Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,806,309 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (‑226/‑58) | ydiY ← / → pfkB | acid‑inducible putative outer membrane protein/6‑phosphofructokinase II |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1397238 | NA (NA) | 98 (0.980) | 71/280 | 0.4 | 99.0% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1806312 | 1 (0.010) | intergenic (‑229/‑58) | ydiY/pfkB | acid‑inducible putative outer membrane protein/6‑phosphofructokinase II | |||||
* | ? | NC_000913 | 1806309 = | 1 (0.010) | 72 (0.720) | 52/280 | 1.3 | 98.6% | intergenic (‑226/‑61) | ydiY/pfkB | acid‑inducible putative outer membrane protein/6‑phosphofructokinase II |
? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
AAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1397092‑1397238 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTATTCGCGCCTTTTTATAATTCGTTACCTTT < NC_000913/1806312‑1806165 AAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGCCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTGCCT > 4:320148/1‑148 AAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTT < 1:291383/149‑1 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AAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATA > 4:216501/1‑148 AAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATA > 1:48287/1‑148 AAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATAT > 8:37961/1‑143 AAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATAT < 7:37961/143‑1 AAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTA < 7:204116/96‑1 AGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGA < 5:301043/135‑1 AGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGA > 6:301043/1‑135 GGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAA > 7:129875/1‑148 TTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAA < 3:240459/149‑1 GGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTG < 5:237738/149‑1 GAGATATAATCGGCGCACACATGATGAAATGTAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGGTTATTCGCCCCTTCCTTTACAATATGAATTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGTTTAATATATATAAATAAAAATGTGTT > 2:281089/1‑149 GAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTT > 7:200993/1‑149 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ATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTAGTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCA > 4:356886/1‑148 AGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGTAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACTTGCTTATTCAAAAAA < 6:289721/149‑1 AGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAA < 2:423105/148‑1 GAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAAT < 3:162139/149‑1 GAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAA > 7:68198/1‑146 GAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAA < 8:68198/146‑1 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GAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTA > 5:266071/1‑149 AAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTAT > 1:348604/1‑149 AAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTAT > 5:153746/1‑149 GAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTATTC > 8:292044/1‑149 taCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGAAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTATTCGCGC < 5:309701/146‑1 TCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTAAAAAAATGCAATAAAAAATCATTGATAAGTTATTCGCGgc > 2:278619/1‑147 caGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTATTCGCGCCTTT < 8:129875/147‑1 CCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGA < 1:359489/115‑1 CCGCTTATTCGCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGA > 2:359489/1‑115 TTATTCGCACCTTCATTAACAATATGATTTATTGGATCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCACCACAGGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTATTCGCGCCTTTTT < 1:276258/147‑1 TTCGCACCTTCCTTAACAGTATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGTAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTATTCGCGCCTTTTTATAA < 8:275047/148‑1 GCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAATTTATTCGCTCATTTTTATAATTCG > 1:315559/1‑149 GCACCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTAGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTATTCGCGCCTTTTTATAATTag < 4:48413/149‑3 CCTTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTATTCGCGCCTTTTTATAATTCGTTA < 1:320936/149‑1 TTCCTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAATTGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTATTCGCGCCTTTTTATAATTCGTTACC > 4:291327/1‑149 CTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTATTCGCGCCTTTTTATAATTCGTTACCTTT > 6:27979/1‑149 CTTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAAAACATTGCTAAGTTATTGGCGCCTTTTTATAATTCGTTACCTTT > 2:310320/1‑149 AAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1397092‑1397238 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACAATATGATTTATTGGAGCTTTATTTAAAATTTTGCAGATAAATATATATAAATAAAAATCTGTTTTCGCCACATGCTTATTCAAAAAATGAAATAAGAATACATTGCTAAGTTATTCGCGCCTTTTTATAATTCGTTACCTTT < NC_000913/1806312‑1806165 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |