| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 169,716 | Δ2,672 bp | [fhuA]–[fhuB] | [fhuA], fhuC, fhuD, [fhuB] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 169716 | 172387 | 2672 | 115 [0] | [0] 115 | [fhuA]–[fhuB] | [fhuA],fhuC,fhuD,[fhuB] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 169715 | 0 (0.000) | 115 (1.010) | 87/270 | 0.2 | 100% | coding (2232/2244 nt) | fhuA | ferrichrome outer membrane transporter |
| ? | NC_000913 | 172388 = | 0 (0.000) | coding (927/1983 nt) | fhuB | iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGATGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTG > NC_000913/172245‑172532 | atgatctggcgcgagtcggcatggctggctccaacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCa < 5:312832‑M2/5‑1 (MQ=255) tggcgcgagtcggcatggctggctccaacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGtt > 5:63598‑M2/138‑149 (MQ=255) cgcgagtcggcatggctggctccaacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGAt < 5:256348‑M2/15‑1 (MQ=255) gcgagtcggcatggctggctccaacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATc < 8:246318‑M2/16‑1 (MQ=255) agtcggcatggctggctccaacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGt < 1:507593‑M2/19‑1 (MQ=255) ctggctccaacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCgctgc > 6:254764‑M2/120‑148 (MQ=255) tggctccaacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGt > 4:353815‑M2/119‑137 (MQ=255) tggctccaacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGt < 3:353815‑M2/19‑1 (MQ=255) ctccaacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACtg > 2:333070‑M2/116‑149 (MQ=255) tccaacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACtgt > 2:96927‑M2/115‑149 (MQ=255) tccaacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACtgt > 3:445922‑M2/115‑149 (MQ=255) caacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgttcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTgg < 6:351685‑M2/37‑1 (MQ=255) caacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACtgtg < 6:391125‑M2/36‑1 (MQ=255) caacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcctctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACtgt < 5:158805‑M2/35‑1 (MQ=255) aacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGc > 6:38865‑M2/112‑149 (MQ=255) aacgtggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGc > 8:346637‑M2/112‑149 (MQ=255) tggcgctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGtt < 5:330051‑M2/42‑1 (MQ=255) gctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcataacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCcg > 3:348292‑M2/104‑149 (MQ=255) gctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACt > 8:198326‑M2/104‑136 (MQ=255) gctgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACt < 7:198326‑M2/33‑1 (MQ=255) tgcatgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTTACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCcgcg > 7:410472‑M2/102‑149 (MQ=255) atgttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGtt > 5:383945‑M2/99‑148 (MQ=255) ttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACg < 2:88656‑M2/54‑1 (MQ=255) ttaacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACg > 3:416582‑M2/96‑149 (MQ=255) taacaacctgttcgatcgtgaatacgtcgccagctgctttaacacttatggctgcttctggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccg < 8:505000‑M2/1‑1 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ctggggcgcagaacgtcaggttgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAgc < 1:214129‑M2/64‑1 (MQ=255) tggggcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACAtg > 1:274905‑M2/37‑149 (MQ=255) gcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCt < 5:420181‑M2/117‑1 (MQ=255) gcgcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCt > 3:137811‑M2/33‑149 (MQ=255) gcagaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTgg < 5:67695‑M2/119‑1 (MQ=255) agaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCACCGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCg > 6:317214‑M2/29‑149 (MQ=255) agaacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCg > 7:373563‑M2/29‑149 (MQ=255) aacgtcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGtt > 5:141815‑M2/27‑149 (MQ=255) tcaggtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAGCACATGTTggcgttcagc < 4:348292‑M2/127‑5 (MQ=255) gtcgttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTcg > 4:67692‑M2/19‑149 (MQ=255) gttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATCAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCgcgg < 1:96927‑M2/134‑1 (MQ=255) ttgcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGGCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCGGGCGTTTGCCCTCgcggg < 5:369508‑M2/135‑1 (MQ=255) ttgcaaccgcaaccGGTCACTGAGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCgcggg > 8:287046‑M2/15‑149 (MQ=255) gcaaccgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCgcgggcg > 5:154630‑M2/13‑149 (MQ=255) accgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGgcggcg > 7:217966‑M2/10‑149 (MQ=255) cgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCgcggg < 1:450694‑M2/135‑1 (MQ=255) cgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCgcggg > 2:450694‑M2/8‑142 (MQ=255) cgcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGtg < 7:107072‑M2/142‑1 (MQ=255) gcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGtgc < 1:31956‑M2/143‑1 (MQ=255) gcaaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGtgc < 7:287046‑M2/143‑1 (MQ=255) aaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACGTGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGtgctg < 2:205086‑M2/145‑1 (MQ=255) aaccGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGtgctg > 2:310027‑M2/5‑149 (MQ=255) | CCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGATGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCCTCGCGGGCGGCGTGCTG > NC_000913/172245‑172532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |