| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 1757141 = | 90 (0.990) | 5 (0.060) | 5/244 | NT | 5.7% | intergenic (+31/‑280) | pykF/lpp | pyruvate kinase I/murein lipoprotein |
| ? | NC_000913 | 1757161 = | 80 (0.940) | intergenic (+51/‑260) | pykF/lpp | pyruvate kinase I/murein lipoprotein | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
AGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGA > NC_000913/1757013‑1757306 | agagCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCttt > 6:21541/1‑149 (MQ=255) gagCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCtttt > 3:379620/1‑149 (MQ=255) agCGGTCTGGCACACAAATGTGACGTTGTAGTTATGGGATCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCttttt < 2:160206/149‑1 (MQ=255) 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tGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTtttattt > 2:204401/1‑148 (MQ=255) gCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTaa < 1:760/148‑1 (MQ=255) cacacaAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATc < 6:308808/149‑1 (MQ=255) acaAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATc < 1:1229/146‑1 (MQ=255) ttATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAAGCAGAAGCAATaaaaa > 5:180332/1‑149 (MQ=255) ggTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAaaatc < 4:379620/148‑1 (MQ=255) ggTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAaaatc > 4:54682/1‑148 (MQ=255) tCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAaaatcaaat < 7:126643/148‑1 (MQ=255) gTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGAt > 7:182204/1‑149 (MQ=255) aCTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCa > 6:406314/1‑149 (MQ=255) 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> 3:11051/1‑142 (MQ=255) cGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAAtctc < 5:412795/149‑1 (MQ=255) gCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCAc > 1:71680/1‑149 (MQ=255) tactaACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTa > 4:47462/1‑149 (MQ=255) taACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATc > 5:337316/1‑148 (MQ=255) aaCACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCt > 1:423860/1‑148 (MQ=255) acacCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCt < 3:254417/147‑1 (MQ=255) acacCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTaa < 2:423860/149‑1 (MQ=255) acacCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACAAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTaa < 2:272881/149‑1 (MQ=255) acacCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATATGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCt > 8:393908/1‑147 (MQ=255) tatagtgaaatccgatttgattttttattgcttctggttatcgattaaataaaaaAAGCGCCCGGATGGGCGGGGTTTTTATTTAATCGAGAACCAGAAGGAATTAAAAATCAAATCGGATTTGACGAGATAATCTCACTgtatcgaat < 8:105199‑M1/94‑5 (MQ=255) 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2:116645/137‑1 (MQ=255) atCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAAttttt > 1:116645/1‑137 (MQ=255) tCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTa < 8:215249/143‑1 (MQ=255) tCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTa > 7:215249/1‑143 (MQ=255) aaaaagcgcccatcagggcgcttTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAAcc > 4:195211‑M2/24‑148 (MQ=255) gAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCa < 5:310077/148‑1 (MQ=255) CCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCTCTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGa > 1:204401‑M1/1‑149 (MQ=255) CCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGa > 4:21928‑M1/1‑149 (MQ=255) CCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGa < 2:413205‑M1/149‑1 (MQ=255) CCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGa > 2:389128‑M1/1‑149 (MQ=255) CCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATAGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGa > 6:26095‑M1/1‑149 (MQ=255) gATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGc > 1:242606/1‑149 (MQ=255) aTGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGct > 3:131154/1‑149 (MQ=255) ggcgcttTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGcttct > 1:173179‑M2/8‑149 (MQ=255) ggcgcttTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGcttct > 5:362087‑M2/8‑149 (MQ=255) ggcgcttTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGcttct > 6:404669‑M2/8‑149 (MQ=255) tctattTTTTTATTTAATCGATAACCATAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATTAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGcttctt < 2:71680‑M2/143‑1 (MQ=255) gcgcttTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAATAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAATATGAATCCGATGGAAGCAGCCTGTTTTCTATCAATTATTATATCTAAAAACCAGCGTTCGCtgattcat > 8:294071‑M2/7‑147 (MQ=255) gcgcttTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGcttctt > 2:215931‑M2/7‑149 (MQ=255) gcgcttTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGcttctt > 2:16856‑M2/7‑149 (MQ=255) cgcttTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCttt < 3:170115‑M2/144‑1 (MQ=255) cttTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGcttc < 1:140797‑M2/141‑1 (MQ=255) cttTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGcttc > 2:140797‑M2/4‑144 (MQ=255) cttTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGa < 1:16856‑M2/146‑1 (MQ=255) | AGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGA > NC_000913/1757013‑1757306 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |