| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 911,086 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑37/+92) | poxB ← / ← hcr | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding/HCP oxidoreductase, NADH‑dependent |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | 73 (0.740) | 55/286 | 1.1 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 911086 = | 0 (0.000) | intergenic (‑37/+96) | poxB/hcr | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding/HCP oxidoreductase, NADH‑dependent | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | 86 (0.880) | 74/284 | 0.2 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 911090 | 0 (0.000) | intergenic (‑41/+92) | poxB/hcr | pyruvate dehydrogenase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑binding/HCP oxidoreductase, NADH‑dependent | |||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
ATTAAGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATGGGAGAGAAAGGAGGCACTAACGGTTAAATAGCCCGATGAAAGGAATATCATCGGGCATAAGGCGATTATGCGAGAACCAAATCCCCCTGCGGATGGCAGGAGCAGGCCAGTACGTAA > NC_000913/910939‑911233 | atcaaGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGtt < 8:41761/146‑1 (MQ=255)aTTAAGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGtt > 5:115919/1‑149 (MQ=255) tttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTTAGt > 3:172744‑M2/144‑149 (MQ=255) ttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctatt 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ATTAAGACTGTCACTAAGACCGTTCAGAGAGTCGCCTGTGACTCCCCAGATGCGTTTCACCCCTGCCGATTCGAGTGTTTTGGCGATATAAGCTGCAACCGTTTGTTTCATGGTTCTCCATCTCCTGAATGTGATAACGGTAACAAGTTTAGTTCATCTGACGGAGGGGGAAGGGATGGGAGAGAAAGGAGGCACTAACGGTTAAATAGCCCGATGAAAGGAATATCATCGGGCATAAGGCGATTATGCGAGAACCAAATCCCCCTGCGGATGGCAGGAGCAGGCCAGTACGTAA > NC_000913/910939‑911233 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |