGGTTTTGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCGATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCAc < 3:195765/149‑1 (MQ=255) aCGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGc > 1:30467/1‑148 (MQ=255) aCGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGc > 3:145211/1‑148 (MQ=255) ggcggcGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAac < 5:86585/149‑1 (MQ=255) cggcgAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAacca > 1:241020/1‑149 (MQ=255) gggTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGtt > 3:38350/1‑149 (MQ=255) ggTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCCACCACCGGttt < 6:221056/149‑1 (MQ=255) ggTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGttt < 3:1715/149‑1 (MQ=255) tGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTg > 3:163758/1‑148 (MQ=255) gACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCa > 6:171958/1‑149 (MQ=255) cTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTggg < 3:50104/149‑1 (MQ=255) ggCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTggg > 5:286477/1‑147 (MQ=255) gCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGa < 2:30467/148‑1 (MQ=255) aaaTGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGc < 1:143949/149‑1 (MQ=255) cTTTCCGGTTATGGACTGCTGCGACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGa < 1:298829/149‑1 (MQ=255) tCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATaa < 5:329111/148‑1 (MQ=255) ggTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATgg < 6:305842/149‑1 (MQ=255) gTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCAGGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGATTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGa < 6:153338/149‑1 (MQ=255) ttATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGAt > 4:280928/1‑149 (MQ=255) ttATGGACTGCAGCACCTGCTGTTTATGCTACGTCGGATGCCATGGAATCGCTCCCAGCCAGTAAATGCTTCATTCTGGAGTTGCGCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTGTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGAt < 1:284307/149‑1 (MQ=255) tgctgcAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCa > 7:178561/1‑148 (MQ=255) tgctgcAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCa > 5:37032/1‑148 (MQ=255) ctgcAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATAc > 1:24879/1‑149 (MQ=255) aCTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTgg < 4:38350/149‑1 (MQ=255) gctgTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCgg > 8:385744/1‑149 (MQ=255) gTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGc > 4:84283/1‑149 (MQ=255) tATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGGTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGc > 2:67797/1‑149 (MQ=255) tATGCTACGTCTCATGACATGGTTTCTCTACCAGCGATTTATTGGTTGATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGGAACCACGGGTTTGCTTGTGGGTAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCGATACGCTGGCGGTGCCg < 5:60421/148‑1 (MQ=255) gCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTg < 3:361463/148‑1 (MQ=255) cTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAAt > 1:348836/1‑117 (MQ=255) cTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAAt < 2:348836/117‑1 (MQ=255) gTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATc < 5:171958/149‑1 (MQ=255) aTGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCATCCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCGGCTGTTTATCTTTa < 4:145211/148‑1 (MQ=255) aTGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCttt < 1:67797/147‑1 (MQ=255) aTGCCATGGTATCTCTCCCAACCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTTGGGAGTGGCAGCGAAAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTAc < 1:15721/149‑1 (MQ=255) aTGCCATGGTATCTCTCCCAACCATTTAATGCTTCATTCTGGAGGTTCTGGTTGGGCGTATCTGCACTGGCAACGACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTAc < 1:22096/149‑1 (MQ=255) aTGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTc > 4:170401/1‑112 (MQ=255) aTGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTc < 3:170401/112‑1 (MQ=255) aTGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAAtt > 2:173500/1‑149 (MQ=255) aTGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACAAAtt > 4:305270/1‑149 (MQ=255) tGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGc < 1:155866/118‑1 (MQ=255) tGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGc > 2:155866/1‑118 (MQ=255) gTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCATCTATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTtta < 3:237870/149‑1 (MQ=255) gTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTtta < 5:113465/149‑1 (MQ=255) tcCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTttatta < 3:276461/145‑1 (MQ=255) tcCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTTTattatt < 4:242188/147‑1 (MQ=255) tcCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTTTATTATTg > 6:65557/1‑148 (MQ=255) tcCCAGCAATTTAATGCTTCATTCTGGAGGTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCAGCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGAGTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTTtattat < 6:378451/146‑1 (MQ=255) ccAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTTTATTATTg < 7:385744/146‑1 (MQ=255) ccAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTTTATTATTGCa < 6:286477/148‑1 (MQ=255) | ATTCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTTTATTATTGCA > NC_000913/1501179‑1501469 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |