| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,863,131 | Δ1 bp | 5.7% | coding (361/996 nt) | gapA → | glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,863,131 | 0 | G | . | 5.7% | 241.8 / 7.1 | 70 | coding (361/996 nt) | gapA | glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/32); new base . (2/2); total (36/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGTTACCGCTGAACGTGATCCGGCTAACCTGAAATGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATC > NC_000913/1862989‑1863277 | tgtTACCGCTGAACGTGATCCGGCTAACCTGAAATGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCCCCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCg > 6:378207/1‑148 (MQ=255)tgtTACCGCTGAACGTGATCCGGCTAACCTGAAATGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCg < 1:211384/148‑1 (MQ=255) tACCGCTGAACGTGATCCGGCTAACCTGAAATGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTc > 6:286219/1‑147 (MQ=255) ccGCTGAACGTGATCCGGCTAACCTGAAATGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTaa < 2:57756/148‑1 (MQ=255) gCTGAACGTGATCCGGCTAACCTGAAATGGGACGAAGTTGGTGTCGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCCCCGCTGCTGCGAATAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAg < 6:7292/148‑1 (MQ=255) aCGTGATCCGGCTAACCTGAAATGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGacaac < 7:88262/148‑1 (MQ=255) ccGGCTAACCTGAAATGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGa > 1:128277/1‑148 (MQ=255) aCCTGAAATGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTTGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGt < 1:268313/148‑1 (MQ=255) aCCTGAAATGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGt < 2:128277/148‑1 (MQ=255) ccTGAAATGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGt > 1:67334/1‑147 (MQ=255) aaaTGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTaaa < 4:166081/147‑1 (MQ=255) aaaTGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAg > 5:364296/1‑148 (MQ=255) aTGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGgc > 4:199647/1‑148 (MQ=255) aTGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGgc > 4:193257/1‑148 (MQ=255) aaGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACtt < 6:364296/148‑1 (MQ=255) gTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCg < 1:298363/148‑1 (MQ=255) gTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCg < 3:193257/148‑1 (MQ=255) gTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCg < 3:199647/148‑1 (MQ=255) tGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGt < 7:382261/125‑1 (MQ=255) tGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGt > 8:382261/1‑125 (MQ=255) ggTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGAc > 8:282745/1‑147 (MQ=255) gtgtTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTc > 1:71060/1‑103 (MQ=255) gtgtTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTc > 1:64683/1‑103 (MQ=255) gtgtTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTc < 2:64683/103‑1 (MQ=255) gtgtTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTc < 2:71060/103‑1 (MQ=255) tgtTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAACCAAATCTCCGCTGGTGCGAAGAAAGTTGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACaaa < 8:381320/148‑1 (MQ=255) gtTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACaaa > 1:129288/1‑147 (MQ=255) tGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAatat > 7:336948/1‑148 (MQ=255) ttGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTgg < 5:286219/148‑1 (MQ=255) cTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGa > 3:310447/1‑148 (MQ=255) cTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACT‑GTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGa > 4:202551/1‑147 (MQ=255) cTGAAGCAACTGGTCGGGTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTACACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGGGGTTATGCCT‑GTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGa > 4:196184/1‑147 (MQ=255) tGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTaa > 3:410005/1‑114 (MQ=255) tGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTaa < 4:410005/114‑1 (MQ=255) cAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGt > 6:142625/1‑148 (MQ=255) gTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCaa < 4:310447/148‑1 (MQ=255) gTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCa < 7:282745/147‑1 (MQ=255) tCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACa > 3:14749/1‑137 (MQ=255) tCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACa < 4:14749/137‑1 (MQ=255) tgactgacGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTg > 1:364528/1‑148 (MQ=255) gacGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTg > 3:56043/1‑143 (MQ=255) gacGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTg < 4:56043/143‑1 (MQ=255) cGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGcaccac > 7:335581/1‑147 (MQ=255) cGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGcaccac > 7:159627/1‑147 (MQ=255) cGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGcaccac > 7:405437/1‑147 (MQ=255) aaaCTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCaa < 2:129288/148‑1 (MQ=255) aaCTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAAc > 2:155590/1‑148 (MQ=255) tAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCt > 7:185026/1‑148 (MQ=255) acacATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCg > 6:123083/1‑148 (MQ=255) acacATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCg > 6:172939/1‑148 (MQ=255) acacATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCg < 2:364528/148‑1 (MQ=255) caTCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGc < 5:317566/136‑1 (MQ=255) caTCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGc > 6:317566/1‑136 (MQ=255) tCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGc > 7:150130/1‑148 (MQ=255) aCCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCt > 4:218446/1‑147 (MQ=255) ccGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTaa < 8:150130/148‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTaa < 8:185026/148‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTa > 8:114413/1‑147 (MQ=255) gTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTAt < 8:336948/148‑1 (MQ=255) gTGCGAAGAAAGTGGTTATGACT‑GTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTAt < 3:196184/147‑1 (MQ=255) gTGCGAAGAAAGTGGTTATGACT‑GTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTAt < 3:202551/147‑1 (MQ=255) gTGCGAAGAAAGTGGTCATGACTGCTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTGCGTTAAAGGCACTAACTTCGACAAATAAGCTGGCCAGGACCTCGTTCCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTAt < 4:209853/148‑1 (MQ=255) tGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGt > 3:328670/1‑144 (MQ=255) tGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGt < 4:328670/144‑1 (MQ=255) aagaaAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTATCAAc > 3:104509/1‑147 (MQ=255) aagaaAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTATCAACg < 5:123083/148‑1 (MQ=255) aaaGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTATCAACGATa < 4:104509/148‑1 (MQ=255) ttATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACCTCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCgg > 3:346437/1‑148 (MQ=255) aCTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCaa > 7:305538/1‑101 (MQ=255) aCTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCaa < 8:305538/101‑1 (MQ=255) ggTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTATCaa < 2:229330/128‑1 (MQ=255) ggTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTATCaa > 1:229330/1‑128 (MQ=255) ggTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCatcatc > 1:61094/1‑147 (MQ=255) | TGTTACCGCTGAACGTGATCCGGCTAACCTGAAATGGGACGAAGTTGGTGTTGACGTTGTCGCTGAAGCAACTGGTCTGTTCCTGACTGACGAAACTGCTCGTAAACACATCACCGCTGGTGCGAAGAAAGTGGTTATGACTGGTCCGTCTAAAGACAACACTCCGATGTTCGTTAAAGGCGCTAACTTCGACAAATATGCTGGCCAGGACATCGTTTCCAACGCTTCCTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCGCTGGCTAAAGTTATCAACGATAACTTCGGCATCATC > NC_000913/1862989‑1863277 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |