New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1722616 = | 97 (0.970) | 6 (0.070) | 6/258 | 10.5 | 6.4% | coding (496/2013 nt) | ydhK | putative efflux protein (PET) component of YdhJK efflux pump |
? | NC_000913 | = 1722612 | 86 (0.940) | coding (492/2013 nt) | ydhK | putative efflux protein (PET) component of YdhJK efflux pump | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GAATAACGTCGCGTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCACATG > NC_000913/1722465‑1722751 | gAATAACGTCGCGTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCa > 4:244574/1‑149 (MQ=255) tAACGTCGCGTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCatga < 6:289666/149‑1 (MQ=255) tAACGTCGCGTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCatga > 1:269010/1‑149 (MQ=255) tAACGTCGCGTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCatga < 8:231848/149‑1 (MQ=255) aCGTCGCGTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCatgatg < 4:42507/149‑1 (MQ=255) aTTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGc > 5:39795/1‑149 (MQ=255) aTTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGc > 3:194360/1‑149 (MQ=255) tttCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGTCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGcc > 7:251995/1‑149 (MQ=255) tttCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGAGGATGATCCTGcc > 7:308907/1‑149 (MQ=255) tCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGACAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGAGGCATGATGATGATGATCCTgac > 2:216931/1‑145 (MQ=255) aaCTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGc < 5:58292/144‑1 (MQ=255) aaCTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGc > 6:58292/1‑144 (MQ=255) aaCTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAg < 7:227836/148‑1 (MQ=255) aaCTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAg > 3:56775/1‑148 (MQ=255) aaCTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGc < 2:162998/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGGCTAGACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAg < 5:74115/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAg > 8:237015/1‑149 (MQ=255) tGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGt > 1:117029/1‑149 (MQ=255) gCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGtt < 5:356744/148‑1 (MQ=255) gCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTc > 8:271514/1‑149 (MQ=255) tACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTGCTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGc > 2:54514/1‑149 (MQ=255) ccATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCatgatgat < 4:143042/112‑1 (MQ=255) ccATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGccc < 7:305409/147‑1 (MQ=255) ccATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGC‑‑‑ATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCtttt > 4:45465/1‑148 (MQ=255) atcatcGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCtttt < 8:68006/149‑1 (MQ=255) atcGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAAc > 7:137413/1‑149 (MQ=255) gCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCg > 3:236434/1‑148 (MQ=255) ccTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATgatgatgatgat > 8:348890/1‑109 (MQ=255) ccTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATgatgatgatgat < 7:348890/109‑1 (MQ=255) cTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCAt < 4:191323/149‑1 (MQ=255) cTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCAt < 4:185128/149‑1 (MQ=255) tttCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCAtt > 8:157542/1‑149 (MQ=255) cGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTTCCCTTTTAACCGCATTGaa < 1:216931/148‑1 (MQ=255) cGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGaaa < 1:268300/149‑1 (MQ=255) gATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGC‑‑‑ATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACa < 3:45465/149‑1 (MQ=255) aTGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCTGTCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGATCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGaaaaa < 8:320269/149‑1 (MQ=255) gTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACAt > 2:374008/1‑149 (MQ=255) gTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATAGCTCAGGCGCGCGTTTGAGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGAGGCATGATGATGATGATCCTTCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCTTTGAAAAACAt > 3:240784/1‑149 (MQ=255) ttAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATg < 7:237015/149‑1 (MQ=255) aaTATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCa > 8:338553/1‑149 (MQ=255) atatTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCa < 3:244574/148‑1 (MQ=255) aCTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGccc < 4:194360/148‑1 (MQ=255) aCTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGC‑‑‑ATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGc > 5:50334/1‑125 (MQ=255) aCTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGC‑‑‑ATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGc < 6:50334/125‑1 (MQ=255) cTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCatgat > 6:89558/1‑79 (MQ=255) cTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCatgat < 5:89558/79‑1 (MQ=255) cTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGa > 3:53785/1‑149 (MQ=255) cTGAGGCCAGCAAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGCGGTAATAGTCGGGATTTTGTGCGGCGGCAGGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACCTGCACGCCCgc > 4:98383/1‑148 (MQ=255) tGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTc < 4:197449/102‑1 (MQ=255) tGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTc > 3:197449/1‑102 (MQ=255) cagccagcTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGa > 6:318426/1‑99 (MQ=255) cagccagcTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGa < 5:318426/99‑1 (MQ=255) cagccagcTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTgg < 8:137413/149‑1 (MQ=255) cagccagcTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTg > 7:57057/1‑148 (MQ=255) agccagcTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTgg > 3:310106/1‑148 (MQ=255) cagcTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAAc > 6:161016/1‑148 (MQ=255) cagcTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAAc < 5:161016/148‑1 (MQ=255) agcTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGC‑‑‑ATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGc > 2:105902/1‑148 (MQ=255) gtgGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACCCCCGATTACTGGAACATGCCa < 8:308907/149‑1 (MQ=255) tgGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCa > 7:244359/1‑111 (MQ=255) tgGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCa < 8:244359/111‑1 (MQ=255) tgGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCa < 8:251995/148‑1 (MQ=255) tgGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACAGGAACATGCCAg > 5:226854/1‑149 (MQ=255) ggATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGtt < 4:328367/149‑1 (MQ=255) atatCGCTGAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGTTATTTTGTGCGGCGGGATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCACATTGAAAAACATGGACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTa < 5:55571/149‑1 (MQ=255) atatCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGACCAGTTCCGATGCTACTGCCCGTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTa > 6:176856/1‑149 (MQ=255) tCGCTCAGGCGCGCGTTTTCGAGGTAATAGTCGTTATTTTGTGCGGAGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTAct < 2:117029/148‑1 (MQ=255) tCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTActc < 7:338553/149‑1 (MQ=255) gCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTg < 1:374008/149‑1 (MQ=255) cTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTgg < 4:56775/149‑1 (MQ=255) cTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTgg < 7:157542/149‑1 (MQ=255) cggCGCGCGTTTGCGATGTAATAGGCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGc < 6:39795/146‑1 (MQ=255) aGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGc < 8:202153/147‑1 (MQ=255) aGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGC‑‑‑ATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGcc < 1:105902/148‑1 (MQ=255) cgcgTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCa < 2:116721/93‑1 (MQ=255) cgcgTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCa > 1:116721/1‑93 (MQ=255) agcgTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGAATCAAGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCAATTAAAAACAAGCCCGCCCGATTACTGTAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTg > 4:292821/2‑148 (MQ=255) gcgTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGaa < 7:271514/149‑1 (MQ=255) gcgTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGaa < 4:53785/149‑1 (MQ=255) gcgTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGa > 8:236472/1‑148 (MQ=255) tGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGaaaaa > 1:163592/1‑95 (MQ=255) tGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGaaaaa < 2:163592/95‑1 (MQ=255) gCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAaacaac < 4:236434/148‑1 (MQ=255) gAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCAGGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTAAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGa < 4:16227/149‑1 (MQ=255) aGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGAt > 1:281543/1‑149 (MQ=255) gTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTTCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCTTTGAAAAACATGCACGCGCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGc < 3:292821/149‑1 (MQ=255) tAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGcc < 8:57057/149‑1 (MQ=255) tAATAGGCGGTATTTTGTGCGGAGGCATGATGATGTTTATCCTGCCGAGCAGTTCCGTTGGTACTGCCCTTTTAACCGGATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGTACCTGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGATTCATCCGATGcc < 6:226854/149‑1 (MQ=255) aaTAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGaaa < 6:81462/137‑1 (MQ=255) aaTAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGcaa > 3:319710/1‑147 (MQ=255) aaTAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCAGaaa > 5:81462/1‑137 (MQ=255) ggTATTTTGTTCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTg < 4:240784/148‑1 (MQ=255) ggTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTgc < 1:54514/149‑1 (MQ=255) gTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTgca < 3:384579/149‑1 (MQ=255) tATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCAATTCGTgcag < 4:319710/149‑1 (MQ=255) ttttGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTgcagca > 2:23229/1‑149 (MQ=255) ttGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGcac < 7:236472/148‑1 (MQ=255) ttGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTATTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGcac < 3:138736/148‑1 (MQ=255) tgCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCACATg > 7:13769/1‑148 (MQ=255) gcggcgGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTg < 4:114379/109‑1 (MQ=255) | GAATAACGTCGCGTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCACATG > NC_000913/1722465‑1722751 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |